MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 7829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016913	T	6	6	91989	91994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016913	ATTT	2	8	93650	93657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016913	A	6	6	93700	93705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016913	TTA	2	6	93732	93737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016913	GAAA	2	8	95535	95542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016913	TTTA	2	8	95551	95558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016913	ATA	2	6	95594	95599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016913	AATTA	2	10	95712	95721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016913	AGAT	2	8	95751	95758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016913	TTA	2	6	95771	95776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016913	AT	3	6	95818	95823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016913	TCA	2	6	95837	95842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016913	ATT	2	6	95876	95881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016913	GATG	2	8	95908	95915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016913	CTA	2	6	95940	95945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_016913	ATGCAT	2	12	95990	96001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
517	NC_016913	TAT	2	6	96005	96010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016913	TCT	2	6	96015	96020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_016913	ATT	2	6	96063	96068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016913	T	6	6	96086	96091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016913	TAT	2	6	96140	96145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016913	AGG	2	6	96165	96170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016913	TGA	2	6	96176	96181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016913	TAT	2	6	96485	96490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016913	TAA	2	6	96535	96540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016913	TGA	2	6	96571	96576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016913	TAT	2	6	96882	96887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016913	TATAT	2	10	96895	96904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016913	AGT	2	6	96928	96933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016913	CT	3	6	96940	96945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_016913	ATG	2	6	96960	96965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016913	AG	3	6	96980	96985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016913	GCA	3	9	96996	97004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_016913	TA	5	10	97060	97069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016913	AAT	2	6	97143	97148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016913	CAA	2	6	97156	97161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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538	NC_016913	AATT	2	8	97184	97191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016913	AGG	2	6	97193	97198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016913	TAG	2	6	97229	97234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016913	TAT	2	6	97236	97241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016913	AAT	2	6	97248	97253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016913	TATG	2	8	97278	97285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016913	TTC	2	6	97286	97291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016913	CT	3	6	97311	97316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_016913	ATG	2	6	97325	97330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016913	TAA	2	6	97389	97394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016913	TAG	2	6	97416	97421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016913	TAA	2	6	97427	97432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016913	GAT	3	9	97438	97446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016913	T	6	6	97477	97482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016913	GTT	2	6	97498	97503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016913	T	7	7	97569	97575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016913	ATG	2	6	97598	97603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016913	ATTA	2	8	97650	97657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016913	ACC	2	6	97680	97685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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558	NC_016913	ATA	2	6	97741	97746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016913	TAAGCT	2	12	97759	97770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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561	NC_016913	CAT	2	6	97896	97901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016913	TA	4	8	97904	97911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016913	AAC	2	6	97948	97953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_016913	TAAT	2	8	99272	99279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016913	AT	3	6	99338	99343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016913	GAT	2	6	99360	99365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016913	T	6	6	99386	99391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_016913	ATG	2	6	99588	99593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016913	AAT	2	6	99609	99614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016913	TA	3	6	101020	101025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016913	ATA	2	6	101028	101033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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576	NC_016913	AAT	2	6	101042	101047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_016913	TCG	2	6	107139	107144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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585	NC_016913	TTA	2	6	109151	109156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016913	CT	3	6	109160	109165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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589	NC_016913	GTAAAA	2	12	109913	109924	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_016913	ATAG	2	8	110850	110857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016913	TTAT	2	8	110868	110875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016913	AT	3	6	110878	110883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016913	TAA	2	6	110887	110892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016913	AGA	2	6	110902	110907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016913	ATA	2	6	110922	110927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_016913	T	7	7	110992	110998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016913	T	6	6	111015	111020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016913	GTA	2	6	111021	111026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016913	CTT	2	6	111045	111050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_016913	TAAAT	2	10	111057	111066	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016913	AAAG	2	8	112291	112298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016913	TAT	2	6	112309	112314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016913	TA	3	6	112317	112322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016913	GTC	2	6	112337	112342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_016913	ATT	2	6	112362	112367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016913	TAA	2	6	112427	112432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016913	ATT	2	6	112447	112452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016913	TAG	2	6	112549	112554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016913	ATT	2	6	113216	113221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016913	T	7	7	113245	113251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016913	ATT	2	6	113868	113873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016913	TA	3	6	113901	113906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016913	A	8	8	113929	113936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016913	TTG	2	6	114146	114151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016913	ACA	2	6	114218	114223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016913	GGTCA	2	10	114227	114236	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
619	NC_016913	ACA	2	6	114252	114257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016913	TTAAAA	2	12	115390	115401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016913	A	6	6	115398	115403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016913	TAG	2	6	116262	116267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016913	AGA	2	6	116299	116304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016913	ATA	3	9	116319	116327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016913	A	7	7	116363	116369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016913	AGA	2	6	116380	116385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016913	GTC	2	6	117218	117223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016913	AT	3	6	117228	117233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016913	GAA	2	6	117247	117252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016913	GAC	2	6	117259	117264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016913	A	6	6	117272	117277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016913	A	6	6	117508	117513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016913	AT	3	6	117528	117533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016913	GAAA	2	8	117658	117665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016913	AAG	2	6	117683	117688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016913	TTC	2	6	117764	117769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016913	TA	3	6	117776	117781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016913	AT	3	6	117807	117812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016913	AAG	2	6	117831	117836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016913	ATTTT	2	10	117843	117852	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_016913	AT	3	6	117913	117918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_016913	A	7	7	118012	118018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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