MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 7994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016914	ATT	2	6	809364	809369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016914	ATT	2	6	809439	809444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016914	GTT	2	6	809455	809460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016914	CA	3	6	809471	809476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5005	NC_016914	T	6	6	809531	809536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016914	AGT	2	6	809557	809562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_016914	TCT	2	6	809611	809616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_016914	TCT	2	6	809620	809625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_016914	ATA	2	6	809640	809645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_016914	TA	4	8	809664	809671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016914	T	6	6	809691	809696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016914	TAT	2	6	809713	809718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016914	TTAA	2	8	809770	809777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016914	ATA	2	6	809794	809799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016914	A	7	7	809816	809822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016914	T	6	6	812123	812128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016914	TA	3	6	812131	812136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016914	TA	3	6	812207	812212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016914	AAC	2	6	812213	812218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_016914	ACC	2	6	812284	812289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_016914	AATT	2	8	812321	812328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016914	A	6	6	812348	812353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016914	CAA	2	6	812379	812384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_016914	GTT	2	6	812458	812463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016914	ATA	2	6	812469	812474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016914	TTAT	2	8	812475	812482	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5031	NC_016914	TTG	2	6	812610	812615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5033	NC_016914	ATT	2	6	812715	812720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016914	TTAT	2	8	814420	814427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016914	A	6	6	814526	814531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_016914	CAA	2	6	814631	814636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5041	NC_016914	T	6	6	816823	816828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016914	ATT	2	6	816856	816861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016914	AT	3	6	816864	816869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016914	TAC	2	6	816947	816952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5049	NC_016914	ATT	2	6	817146	817151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016914	TAA	2	6	817161	817166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016914	ATTTT	2	10	817169	817178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016914	T	6	6	817175	817180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5054	NC_016914	TCAA	2	8	817265	817272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_016914	A	7	7	817293	817299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_016914	A	9	9	817306	817314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5059	NC_016914	AT	4	8	817427	817434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016914	AT	3	6	818873	818878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016914	AAT	2	6	818901	818906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_016914	TAA	2	6	818927	818932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016914	ATA	2	6	818987	818992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016914	TGA	2	6	819044	819049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_016914	A	7	7	821500	821506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016914	T	6	6	821511	821516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_016914	TA	3	6	823107	823112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_016914	T	6	6	823520	823525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5084	NC_016914	ATTAT	2	10	823905	823914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016914	T	6	6	823957	823962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_016914	ATT	2	6	825402	825407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5102	NC_016914	TA	3	6	825788	825793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016914	T	6	6	825794	825799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016914	CT	4	8	825829	825836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_016914	TTA	2	6	825843	825848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_016914	T	7	7	826231	826237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5119	NC_016914	T	7	7	826437	826443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_016914	GCTT	2	8	827887	827894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5135	NC_016914	AGC	2	6	827917	827922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_016914	GAA	2	6	828325	828330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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