MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 7829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016913	TTA	2	6	219289	219294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016913	ATT	2	6	219325	219330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016913	GAG	2	6	219340	219345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016913	ATG	2	6	219429	219434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016913	ATC	2	6	219438	219443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_016913	TAC	2	6	219461	219466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016913	AGCA	2	8	219472	219479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_016913	T	6	6	219483	219488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016913	ATT	2	6	219489	219494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016913	AT	3	6	219497	219502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016913	TAT	2	6	219517	219522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016913	T	6	6	219522	219527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016913	TAT	2	6	219530	219535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016913	AT	3	6	219537	219542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016913	TTA	2	6	219543	219548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016913	AAT	2	6	219567	219572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016913	TACT	2	8	221819	221826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_016913	TG	3	6	222739	222744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016913	ATT	2	6	222791	222796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016913	AAAC	2	8	222819	222826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_016913	CAT	2	6	223799	223804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_016913	T	6	6	223820	223825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016913	GCTTCT	2	12	223826	223837	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_016913	CTG	2	6	223854	223859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_016913	TA	3	6	223870	223875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016913	A	6	6	223879	223884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016913	A	6	6	223901	223906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016913	TTTCT	2	10	223938	223947	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1529	NC_016913	TCA	2	6	223954	223959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_016913	TCT	2	6	223984	223989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_016913	CT	3	6	224001	224006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_016913	TA	3	6	224017	224022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016913	GA	3	6	224049	224054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016913	G	9	9	224066	224074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016913	AAT	2	6	224083	224088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016913	TA	3	6	224089	224094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016913	TAA	2	6	224097	224102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016913	ATCT	2	8	224103	224110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_016913	TAA	2	6	224171	224176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016913	ATA	2	6	224215	224220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016913	AAC	2	6	224221	224226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_016913	TTA	2	6	224229	224234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016913	GTAT	2	8	224239	224246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016913	A	6	6	224255	224260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016913	TA	3	6	224385	224390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_016913	TTGGT	2	10	224426	224435	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016913	T	6	6	224442	224447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016913	AAG	2	6	224590	224595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016913	GTGA	2	8	224603	224610	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016913	A	6	6	224610	224615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016913	ATT	2	6	224628	224633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016913	TAA	2	6	224848	224853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016913	A	8	8	224852	224859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016913	AT	3	6	224888	224893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016913	TTA	2	6	224912	224917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016913	TTA	2	6	224951	224956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016913	TAA	2	6	224986	224991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016913	AAGGT	2	10	225063	225072	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016913	TAAG	2	8	225109	225116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016913	TTA	2	6	225142	225147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016913	GT	3	6	225153	225158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016913	TCTA	2	8	225178	225185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_016913	AGC	2	6	225426	225431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_016913	TTTTGT	2	12	225490	225501	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016913	TAA	2	6	225506	225511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016913	TA	3	6	225514	225519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016913	TAA	2	6	225530	225535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016913	ATT	2	6	225536	225541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016913	TAA	2	6	225574	225579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016913	TAT	2	6	225580	225585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016913	ATT	2	6	225617	225622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016913	TA	3	6	225634	225639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016913	TAG	2	6	225642	225647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016913	T	6	6	225674	225679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016913	TA	3	6	225693	225698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016913	T	6	6	225727	225732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016913	CTTAT	2	10	225755	225764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1578	NC_016913	GA	3	6	225820	225825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016913	GCA	2	6	225826	225831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_016913	AT	3	6	225842	225847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016913	AAT	2	6	225882	225887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016913	TA	3	6	225919	225924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016913	TTAT	2	8	227170	227177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016913	TAT	3	9	227230	227238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016913	GCT	2	6	227266	227271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_016913	AGG	2	6	227333	227338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016913	AT	4	8	227373	227380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016913	TAA	2	6	227399	227404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016913	ATTT	2	8	227425	227432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016913	CTTT	2	8	227449	227456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_016913	GAG	2	6	228611	228616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016913	GTT	2	6	228619	228624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016913	CAA	2	6	228687	228692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_016913	GAG	2	6	228701	228706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016913	TC	3	6	228723	228728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_016913	GTA	2	6	228787	228792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016913	CTG	2	6	228801	228806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_016913	AT	3	6	228857	228862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016913	AGT	2	6	228869	228874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016913	TAA	2	6	228887	228892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016913	CAA	2	6	228894	228899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_016913	TTA	2	6	228902	228907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016913	AAG	2	6	229529	229534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016913	ATT	2	6	229591	229596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016913	T	6	6	229595	229600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016913	T	7	7	230009	230015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016913	GTG	2	6	230064	230069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016913	TAA	2	6	230106	230111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016913	A	6	6	230122	230127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016913	ATG	2	6	230129	230134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016913	ATT	2	6	230166	230171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016913	AT	3	6	230598	230603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016913	ATT	2	6	230613	230618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016913	ATT	2	6	230739	230744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016913	TA	3	6	230804	230809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016913	AAAT	2	8	230835	230842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016913	A	6	6	230869	230874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016913	ATTTG	2	10	230908	230917	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016913	A	6	6	230934	230939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016913	T	6	6	230947	230952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016913	GATAAA	2	12	230959	230970	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016913	TTA	2	6	231008	231013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016913	TAA	2	6	231051	231056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016913	TTTTA	2	10	232465	232474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016913	TA	4	8	232473	232480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016913	TAA	2	6	232492	232497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016913	ATT	2	6	232539	232544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016913	GAT	2	6	232575	232580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016913	ATTTT	2	10	232592	232601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016913	T	7	7	232598	232604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016913	A	7	7	232661	232667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016913	ATC	2	6	232685	232690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_016913	TTA	2	6	232731	232736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016913	TAATA	2	10	233368	233377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016913	TC	3	6	235306	235311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_016913	TAG	2	6	235350	235355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_016913	TAAA	2	8	235376	235383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_016913	A	6	6	235381	235386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_016913	TTA	2	6	235398	235403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1932	NC_016913	GA	4	8	267411	267418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_016913	GA	3	6	267479	267484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1948	NC_016913	TGT	2	6	270264	270269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1951	NC_016913	ATT	2	6	270358	270363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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