MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016914	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016914	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016914	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016914	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016914	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016914	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016914	TTAA	2	8	12374	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016914	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016914	TTGC	2	8	16332	16339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016914	AGTA	2	8	19812	19819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016914	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016914	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016914	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016914	ACTA	2	8	25955	25962	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016914	TAAA	2	8	28666	28673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016914	AGGA	2	8	28724	28731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016914	TAAA	2	8	28756	28763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016914	GCTA	2	8	28766	28773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016914	TAAT	2	8	30013	30020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016914	ATAA	2	8	38747	38754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016914	AACA	2	8	38844	38851	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016914	TAAA	2	8	39946	39953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016914	CTTG	2	8	40788	40795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016914	CTGA	2	8	40796	40803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016914	ATTG	2	8	40974	40981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016914	ATTA	2	8	41401	41408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016914	ATTA	2	8	41458	41465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016914	TGCT	3	12	41581	41592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016914	GCTT	2	8	41708	41715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016914	TTTA	2	8	41748	41755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016914	ATTA	2	8	42189	42196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016914	TAAT	2	8	42482	42489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016914	ATTA	2	8	42552	42559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016914	AAAT	2	8	42655	42662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016914	TACC	2	8	44735	44742	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016914	AAAC	2	8	44743	44750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016914	TAAT	2	8	44819	44826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016914	ATTT	2	8	44846	44853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016914	ATTA	2	8	44854	44861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016914	AAAT	2	8	44873	44880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016914	ATGA	2	8	45076	45083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016914	AGTA	2	8	48964	48971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016914	ATAC	2	8	49182	49189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016914	AAGT	2	8	49733	49740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016914	ATCT	2	8	50779	50786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016914	TTTA	2	8	51362	51369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016914	ACTC	2	8	51473	51480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016914	TAAA	2	8	51511	51518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016914	ATTA	2	8	52626	52633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016914	TAAA	2	8	56061	56068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016914	ATCT	2	8	57266	57273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016914	AACG	2	8	58646	58653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016914	GTTA	2	8	59018	59025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016914	TTAA	2	8	59248	59255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016914	ACAA	2	8	60908	60915	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016914	TAAA	2	8	62395	62402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016914	ATTT	2	8	62416	62423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016914	ATTT	2	8	64412	64419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016914	TTAA	2	8	65959	65966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016914	TAGT	2	8	66447	66454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016914	ATAA	2	8	68497	68504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016914	AAGT	2	8	72445	72452	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016914	CAAT	2	8	74780	74787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016914	TAAA	2	8	75723	75730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016914	TTTA	2	8	75768	75775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016914	AAAT	2	8	75842	75849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016914	TAAA	2	8	77413	77420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016914	ATGA	2	8	77477	77484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016914	ATTT	2	8	77534	77541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016914	AAAT	2	8	83484	83491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016914	TATC	2	8	87131	87138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016914	TAGC	2	8	87234	87241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016914	TAAA	2	8	92641	92648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016914	TTTA	2	8	95310	95317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016914	AAAT	2	8	95334	95341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016914	AATT	2	8	95557	95564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016914	TAAA	2	8	96915	96922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016914	ATTA	2	8	97152	97159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016914	AATG	2	8	98361	98368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016914	TCCA	2	8	100191	100198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016914	AAGC	2	8	100286	100293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016914	ATGT	2	8	102341	102348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016914	AAAG	2	8	107114	107121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016914	ATTT	2	8	107265	107272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016914	TTTA	2	8	107306	107313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016914	ATTC	2	8	113149	113156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016914	ATTA	2	8	113230	113237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016914	GAAA	2	8	113351	113358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016914	ACTC	2	8	117289	117296	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016914	CAAA	2	8	117311	117318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016914	CTAT	2	8	117382	117389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016914	AAGT	2	8	120639	120646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016914	CTAC	2	8	122455	122462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016914	CGCT	2	8	125159	125166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016914	TCAC	2	8	125188	125195	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016914	GCAG	2	8	125208	125215	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016914	ACGT	2	8	128276	128283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016914	ATTC	2	8	129660	129667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016914	TAAT	2	8	129681	129688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016914	TTTA	2	8	129854	129861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016914	AATT	2	8	131500	131507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016914	TTTG	2	8	132333	132340	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016914	AAAC	2	8	151587	151594	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016914	TGAT	2	8	151782	151789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016914	ATTA	2	8	152050	152057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016914	CGAT	2	8	152290	152297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016914	TAAT	2	8	152425	152432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016914	TAGA	2	8	152823	152830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016914	ATTT	2	8	153070	153077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016914	ATAA	2	8	153258	153265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016914	TTGC	2	8	153961	153968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016914	GGTG	2	8	154782	154789	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016914	ATAA	2	8	154792	154799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016914	TCTA	2	8	167511	167518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016914	TTTA	2	8	167521	167528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016914	TTTA	2	8	170102	170109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016914	TCAT	2	8	172955	172962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016914	TAAT	2	8	176997	177004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016914	ATTA	2	8	178146	178153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016914	TTAA	2	8	180305	180312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016914	TCAA	2	8	180876	180883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016914	ATAA	2	8	181456	181463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016914	TCAG	2	8	181682	181689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016914	ATAA	2	8	191903	191910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016914	TTAC	2	8	193555	193562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016914	AGTA	2	8	201195	201202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016914	CTTT	2	8	206355	206362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016914	TTTA	2	8	207486	207493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016914	TATT	2	8	210484	210491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016914	TGAT	2	8	210560	210567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016914	TATT	2	8	211165	211172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016914	CTAA	2	8	215196	215203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016914	TAAT	2	8	215216	215223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016914	AGCA	2	8	215255	215262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016914	ATTT	2	8	217206	217213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016914	ATTT	2	8	217952	217959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016914	TAAA	2	8	219106	219113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016914	TTAA	2	8	228952	228959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016914	AAGT	2	8	229067	229074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016914	AATG	2	8	229266	229273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016914	TTCA	2	8	229921	229928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016914	AGCT	2	8	230057	230064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016914	ATTT	2	8	230213	230220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016914	ATCC	2	8	230804	230811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016914	TTTC	2	8	230884	230891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016914	TTTA	2	8	231106	231113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016914	TTTC	2	8	234001	234008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016914	TTAG	2	8	234427	234434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016914	TACT	2	8	235647	235654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016914	CTTT	2	8	236428	236435	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016914	ATTT	2	8	237774	237781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016914	TAAA	2	8	245341	245348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016914	ATAC	2	8	250254	250261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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484	NC_016914	TAAA	2	8	716946	716953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_016914	AATT	2	8	720354	720361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_016914	AAAT	2	8	732568	732575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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