MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 8132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016915	TTAA	2	8	731164	731171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016915	ATGTTC	2	12	731173	731184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4503	NC_016915	ATT	2	6	731200	731205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_016915	TATT	2	8	731229	731236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016915	ATT	2	6	731303	731308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016915	TAA	2	6	731339	731344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_016915	A	6	6	731360	731365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_016915	A	6	6	731698	731703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_016915	ATA	2	6	731750	731755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_016915	GAA	2	6	731773	731778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_016915	TTC	2	6	731897	731902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_016915	TTA	2	6	731944	731949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_016915	AGC	2	6	731959	731964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_016915	ATA	2	6	731996	732001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016915	ATA	2	6	732006	732011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016915	AAATT	2	10	732065	732074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_016915	AAT	2	6	732082	732087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_016915	ATA	2	6	732150	732155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_016915	A	6	6	732184	732189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_016915	ATG	2	6	732204	732209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016915	TAAT	2	8	732252	732259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_016915	TAG	2	6	732274	732279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4524	NC_016915	TAG	2	6	732347	732352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_016915	A	6	6	732389	732394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_016915	TAA	2	6	732422	732427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016915	ATT	2	6	732508	732513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_016915	ATT	2	6	732548	732553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_016915	AAT	2	6	732557	732562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_016915	TGT	2	6	732908	732913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_016915	TA	3	6	736322	736327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_016915	CTT	2	6	736408	736413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_016915	TTG	2	6	738915	738920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_016915	TAT	2	6	738984	738989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4536	NC_016915	TTA	2	6	740272	740277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_016915	ATT	2	6	740496	740501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_016915	T	6	6	740556	740561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_016915	A	7	7	740562	740568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_016915	TATAAA	2	12	740575	740586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_016915	A	7	7	740584	740590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016915	TAAA	2	8	740625	740632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_016915	AGT	2	6	740634	740639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_016915	ATA	2	6	740742	740747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_016915	AAT	2	6	740757	740762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_016915	TAATTT	2	12	740773	740784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_016915	ATTT	3	12	740788	740799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_016915	CAA	2	6	740834	740839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_016915	AATCAT	2	12	740877	740888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4550	NC_016915	TAA	2	6	740893	740898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016915	ACAATA	2	12	742463	742474	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4553	NC_016915	ATA	2	6	745753	745758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016915	ATT	2	6	745891	745896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_016915	TTG	2	6	748143	748148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_016915	GAA	2	6	748175	748180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_016915	TAT	2	6	748235	748240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_016915	AAC	2	6	748294	748299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_016915	A	7	7	748302	748308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_016915	A	7	7	748310	748316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4562	NC_016915	TAA	3	9	751788	751796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_016915	CACTT	2	10	751801	751810	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4564	NC_016915	TA	3	6	751849	751854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_016915	AATTT	2	10	751876	751885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_016915	T	6	6	751883	751888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_016915	ATTTAT	2	12	751994	752005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4571	NC_016915	GAA	2	6	752155	752160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016915	TAA	3	9	752170	752178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016915	TAT	2	6	752207	752212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4581	NC_016915	ATTT	2	8	752732	752739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016915	TAAT	2	8	752751	752758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_016915	TGT	2	6	752759	752764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016915	TA	3	6	752782	752787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4588	NC_016915	GTA	2	6	753386	753391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4592	NC_016915	TAT	2	6	753525	753530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4597	NC_016915	TA	3	6	753583	753588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_016915	AATA	2	8	753596	753603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_016915	TAT	2	6	753637	753642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_016915	TAG	2	6	753725	753730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_016915	TAT	2	6	753765	753770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_016915	TAA	3	9	753794	753802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_016915	TTCCA	2	10	753831	753840	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4604	NC_016915	AAT	2	6	753852	753857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_016915	TC	3	6	753891	753896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_016915	TGC	2	6	753903	753908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4608	NC_016915	TTA	2	6	753959	753964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_016915	TAT	2	6	753990	753995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_016915	ATT	2	6	754014	754019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016915	AGCA	2	8	754039	754046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_016915	TAA	2	6	754093	754098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_016915	TTA	2	6	754270	754275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_016915	T	6	6	754288	754293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_016915	ATC	2	6	754364	754369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4617	NC_016915	T	7	7	754424	754430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_016915	TAT	2	6	754440	754445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016915	TTA	2	6	754455	754460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_016915	TA	3	6	754467	754472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_016915	T	9	9	754499	754507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_016915	CCAAA	2	10	754536	754545	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4623	NC_016915	CCTGT	2	10	754690	754699	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4624	NC_016915	TCT	2	6	754736	754741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_016915	ATT	2	6	754766	754771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_016915	TCA	2	6	754837	754842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_016915	TAA	2	6	754854	754859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_016915	ATCTT	2	10	754864	754873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4629	NC_016915	ATT	2	6	754888	754893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4634	NC_016915	GATA	2	8	755087	755094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_016915	T	6	6	755186	755191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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