MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 7994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016914	TAA	2	6	699634	699639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016914	CTT	2	6	699661	699666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016914	TAA	2	6	699677	699682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016914	A	9	9	699705	699713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016914	TCA	2	6	699751	699756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_016914	ATTA	2	8	699771	699778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016914	T	6	6	699804	699809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016914	TTA	2	6	700010	700015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016914	AGT	2	6	700206	700211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016914	ATTA	2	8	700216	700223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016914	TTG	2	6	701814	701819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016914	AAT	2	6	701853	701858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016914	A	6	6	701913	701918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016914	GCAA	2	8	703633	703640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4015	NC_016914	ATTTT	2	10	704761	704770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016914	ATA	2	6	704773	704778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016914	AAC	2	6	704789	704794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016914	TTAA	2	8	704801	704808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016914	GGA	2	6	704838	704843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016914	A	7	7	704908	704914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016914	GGA	2	6	704944	704949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016914	AATA	2	8	705038	705045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016914	A	6	6	706935	706940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016914	T	7	7	706956	706962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016914	ATT	2	6	706963	706968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016914	T	6	6	706967	706972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016914	AAT	2	6	708357	708362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016914	ATT	2	6	708389	708394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016914	AAT	2	6	708444	708449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016914	TTTG	2	8	708724	708731	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016914	ATA	2	6	708736	708741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016914	A	6	6	708744	708749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016914	AGC	2	6	708757	708762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_016914	ATT	2	6	708769	708774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016914	TCT	2	6	708797	708802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_016914	TCT	2	6	709003	709008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_016914	ATT	2	6	709047	709052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016914	CTTT	2	8	709090	709097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_016914	AAT	2	6	709125	709130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016914	T	6	6	709137	709142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016914	CTT	2	6	709212	709217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_016914	T	6	6	709216	709221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016914	TCT	2	6	709227	709232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_016914	AGAAA	2	10	709244	709253	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016914	TAT	2	6	709290	709295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016914	TG	3	6	710109	710114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016914	GCT	2	6	710202	710207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_016914	CAA	2	6	711545	711550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_016914	AACC	2	8	713096	713103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_016914	TA	3	6	713157	713162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016914	ATTAT	2	10	713163	713172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016914	TAA	2	6	713174	713179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016914	A	6	6	713178	713183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016914	TAG	2	6	713225	713230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016914	GA	3	6	713245	713250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016914	GTT	2	6	713290	713295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016914	A	6	6	713305	713310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016914	CTAG	2	8	713328	713335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_016914	TCA	2	6	713360	713365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_016914	ATT	2	6	713411	713416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016914	CAA	2	6	713474	713479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_016914	T	6	6	713715	713720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016914	T	7	7	713805	713811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016914	TAT	2	6	713855	713860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016914	TGC	2	6	713906	713911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_016914	ATT	2	6	714032	714037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016914	CTTT	2	8	714048	714055	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_016914	TAG	2	6	714061	714066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016914	GAG	2	6	714102	714107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016914	AAT	2	6	714117	714122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016914	T	7	7	714129	714135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016914	CCCAT	2	10	714170	714179	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4073	NC_016914	GAT	2	6	714208	714213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_016914	ACT	2	6	714240	714245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_016914	CTA	2	6	714262	714267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_016914	TTA	2	6	714325	714330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016914	TCT	2	6	714389	714394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_016914	TAT	2	6	714418	714423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016914	CTT	2	6	714460	714465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_016914	AGC	2	6	714494	714499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_016914	AAT	2	6	714521	714526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016914	T	6	6	714526	714531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016914	AATT	2	8	714543	714550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016914	TGA	2	6	714563	714568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016914	ATACCG	2	12	714581	714592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_016914	CAA	2	6	714627	714632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_016914	TTC	2	6	714643	714648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_016914	ATT	2	6	714652	714657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016914	CTT	2	6	714715	714720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_016914	GAAA	2	8	714769	714776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_016914	ATTA	2	8	714875	714882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016914	TTC	2	6	714883	714888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_016914	CTT	2	6	714913	714918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_016914	CTTT	2	8	714964	714971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_016914	T	6	6	714969	714974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016914	TAAA	2	8	714988	714995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016914	A	7	7	715001	715007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016914	T	7	7	715044	715050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016914	AAT	2	6	715051	715056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016914	T	7	7	715063	715069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016914	TAT	2	6	715095	715100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016914	GTA	2	6	715189	715194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016914	TAA	2	6	715199	715204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016914	ATA	2	6	715432	715437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016914	T	7	7	715454	715460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016914	ATT	2	6	715461	715466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016914	T	6	6	715600	715605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016914	T	6	6	715623	715628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016914	GAC	2	6	715637	715642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_016914	TA	3	6	715663	715668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016914	AT	3	6	715670	715675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016914	CTT	2	6	715684	715689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_016914	ATT	2	6	715706	715711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016914	ATTG	2	8	715729	715736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016914	ATA	2	6	715737	715742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016914	TGA	2	6	715766	715771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016914	AAT	2	6	715786	715791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016914	TTA	2	6	715801	715806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016914	ATT	2	6	715833	715838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016914	TA	3	6	715894	715899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016914	TCC	2	6	715961	715966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_016914	ATA	2	6	715978	715983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016914	TA	3	6	716179	716184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016914	A	6	6	716278	716283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016914	AT	3	6	716459	716464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016914	T	6	6	716481	716486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016914	ATA	2	6	716545	716550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016914	ATT	2	6	716551	716556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016914	AGA	2	6	716569	716574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016914	AAT	2	6	716855	716860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016914	TAC	2	6	716879	716884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_016914	TAAA	2	8	716946	716953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_016914	AAT	2	6	716989	716994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_016914	TTA	2	6	717053	717058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_016914	TGAAA	2	10	717070	717079	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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