MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 7994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3005	NC_016914	TAT	2	6	534448	534453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3011	NC_016914	ATT	2	6	536381	536386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_016914	GATA	2	8	536401	536408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016914	T	7	7	536420	536426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016914	ATTTT	2	10	536435	536444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016914	CAAT	2	8	537490	537497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_016914	TAA	2	6	537502	537507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_016914	AAT	2	6	537523	537528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_016914	TAA	2	6	537534	537539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016914	AAT	2	6	537541	537546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016914	GTG	2	6	537582	537587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_016914	T	6	6	538351	538356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_016914	AATA	2	8	538390	538397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3034	NC_016914	ATGTC	2	10	543847	543856	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3069	NC_016914	TAT	2	6	551331	551336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_016914	GTAAT	2	10	552767	552776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_016914	TTTG	2	8	553050	553057	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016914	TA	3	6	553058	553063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_016914	TATTAA	2	12	554621	554632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3103	NC_016914	T	6	6	554638	554643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3106	NC_016914	GTA	2	6	554721	554726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_016914	CGTAG	2	10	555335	555344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3113	NC_016914	T	6	6	555856	555861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016914	AATT	2	8	555864	555871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3116	NC_016914	T	6	6	557397	557402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_016914	AAT	2	6	559914	559919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016914	TTAA	2	8	559920	559927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016914	TAT	2	6	559967	559972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3131	NC_016914	TTA	2	6	560953	560958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_016914	ATG	2	6	561377	561382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_016914	ATT	2	6	561613	561618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_016914	TAAA	2	8	563792	563799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_016914	GTA	2	6	563802	563807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_016914	ATATTA	2	12	563869	563880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_016914	CTT	2	6	563918	563923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3139	NC_016914	GCA	2	6	564323	564328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3141	NC_016914	ATAA	2	8	564405	564412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3271	NC_016914	TAC	2	6	586769	586774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3412	NC_016914	T	6	6	610867	610872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3413	NC_016914	ATA	2	6	610909	610914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_016914	ATT	2	6	610930	610935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3415	NC_016914	ATA	2	6	610949	610954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3417	NC_016914	TAA	2	6	611156	611161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3452	NC_016914	TCAA	2	8	620238	620245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3453	NC_016914	TAT	3	9	620290	620298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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