MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016915	A	6	6	929801	929806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_016915	CTATAA	2	12	929807	929818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6003	NC_016915	A	6	6	929846	929851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_016915	ATT	2	6	929879	929884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_016915	ATT	2	6	929923	929928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016915	AT	3	6	929934	929939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_016915	TTAG	2	8	929942	929949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016915	TTCA	2	8	930032	930039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_016915	TGG	2	6	930074	930079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_016915	CCG	2	6	930097	930102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_016915	T	6	6	930153	930158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_016915	ATTA	2	8	930159	930166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016915	CAT	2	6	930176	930181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_016915	AAG	2	6	930193	930198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_016915	TA	3	6	930199	930204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_016915	AAT	2	6	930205	930210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_016915	TTA	2	6	930222	930227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_016915	AAT	2	6	932792	932797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016915	ATA	2	6	932825	932830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_016915	CTTA	2	8	935483	935490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_016915	TAC	2	6	936029	936034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_016915	TA	4	8	937675	937682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_016915	ACT	2	6	938932	938937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_016915	T	6	6	938943	938948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_016915	AAATA	2	10	938958	938967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_016915	A	6	6	938996	939001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_016915	TAAT	2	8	941183	941190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_016915	TA	3	6	942961	942966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_016915	TA	3	6	942974	942979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016915	AAT	2	6	942980	942985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016915	CAA	2	6	943024	943029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_016915	CCT	2	6	944150	944155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_016915	TTC	2	6	944161	944166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_016915	TAT	2	6	944218	944223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016915	A	6	6	944225	944230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016915	ATT	2	6	945438	945443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016915	CT	3	6	945445	945450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6039	NC_016915	T	7	7	945475	945481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016915	ATTT	2	8	945503	945510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016915	CA	3	6	945550	945555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_016915	TAA	2	6	945612	945617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016915	TAAA	2	8	945699	945706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016915	GTG	2	6	945733	945738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016915	CTG	2	6	945789	945794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_016915	CCT	2	6	945815	945820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6048	NC_016915	TAA	2	6	945888	945893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_016915	CTT	2	6	945896	945901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_016915	ATC	2	6	945907	945912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_016915	AGC	2	6	945925	945930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_016915	ATTT	2	8	945937	945944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016915	TAA	2	6	945960	945965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_016915	TAG	2	6	945967	945972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_016915	TAA	2	6	946740	946745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6059	NC_016915	ATA	2	6	948746	948751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016915	TAT	3	9	948763	948771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_016915	ATA	2	6	949406	949411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_016915	GAT	2	6	949453	949458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6064	NC_016915	T	8	8	949476	949483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016915	A	7	7	949540	949546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_016915	ATC	2	6	949564	949569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6068	NC_016915	TAT	2	6	949648	949653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_016915	TA	4	8	949664	949671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6071	NC_016915	ATT	2	6	951087	951092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_016915	TAA	2	6	951131	951136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016915	TTTATC	2	12	951174	951185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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6078	NC_016915	TA	3	6	951335	951340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_016915	ATA	2	6	951401	951406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6082	NC_016915	AAT	2	6	951970	951975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_016915	TAC	2	6	953266	953271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6099	NC_016915	AAAG	2	8	954685	954692	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6102	NC_016915	AT	4	8	954761	954768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6106	NC_016915	ATAA	2	8	954964	954971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_016915	TA	3	6	956217	956222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016915	ATT	2	6	956254	956259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_016915	AT	3	6	956294	956299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016915	TGC	2	6	956310	956315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_016915	TC	3	6	956316	956321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_016915	A	6	6	956409	956414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016915	TA	3	6	956443	956448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_016915	A	6	6	956462	956467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_016915	ATT	2	6	956561	956566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016915	TAT	2	6	956606	956611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016915	TA	3	6	956621	956626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6129	NC_016915	CTTA	2	8	957024	957031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6130	NC_016915	TACCT	2	10	957067	957076	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6133	NC_016915	TAA	2	6	957223	957228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_016915	AT	3	6	957247	957252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_016915	T	8	8	957281	957288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_016915	T	6	6	957529	957534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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