MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016915	ATA	2	6	72806	72811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016915	T	6	6	72844	72849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016915	GTA	2	6	72866	72871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016915	GTT	2	6	72907	72912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016915	TTA	2	6	72980	72985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016915	GCC	2	6	72998	73003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_016915	GCT	2	6	73014	73019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016915	CTT	2	6	73510	73515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016915	T	6	6	73576	73581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016915	TGC	2	6	73593	73598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016915	TCC	2	6	73609	73614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_016915	AAG	2	6	73642	73647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016915	AT	3	6	73652	73657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016915	CAAT	2	8	74061	74068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_016915	A	6	6	74075	74080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016915	TGC	2	6	74085	74090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_016915	T	6	6	74108	74113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016915	TGA	2	6	74151	74156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016915	CAAT	2	8	74796	74803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_016915	TTC	2	6	74818	74823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016915	ATT	2	6	74827	74832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016915	TAT	3	9	75689	75697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016915	TAAA	2	8	75739	75746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016915	TAA	2	6	75777	75782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016915	TTTA	2	8	75784	75791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016915	AAAT	2	8	75858	75865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016915	A	6	6	77401	77406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016915	TAAA	2	8	77428	77435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016915	TAA	2	6	77443	77448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016915	T	6	6	77458	77463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016915	A	6	6	77522	77527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016915	ATT	2	6	77536	77541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016915	ATTT	2	8	77549	77556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016915	T	6	6	77579	77584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016915	TAA	2	6	78907	78912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016915	GCT	2	6	83461	83466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016915	TA	4	8	83484	83491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016915	AAAT	2	8	83505	83512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016915	ATACA	2	10	83587	83596	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
540	NC_016915	GTA	2	6	83597	83602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016915	ATA	3	9	83603	83611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016915	AT	4	8	86499	86506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016915	TAA	2	6	86542	86547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016915	T	6	6	86548	86553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016915	A	6	6	86561	86566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016915	TGT	2	6	86614	86619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016915	T	7	7	86638	86644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016915	TA	3	6	86697	86702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016915	AAT	2	6	86709	86714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016915	ATT	2	6	86726	86731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016915	T	6	6	86800	86805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016915	ATA	3	9	86816	86824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016915	TAA	2	6	86865	86870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016915	A	9	9	86876	86884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016915	TAT	2	6	86885	86890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016915	AAG	2	6	86892	86897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016915	ATT	2	6	86940	86945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016915	ATT	3	9	86977	86985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016915	AT	3	6	87044	87049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016915	A	6	6	87129	87134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016915	TATC	2	8	87147	87154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_016915	A	7	7	87158	87164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016915	TA	3	6	87171	87176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016915	AGA	2	6	87182	87187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016915	TTAAA	2	10	87196	87205	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016915	GCT	2	6	87219	87224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_016915	TAGC	2	8	87250	87257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_016915	GAA	2	6	87264	87269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016915	TAA	2	6	87505	87510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016915	CAA	2	6	87512	87517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_016915	ATA	2	6	87587	87592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016915	ATC	2	6	87630	87635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_016915	TTA	2	6	87651	87656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016915	AAT	2	6	87679	87684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016915	CAA	3	9	87698	87706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_016915	GAT	2	6	87746	87751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016915	TAA	2	6	87753	87758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_016915	AAGGAC	2	12	87801	87812	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
580	NC_016915	CAA	2	6	87865	87870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016915	AAC	2	6	87878	87883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_016915	TGC	2	6	88060	88065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_016915	TAA	2	6	88091	88096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016915	TA	3	6	88485	88490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016915	TGT	2	6	88520	88525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016915	ATA	2	6	88581	88586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016915	CAA	2	6	88642	88647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_016915	TGC	2	6	89850	89855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_016915	TCC	2	6	89876	89881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_016915	TTA	2	6	89882	89887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016915	TAA	2	6	89922	89927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016915	TAA	2	6	89932	89937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016915	AGG	2	6	91693	91698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016915	GTC	2	6	91720	91725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016915	AGC	2	6	91732	91737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016915	ATA	2	6	91764	91769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016915	TAT	2	6	91824	91829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016915	TTTTAA	2	12	92574	92585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016915	T	7	7	92605	92611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016915	CAA	2	6	92652	92657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_016915	TAAA	2	8	92664	92671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016915	AGG	2	6	94905	94910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016915	A	6	6	94992	94997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_016915	T	6	6	95072	95077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016915	ATA	2	6	95226	95231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016915	AT	3	6	95238	95243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016915	AT	3	6	95256	95261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016915	AT	3	6	95277	95282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016915	TAAAAA	2	12	95306	95317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016915	A	7	7	95313	95319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016915	AT	3	6	95325	95330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016915	TTTA	2	8	95334	95341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016915	AAAT	2	8	95358	95365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016915	AGA	2	6	95464	95469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016915	ATT	2	6	95479	95484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016915	ACG	2	6	95488	95493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016915	A	8	8	95520	95527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016915	TAA	2	6	95530	95535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016915	AATT	2	8	95581	95588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016915	TAA	2	6	96917	96922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016915	TAA	2	6	96930	96935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016915	TAAA	2	8	96939	96946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016915	TAATA	2	10	97001	97010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016915	A	6	6	97032	97037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016915	TAA	2	6	97051	97056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016915	AT	3	6	97068	97073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016915	TGT	2	6	97076	97081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016915	ATT	2	6	97082	97087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016915	ATT	2	6	97097	97102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016915	AGT	2	6	97105	97110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016915	TTGTA	2	10	97139	97148	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016915	AAT	2	6	97149	97154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016915	ATTA	2	8	97177	97184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016915	T	6	6	97768	97773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016915	TAA	2	6	97798	97803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016915	ATT	2	6	98283	98288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016915	CATTT	2	10	98294	98303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
639	NC_016915	TAT	2	6	98379	98384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016915	AATG	2	8	98386	98393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
641	NC_016915	A	6	6	98409	98414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_016915	AAT	2	6	98431	98436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_016915	AATTA	2	10	98444	98453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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