MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 7829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016913	TAATT	2	10	673550	673559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016913	AATA	2	8	673635	673642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_016913	A	6	6	673648	673653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_016913	TTA	2	6	673703	673708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016913	GTT	2	6	673718	673723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016913	ACAA	2	8	673732	673739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_016913	GCA	2	6	673922	673927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_016913	TCC	2	6	674773	674778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_016913	AT	3	6	674780	674785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_016913	TAA	2	6	674787	674792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_016913	TTG	2	6	674793	674798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016913	TAA	2	6	674822	674827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_016913	ATT	2	6	674870	674875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_016913	ATT	2	6	674911	674916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016913	GTA	2	6	674929	674934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016913	ATT	2	6	675036	675041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_016913	TAT	2	6	675083	675088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_016913	TCT	2	6	675121	675126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_016913	ATTA	2	8	675377	675384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_016913	TA	3	6	675415	675420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_016913	TTA	2	6	675446	675451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_016913	TAATA	2	10	675458	675467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_016913	ATT	2	6	676979	676984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_016913	ATA	2	6	676995	677000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_016913	CAT	2	6	677001	677006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_016913	ATT	2	6	677829	677834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_016913	ATT	2	6	677946	677951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_016913	CA	3	6	678010	678015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_016913	ATTAA	2	10	679230	679239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_016913	TAA	2	6	680334	680339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_016913	ATT	2	6	680342	680347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_016913	AGA	2	6	680382	680387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_016913	CGA	2	6	681364	681369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_016913	AAC	2	6	681525	681530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_016913	A	6	6	681539	681544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_016913	CTA	2	6	681632	681637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_016913	ACC	2	6	681795	681800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_016913	TTG	2	6	681824	681829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_016913	TAAT	2	8	681912	681919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_016913	T	6	6	681919	681924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_016913	ATA	2	6	681944	681949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_016913	C	6	6	681959	681964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4543	NC_016913	AT	3	6	681965	681970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_016913	AAT	2	6	682031	682036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_016913	CATTAT	2	12	682128	682139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4546	NC_016913	AGG	2	6	682173	682178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_016913	TAA	2	6	682195	682200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_016913	GATATT	2	12	682213	682224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_016913	ATG	2	6	682280	682285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_016913	TAT	2	6	682297	682302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_016913	ATC	2	6	682322	682327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_016913	TTA	2	6	682365	682370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_016913	ATT	2	6	682373	682378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_016913	GAAT	2	8	682438	682445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_016913	ATC	2	6	682464	682469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_016913	TCC	2	6	682506	682511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_016913	TGT	2	6	682542	682547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_016913	ACTT	2	8	682553	682560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4559	NC_016913	T	6	6	682559	682564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_016913	AGTG	2	8	682638	682645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_016913	AAG	2	6	682711	682716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_016913	T	6	6	682770	682775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_016913	AAT	2	6	682813	682818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_016913	ATT	2	6	682824	682829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_016913	ATA	2	6	682847	682852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_016913	ATTAA	2	10	682874	682883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_016913	TA	3	6	683095	683100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_016913	ATA	2	6	683111	683116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_016913	TCG	2	6	684937	684942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_016913	TTC	2	6	684956	684961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_016913	ATA	2	6	684980	684985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_016913	A	6	6	684985	684990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_016913	AATG	2	8	686601	686608	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_016913	A	6	6	686638	686643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_016913	ATAAA	2	10	687939	687948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_016913	A	6	6	687952	687957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_016913	A	6	6	687959	687964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_016913	TA	3	6	687974	687979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_016913	TAA	2	6	687990	687995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_016913	TA	3	6	688007	688012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_016913	TAA	2	6	688023	688028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_016913	TAA	2	6	688031	688036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_016913	A	6	6	688058	688063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_016913	TAA	2	6	688064	688069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_016913	ATA	2	6	688087	688092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_016913	AGA	2	6	688112	688117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_016913	A	7	7	688144	688150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_016913	A	6	6	688155	688160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016913	A	6	6	688192	688197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_016913	TTAA	2	8	688218	688225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_016913	ATAA	2	8	689934	689941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_016913	TGA	3	9	689954	689962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_016913	AACC	2	8	689977	689984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_016913	TAAA	2	8	689996	690003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_016913	ATTAA	2	10	690030	690039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_016913	TACA	2	8	690052	690059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_016913	TTA	2	6	690205	690210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_016913	GGA	2	6	690218	690223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_016913	TTGC	2	8	690246	690253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_016913	CGC	2	6	690277	690282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_016913	TCA	2	6	690358	690363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_016913	CTG	2	6	690376	690381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_016913	CTT	2	6	690388	690393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_016913	TTA	2	6	690399	690404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_016913	TAAA	2	8	690416	690423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_016913	CATA	2	8	690448	690455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_016913	CCA	2	6	690480	690485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_016913	CTT	2	6	690499	690504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_016913	ATT	2	6	690512	690517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_016913	AAT	2	6	690521	690526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_016913	TCA	2	6	690562	690567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_016913	ATT	2	6	691113	691118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_016913	TTA	2	6	691144	691149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_016913	T	6	6	691158	691163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_016913	CAG	2	6	691164	691169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_016913	A	6	6	694127	694132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_016913	AT	3	6	694141	694146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_016913	TAT	3	9	694144	694152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_016913	AT	3	6	694151	694156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_016913	TATT	2	8	694791	694798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_016913	CAA	2	6	694858	694863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_016913	ATG	2	6	694876	694881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_016913	CA	3	6	694894	694899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_016913	ATT	2	6	694931	694936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_016913	TA	3	6	694958	694963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_016913	TAAT	2	8	694991	694998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_016913	AT	3	6	694997	695002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_016913	TA	3	6	695004	695009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_016913	TG	3	6	697539	697544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_016913	TTA	2	6	697547	697552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_016913	CT	3	6	697556	697561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_016913	TCA	2	6	697565	697570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_016913	ATATA	2	10	697582	697591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_016913	GTA	2	6	697594	697599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_016913	T	6	6	697615	697620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_016913	TTAG	2	8	697627	697634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4638	NC_016913	TCT	2	6	698145	698150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4916	NC_016913	AT	3	6	749752	749757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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