MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 7994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016914	TAAA	2	8	75723	75730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016914	TAA	2	6	75761	75766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016914	TTTA	2	8	75768	75775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016914	AAAT	2	8	75842	75849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016914	A	8	8	77385	77392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016914	TAAA	2	8	77413	77420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016914	TAA	2	6	77428	77433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016914	T	6	6	77443	77448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016914	ATGA	2	8	77477	77484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016914	A	6	6	77507	77512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016914	ATT	2	6	77521	77526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016914	ATTT	2	8	77534	77541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016914	T	7	7	77564	77570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016914	TAA	2	6	78893	78898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016914	GCT	2	6	83447	83452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_016914	TA	4	8	83463	83470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016914	AAAT	2	8	83484	83491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016914	ATACA	2	10	83566	83575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
519	NC_016914	GTA	2	6	83576	83581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016914	ATA	3	9	83582	83590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016914	AT	4	8	86478	86485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016914	TAA	2	6	86521	86526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016914	T	6	6	86527	86532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016914	A	6	6	86540	86545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016914	TGT	2	6	86593	86598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016914	T	7	7	86616	86622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016914	TA	3	6	86675	86680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016914	AAT	2	6	86687	86692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016914	ATT	2	6	86704	86709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016914	ATATAA	2	12	86768	86779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016914	AT	3	6	87028	87033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016914	A	6	6	87113	87118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016914	TATC	2	8	87131	87138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_016914	A	7	7	87142	87148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016914	TA	3	6	87155	87160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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539	NC_016914	TAGC	2	8	87234	87241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_016914	GAA	2	6	87248	87253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016914	TAA	2	6	87489	87494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016914	CAA	2	6	87496	87501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016914	ATA	2	6	87571	87576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016914	ATC	2	6	87614	87619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016914	TTA	2	6	87635	87640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016914	AAT	2	6	87663	87668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016914	CAA	3	9	87682	87690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016914	GAT	2	6	87730	87735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016914	TAA	2	6	87737	87742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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551	NC_016914	AAGGAC	2	12	87785	87796	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
552	NC_016914	CAA	2	6	87849	87854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016914	TGC	2	6	88037	88042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016914	TAA	2	6	88068	88073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016914	TA	3	6	88462	88467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016914	TGT	2	6	88497	88502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016914	ATA	2	6	88558	88563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016914	CAA	2	6	88619	88624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016914	TGC	2	6	89827	89832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_016914	TCC	2	6	89853	89858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_016914	TTA	2	6	89859	89864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016914	TAA	2	6	89899	89904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016914	TAA	2	6	89909	89914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016914	AGG	2	6	91670	91675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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567	NC_016914	ATA	2	6	91741	91746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016914	TAT	2	6	91801	91806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016914	TTTTAA	2	12	92551	92562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_016914	AGG	2	6	94882	94887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016914	A	6	6	94969	94974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_016914	AT	3	6	95233	95238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016914	AT	3	6	95254	95259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016914	TAAAAA	2	12	95283	95294	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016914	AT	3	6	95301	95306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016914	TTTA	2	8	95310	95317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016914	AAAT	2	8	95334	95341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_016914	TAA	2	6	95506	95511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_016914	TAA	2	6	96906	96911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016914	TAAA	2	8	96915	96922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016914	TAA	2	6	96953	96958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016914	TAATA	2	10	96976	96985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_016914	TTGTA	2	10	97114	97123	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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606	NC_016914	ATT	2	6	98258	98263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016914	CATTT	2	10	98269	98278	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
608	NC_016914	TAT	2	6	98354	98359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016914	AATG	2	8	98361	98368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016914	A	6	6	98384	98389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016914	AAT	2	6	98406	98411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016914	AATTA	2	10	98419	98428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016914	T	7	7	100138	100144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016914	TCCA	2	8	100191	100198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_016914	AAT	2	6	100274	100279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016914	AAGC	2	8	100286	100293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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618	NC_016914	ATGT	2	8	102341	102348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016914	TAT	2	6	102352	102357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016914	A	8	8	102398	102405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016914	A	7	7	102407	102413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016914	TAT	3	9	103245	103253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016914	TA	3	6	103268	103273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016914	ATT	2	6	103345	103350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016914	TAC	2	6	105721	105726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_016914	AAG	2	6	105753	105758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016914	T	6	6	105987	105992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016914	AAT	2	6	106061	106066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016914	CTA	2	6	106071	106076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016914	TAG	2	6	106134	106139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_016914	TAT	2	6	106226	106231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016914	TAT	2	6	106234	106239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016914	TTTAT	2	10	106241	106250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016914	ATA	2	6	106266	106271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016914	ATT	2	6	106311	106316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016914	TTA	2	6	106317	106322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_016914	GTT	2	6	106683	106688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016914	AAC	2	6	106796	106801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_016914	AT	4	8	106858	106865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_016914	AAT	2	6	106897	106902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_016914	A	6	6	106935	106940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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914	NC_016914	AT	4	8	165460	165467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
915	NC_016914	ATA	2	6	165487	165492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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918	NC_016914	TTTA	2	8	167521	167528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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921	NC_016914	A	6	6	169126	169131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
922	NC_016914	T	6	6	169136	169141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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