MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 7994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016914	TCAG	2	8	181682	181689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_016914	A	6	6	185844	185849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016914	T	6	6	185854	185859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016914	GAG	2	6	185966	185971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016914	TA	3	6	186045	186050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016914	GTC	2	6	190229	190234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_016914	A	6	6	190339	190344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016914	ATT	2	6	191784	191789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016914	A	6	6	191822	191827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016914	ATAA	2	8	191903	191910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016914	ATA	2	6	191929	191934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016914	GTC	2	6	193488	193493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016914	AGC	2	6	193500	193505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_016914	TTAC	2	8	193555	193562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_016914	ATG	2	6	193577	193582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016914	A	6	6	193584	193589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016914	AT	5	10	194497	194506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016914	AAGAG	2	10	194535	194544	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016914	TA	3	6	195040	195045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016914	TAA	2	6	195060	195065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016914	TGT	2	6	196896	196901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016914	ATG	2	6	196907	196912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016914	A	7	7	197009	197015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016914	TAA	2	6	197059	197064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016914	CAA	2	6	197155	197160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016914	GTT	2	6	199318	199323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016914	TCA	2	6	199340	199345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_016914	T	7	7	199406	199412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016914	ATT	2	6	199413	199418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016914	T	6	6	199417	199422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016914	ATG	2	6	199455	199460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016914	A	6	6	199610	199615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016914	ATA	2	6	200399	200404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016914	T	6	6	200426	200431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016914	TAA	2	6	201183	201188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016914	AGTA	2	8	201195	201202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016914	TTA	2	6	201286	201291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016914	ACG	2	6	201293	201298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_016914	T	6	6	201354	201359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016914	TAA	2	6	201369	201374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016914	A	6	6	201405	201410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016914	GCA	2	6	201422	201427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016914	A	6	6	201427	201432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016914	AAT	2	6	202635	202640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016914	TTG	2	6	202687	202692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016914	GTA	2	6	202728	202733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016914	CAA	2	6	202817	202822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_016914	GCT	2	6	202831	202836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_016914	TTA	2	6	206134	206139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016914	GTC	2	6	206202	206207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016914	TTTAT	2	10	206282	206291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016914	A	6	6	206298	206303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016914	T	6	6	206316	206321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016914	TTA	2	6	206333	206338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016914	ACC	2	6	206344	206349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_016914	CTTT	2	8	206355	206362	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_016914	T	7	7	206360	206366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016914	T	6	6	206368	206373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016914	AT	3	6	206382	206387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016914	TTG	2	6	206653	206658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016914	TTG	2	6	206709	206714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016914	CTG	2	6	206730	206735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_016914	ATT	2	6	206776	206781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016914	T	6	6	206786	206791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016914	CAA	2	6	206854	206859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_016914	CAA	2	6	206892	206897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_016914	TTTA	2	8	207486	207493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016914	AT	3	6	207497	207502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016914	A	6	6	207626	207631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016914	T	6	6	207647	207652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016914	ATT	2	6	207653	207658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016914	GCT	2	6	207685	207690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_016914	CAA	2	6	207715	207720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_016914	ACA	2	6	207750	207755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_016914	AATTA	2	10	210389	210398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016914	TAAAT	2	10	210406	210415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016914	TAA	2	6	210421	210426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016914	AT	3	6	210432	210437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016914	TAAAA	2	10	210441	210450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016914	A	6	6	210447	210452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016914	TATT	2	8	210484	210491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016914	ATA	2	6	210512	210517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016914	TATTTA	2	12	210532	210543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016914	ATA	2	6	210548	210553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016914	TGAT	2	8	210560	210567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016914	TTA	2	6	210568	210573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016914	ATT	2	6	210835	210840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016914	AAG	2	6	210862	210867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016914	TA	3	6	210903	210908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016914	TA	3	6	210917	210922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016914	T	6	6	210926	210931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016914	CAA	2	6	210934	210939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_016914	A	6	6	210975	210980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016914	GTTTT	2	10	210985	210994	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016914	GTT	2	6	211042	211047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016914	TAA	2	6	211126	211131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016914	TGC	2	6	211148	211153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_016914	TATT	2	8	211165	211172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016914	ATG	2	6	211412	211417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016914	A	6	6	211423	211428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016914	TAA	2	6	212052	212057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016914	TTA	2	6	212089	212094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016914	TTG	3	9	212108	212116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016914	T	6	6	212128	212133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016914	TC	4	8	212143	212150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_016914	TAT	2	6	212192	212197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016914	T	6	6	212218	212223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016914	T	6	6	212272	212277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016914	ATA	2	6	212334	212339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016914	T	7	7	212361	212367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016914	ATT	2	6	212416	212421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016914	AGA	2	6	212473	212478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016914	ATTAT	2	10	212564	212573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016914	CGA	2	6	212617	212622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_016914	A	6	6	212648	212653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016914	CTT	2	6	215041	215046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_016914	ATTTA	2	10	215051	215060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016914	ATA	2	6	215112	215117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016914	AAT	2	6	215179	215184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016914	CTAA	2	8	215196	215203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_016914	TAAT	2	8	215216	215223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016914	TAG	2	6	215235	215240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016914	ATA	2	6	215241	215246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016914	AGCA	2	8	215255	215262	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_016914	TAA	2	6	216366	216371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016914	ATT	2	6	216372	216377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016914	TCG	2	6	216412	216417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_016914	A	8	8	216479	216486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016914	AAATT	2	10	216601	216610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016914	TTTCT	2	10	216616	216625	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_016914	TAT	2	6	217129	217134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016914	TTC	2	6	217200	217205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_016914	ATTT	2	8	217206	217213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016914	ATTT	2	8	217952	217959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016914	T	7	7	217957	217963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016914	T	6	6	219066	219071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016914	A	6	6	219074	219079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_016914	GTCAA	2	10	219081	219090	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1139	NC_016914	TAT	2	6	219100	219105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_016914	AATTA	2	10	219171	219180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_016914	TAT	2	6	222101	222106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_016914	TAA	2	6	244832	244837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_016914	GGA	2	6	244930	244935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_016914	TAT	2	6	248511	248516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1416	NC_016914	TTA	2	6	261422	261427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_016914	ATA	2	6	261431	261436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_016914	GCT	2	6	261605	261610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_016914	TAG	2	6	261729	261734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_016914	TAG	2	6	261777	261782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_016914	GCC	2	6	261784	261789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1424	NC_016914	ATT	2	6	261799	261804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1430	NC_016914	GAC	2	6	262268	262273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_016914	TAA	2	6	262403	262408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_016914	TAA	2	6	262541	262546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_016914	TAA	2	6	262570	262575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_016914	TTA	2	6	262579	262584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_016914	ATT	2	6	262638	262643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_016914	CTTA	2	8	262644	262651	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1445	NC_016914	TGC	2	6	262662	262667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_016914	TAG	2	6	263404	263409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_016914	AAT	2	6	263997	264002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_016914	ATTAG	2	10	264032	264041	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1456	NC_016914	ATT	2	6	264172	264177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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