MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 7994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_016914	ATC	2	6	1003542	1003547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_016914	TTA	2	6	1003577	1003582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_016914	TCA	2	6	1004707	1004712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_016914	GTC	2	6	1004718	1004723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_016914	TTA	2	6	1004772	1004777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_016914	CA	3	6	1004792	1004797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_016914	A	6	6	1004820	1004825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_016914	CA	3	6	1004833	1004838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_016914	A	6	6	1004864	1004869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_016914	TAA	2	6	1006801	1006806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_016914	TAA	2	6	1006986	1006991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_016914	A	7	7	1008907	1008913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_016914	ATT	2	6	1008944	1008949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_016914	T	6	6	1010261	1010266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_016914	ACT	2	6	1010267	1010272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_016914	AAC	2	6	1010273	1010278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_016914	A	6	6	1010346	1010351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_016914	T	6	6	1010448	1010453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_016914	TAT	2	6	1010471	1010476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_016914	AT	3	6	1010532	1010537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_016914	GAT	2	6	1012276	1012281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_016914	ATT	2	6	1012304	1012309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_016914	ATT	2	6	1012404	1012409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_016914	AT	4	8	1012413	1012420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_016914	CAG	2	6	1012424	1012429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6529	NC_016914	ATA	2	6	1012549	1012554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_016914	T	6	6	1012602	1012607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_016914	T	6	6	1012693	1012698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_016914	TCATA	2	10	1012710	1012719	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6533	NC_016914	TAA	2	6	1012729	1012734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_016914	ATT	2	6	1012762	1012767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6538	NC_016914	ATA	2	6	1012915	1012920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_016914	TA	3	6	1012919	1012924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6541	NC_016914	TTGA	2	8	1012954	1012961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_016914	CAT	2	6	1012972	1012977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6544	NC_016914	TCT	2	6	1012997	1013002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6547	NC_016914	AATTTA	2	12	1013209	1013220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_016914	T	6	6	1013256	1013261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_016914	TA	3	6	1013266	1013271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6551	NC_016914	TAA	2	6	1013297	1013302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_016914	TA	3	6	1013322	1013327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_016914	AT	3	6	1013331	1013336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_016914	T	6	6	1013351	1013356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_016914	TAAT	2	8	1013358	1013365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_016914	TATT	2	8	1013477	1013484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_016914	T	6	6	1013492	1013497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6561	NC_016914	ATT	2	6	1013641	1013646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_016914	TTA	2	6	1013850	1013855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6564	NC_016914	T	6	6	1013882	1013887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6572	NC_016914	TATT	2	8	1014281	1014288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_016914	TTA	2	6	1014391	1014396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6590	NC_016914	T	7	7	1019959	1019965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6603	NC_016914	TTCTT	2	10	1021988	1021997	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6627	NC_016914	AT	3	6	1023878	1023883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_016914	AAAT	2	8	1023896	1023903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_016914	T	7	7	1024405	1024411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6632	NC_016914	T	6	6	1028074	1028079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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