MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016913	GATA	2	8	27	34	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016913	GATA	2	8	243	250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016913	GATA	2	8	459	466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016913	TTAC	2	8	742	749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016913	TTAT	2	8	1076	1083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016913	TAAA	2	8	1889	1896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016913	ACTT	2	8	2226	2233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016913	TTAA	2	8	2335	2342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016913	CCAA	2	8	3625	3632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016913	AAGT	2	8	3732	3739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016913	TTAA	2	8	3780	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016913	ACTT	2	8	3926	3933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016913	TAAA	2	8	3964	3971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016913	TACT	2	8	7276	7283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016913	ATAA	2	8	7884	7891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016913	TAGT	2	8	8711	8718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016913	TAAT	2	8	11625	11632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016913	ATAG	2	8	11982	11989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016913	ATTT	2	8	12060	12067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016913	TTAT	2	8	12116	12123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016913	ATTA	2	8	12149	12156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016913	GTAA	2	8	12975	12982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016913	ATAA	2	8	13918	13925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016913	TAGC	2	8	14785	14792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016913	ATTA	2	8	19370	19377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016913	CATT	2	8	19433	19440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016913	ATTA	2	8	19491	19498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016913	TATT	2	8	22704	22711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016913	GCGA	2	8	24000	24007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016913	GATT	2	8	29559	29566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016913	CATA	2	8	29918	29925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016913	AACA	2	8	30960	30967	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016913	TAAA	2	8	34909	34916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016913	TTTG	2	8	37880	37887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016913	TCGC	2	8	48053	48060	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016913	AATA	2	8	51721	51728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016913	TCGC	2	8	65253	65260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016913	ATTT	2	8	68049	68056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016913	ATTT	2	8	73610	73617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016913	GTTT	2	8	73624	73631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016913	GTAA	2	8	78352	78359	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016913	GTAA	2	8	79458	79465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016913	ATCT	2	8	81586	81593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016913	AAAC	2	8	82414	82421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016913	TTTA	2	8	83912	83919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016913	TTTA	2	8	86198	86205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016913	CACG	2	8	86498	86505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016913	ATTT	2	8	93650	93657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016913	GAAA	2	8	95535	95542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016913	TTTA	2	8	95551	95558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016913	AGAT	2	8	95751	95758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016913	GATG	2	8	95908	95915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016913	AATT	2	8	97184	97191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016913	TATG	2	8	97278	97285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016913	ATTA	2	8	97650	97657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016913	TAAT	2	8	99272	99279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016913	TCGC	2	8	99579	99586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016913	CTAC	2	8	107146	107153	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016913	TGGT	2	8	109138	109145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016913	TAAA	2	8	109612	109619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016913	ATAG	2	8	110850	110857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016913	TTAT	2	8	110868	110875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016913	AAAG	2	8	112291	112298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016913	GAAA	2	8	117658	117665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016913	TGTA	2	8	118087	118094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016913	TTTA	2	8	118843	118850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016913	TAAT	2	8	123401	123408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016913	TATT	2	8	123816	123823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016913	TAAA	2	8	124343	124350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016913	TAAT	2	8	128333	128340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016913	AAAT	2	8	128435	128442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016913	GATA	2	8	129583	129590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016913	TGAT	2	8	129655	129662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016913	TATT	2	8	129696	129703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016913	TCCT	2	8	129785	129792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016913	TACA	2	8	130201	130208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016913	TTAA	2	8	130727	130734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016913	ATTG	2	8	130828	130835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016913	CAAA	2	8	131488	131495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016913	GATA	2	8	131654	131661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016913	CAAA	2	8	131772	131779	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016913	TGAA	2	8	131830	131837	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016913	TTTA	2	8	132523	132530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016913	AATT	2	8	132594	132601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016913	TGGT	2	8	133552	133559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016913	TAAT	2	8	134225	134232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016913	CTAT	2	8	136013	136020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016913	AAAT	2	8	136139	136146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016913	CTAA	2	8	136168	136175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016913	TGCT	2	8	136381	136388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016913	GCGA	2	8	139759	139766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016913	TATT	2	8	142678	142685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016913	CTTA	2	8	145353	145360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016913	TTTA	2	8	145656	145663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016913	TTTA	2	8	146115	146122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016913	TATC	2	8	146128	146135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016913	TTAT	2	8	146315	146322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016913	TTTA	2	8	146807	146814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016913	CTAG	2	8	147266	147273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016913	GTTT	2	8	147589	147596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016913	TTAA	2	8	147898	147905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016913	CTAA	2	8	152425	152432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016913	TAAA	2	8	152440	152447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016913	AGAA	2	8	152587	152594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016913	ACTT	2	8	152740	152747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016913	TTAC	2	8	152972	152979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016913	TGCG	2	8	153075	153082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016913	ATTT	2	8	157180	157187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016913	AAAG	2	8	157300	157307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016913	TAGA	2	8	157566	157573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016913	TAAG	2	8	157598	157605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016913	ATAA	2	8	157631	157638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016913	ATTA	2	8	160156	160163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016913	AATT	2	8	160225	160232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016913	TTTG	2	8	166330	166337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016913	TTCT	2	8	166338	166345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016913	TTGA	2	8	166900	166907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016913	TTTA	2	8	167021	167028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016913	GTAA	2	8	167029	167036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016913	AAAT	2	8	167598	167605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016913	ATTA	2	8	167718	167725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016913	TCAA	2	8	168122	168129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016913	ATTT	2	8	168272	168279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016913	CTTT	2	8	168343	168350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016913	GCGA	2	8	177658	177665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016913	ATAA	2	8	177766	177773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016913	AAAG	2	8	177858	177865	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016913	TTTA	2	8	177898	177905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016913	AAAT	2	8	178017	178024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016913	ATTT	2	8	178040	178047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016913	ATTA	2	8	178180	178187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016913	GCGA	2	8	180492	180499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016913	ATAA	2	8	182133	182140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016913	AGTA	2	8	184914	184921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016913	CAAG	2	8	185496	185503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016913	TTCC	2	8	185559	185566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016913	ATTT	2	8	186417	186424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016913	TTAC	2	8	186748	186755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016913	TAGT	2	8	186935	186942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016913	ATTA	2	8	187396	187403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016913	TATC	2	8	187597	187604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016913	ATGG	2	8	187605	187612	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016913	TATC	2	8	188780	188787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016913	TGTT	2	8	189587	189594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016913	AAAC	2	8	191615	191622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016913	AACC	2	8	192449	192456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016913	AAGT	2	8	192477	192484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016913	ATTA	2	8	196881	196888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016913	CGAA	2	8	196905	196912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016913	CTGA	2	8	196961	196968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016913	TAAA	2	8	197405	197412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016913	AAAT	2	8	204058	204065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016913	ACAA	2	8	204295	204302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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