MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 7829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016913	TTAT	2	8	572534	572541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016913	AAT	2	6	573112	573117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016913	ACA	2	6	573158	573163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_016913	TAAA	2	8	573193	573200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016913	ATG	2	6	573210	573215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016913	CAT	2	6	573225	573230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_016913	ATA	2	6	573250	573255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016913	AAT	2	6	573261	573266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016913	T	6	6	573283	573288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016913	AAATAA	2	12	573307	573318	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016913	TTA	2	6	573329	573334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016913	ATT	2	6	573349	573354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016913	T	7	7	573353	573359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016913	AAT	2	6	573375	573380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016913	TAA	2	6	573385	573390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016913	AAAT	2	8	573391	573398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016913	ATGTC	2	10	574061	574070	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4018	NC_016913	TAA	2	6	576225	576230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016913	T	6	6	576239	576244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016913	T	6	6	576249	576254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016913	AGA	2	6	576284	576289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016913	TAAG	2	8	576303	576310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016913	TAATAT	2	12	576589	576600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016913	ATC	2	6	576805	576810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_016913	TTA	2	6	576814	576819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016913	ATA	2	6	576880	576885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016913	TA	3	6	576896	576901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016913	GAT	2	6	577223	577228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016913	AGC	2	6	577243	577248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016913	TAA	2	6	577276	577281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016913	CAT	2	6	577293	577298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_016913	TAAA	2	8	577332	577339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016913	TAAT	2	8	577368	577375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016913	AT	3	6	577415	577420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016913	AT	3	6	577434	577439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016913	ATT	2	6	577471	577476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016913	TAA	2	6	577500	577505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016913	TAA	2	6	577579	577584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016913	ATT	2	6	577585	577590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016913	TTG	2	6	578787	578792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016913	AAC	2	6	578802	578807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_016913	A	7	7	578847	578853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016913	TAAAA	2	10	578900	578909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016913	ATT	2	6	578919	578924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016913	CTA	2	6	579836	579841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_016913	TTG	2	6	579846	579851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016913	TCA	2	6	579867	579872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_016913	GTAA	2	8	579888	579895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016913	TCGCT	2	10	579936	579945	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4050	NC_016913	ATG	2	6	579953	579958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016913	CAA	2	6	579973	579978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_016913	CAA	2	6	580021	580026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_016913	T	6	6	580839	580844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016913	T	7	7	582305	582311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016913	TTA	2	6	582329	582334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016913	ATC	2	6	582336	582341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_016913	GTA	2	6	582359	582364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016913	TTA	2	6	582392	582397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016913	GAC	2	6	582437	582442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_016913	CCT	2	6	582466	582471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_016913	TATATT	2	12	583366	583377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016913	AGT	2	6	583447	583452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016913	T	7	7	583552	583558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016913	GCA	2	6	585814	585819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_016913	TGT	2	6	587482	587487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016913	T	8	8	587526	587533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016913	CAA	2	6	587584	587589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_016913	ATT	2	6	587591	587596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016913	TTA	2	6	588235	588240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016913	TAA	2	6	588297	588302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016913	TCAT	2	8	588307	588314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_016913	A	7	7	588352	588358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016913	CAA	2	6	588374	588379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_016913	AAATT	2	10	588380	588389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016913	TTA	2	6	588402	588407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016913	TAG	2	6	588420	588425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016913	T	7	7	588434	588440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016913	TAA	2	6	588481	588486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016913	GAA	2	6	588497	588502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016913	TAAT	2	8	588607	588614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016913	TA	3	6	588802	588807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016913	TAA	2	6	588827	588832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016913	TAT	2	6	588841	588846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016913	ATA	2	6	588918	588923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016913	AGC	2	6	588951	588956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_016913	TAC	2	6	589003	589008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_016913	T	8	8	589012	589019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016913	GGTA	2	8	589030	589037	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016913	AAC	2	6	589091	589096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_016913	TAA	2	6	589106	589111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016913	A	6	6	589163	589168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_016913	GAG	2	6	589240	589245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016913	ACG	2	6	589289	589294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_016913	T	7	7	591820	591826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016913	TA	3	6	591831	591836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016913	CATTGT	2	12	591840	591851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4097	NC_016913	TCA	2	6	591878	591883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_016913	ATA	2	6	592482	592487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016913	ATT	2	6	592513	592518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016913	A	6	6	592554	592559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016913	T	8	8	597456	597463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016913	T	6	6	597472	597477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016913	TTG	2	6	597510	597515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016913	TGA	2	6	597560	597565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016913	T	7	7	597598	597604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016913	ATT	2	6	597606	597611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016913	CTC	2	6	597637	597642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_016913	GAC	2	6	597648	597653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_016913	CAA	2	6	597668	597673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_016913	TA	3	6	599752	599757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016913	TAT	2	6	599769	599774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016913	TA	3	6	599812	599817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016913	TAT	2	6	600035	600040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016913	TA	3	6	600121	600126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016913	ATA	2	6	600148	600153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016913	AGA	2	6	600425	600430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016913	TA	3	6	601814	601819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016913	ATT	2	6	601847	601852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016913	TAGT	2	8	601868	601875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016913	A	6	6	601878	601883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016913	TAAT	2	8	601920	601927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016913	ATTT	2	8	601942	601949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016913	AT	3	6	602000	602005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016913	TCA	2	6	602022	602027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_016913	TCT	2	6	602030	602035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_016913	ATA	2	6	602059	602064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016913	CTA	2	6	602086	602091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_016913	ATT	2	6	602102	602107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016913	ATA	2	6	602120	602125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016913	TCC	2	6	602131	602136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_016913	AGT	2	6	602138	602143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016913	GAA	2	6	602182	602187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016913	AGC	2	6	602235	602240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_016913	TTA	2	6	602258	602263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_016913	CAAA	2	8	602308	602315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_016913	A	6	6	602313	602318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4262	NC_016913	ATA	2	6	620156	620161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4272	NC_016913	TAA	2	6	621344	621349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_016913	ATT	2	6	621356	621361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4276	NC_016913	ATT	2	6	621429	621434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4399	NC_016913	TTATT	2	10	655315	655324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4401	NC_016913	TAA	2	6	655376	655381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4411	NC_016913	TAA	2	6	657208	657213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4412	NC_016913	TAA	2	6	657241	657246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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