MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016911	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016911	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016911	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016911	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016911	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016911	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016911	TTAA	2	8	12374	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016911	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016911	TTGC	2	8	16332	16339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016911	AGTA	2	8	19811	19818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016911	AAAC	2	8	19861	19868	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016911	TAAA	2	8	19936	19943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016911	TTAT	2	8	20134	20141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016911	ACTA	2	8	25867	25874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016911	TAAA	2	8	28578	28585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016911	AGGA	2	8	28636	28643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016911	TAAA	2	8	28668	28675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016911	GCTA	2	8	28678	28685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016911	TAAT	2	8	29925	29932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016911	ATAA	2	8	38659	38666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016911	AACA	2	8	38756	38763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016911	TAAA	2	8	39858	39865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016911	CTTG	2	8	40700	40707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016911	CTGA	2	8	40708	40715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016911	ATTG	2	8	40886	40893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016911	ATTA	2	8	41313	41320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016911	ATTA	2	8	41370	41377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016911	TGCT	3	12	41493	41504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016911	GCTT	2	8	41620	41627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016911	TTTA	2	8	41660	41667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016911	ATTA	2	8	42101	42108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016911	TAAT	2	8	42394	42401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016911	ATTA	2	8	42464	42471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016911	AAAT	2	8	42567	42574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016911	TACC	2	8	44647	44654	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016911	AAAC	2	8	44655	44662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016911	TAAT	2	8	44731	44738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016911	ATTT	2	8	44758	44765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016911	ATTA	2	8	44766	44773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016911	AAAT	2	8	44785	44792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016911	ATGA	2	8	44988	44995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016911	AGTA	2	8	48876	48883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016911	ATAC	2	8	49094	49101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016911	AAGT	2	8	49645	49652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016911	ATCT	2	8	50691	50698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016911	TTTA	2	8	51274	51281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016911	ACTC	2	8	51385	51392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016911	TAAA	2	8	51423	51430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016911	ATTA	2	8	52538	52545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016911	TAAA	2	8	55973	55980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016911	ATCT	2	8	57178	57185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016911	AACG	2	8	58558	58565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016911	GTTA	2	8	58929	58936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016911	TTAA	2	8	59159	59166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016911	ACAA	2	8	60819	60826	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016911	TAAA	2	8	62306	62313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016911	ATTT	2	8	62327	62334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016911	ATTT	2	8	64323	64330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016911	TTAA	2	8	65896	65903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016911	TAGT	2	8	66384	66391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016911	ATAA	2	8	68434	68441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016911	AAGT	2	8	72382	72389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016911	CAAT	2	8	74717	74724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016911	TAAA	2	8	75660	75667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016911	TTTA	2	8	75705	75712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016911	AAAT	2	8	75779	75786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016911	AAAT	2	8	83345	83352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016911	TATC	2	8	86992	86999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016911	TAGC	2	8	87095	87102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016911	TAAA	2	8	92502	92509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016911	TTTA	2	8	95171	95178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016911	AAAT	2	8	95195	95202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016911	AATT	2	8	95418	95425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016911	TAAA	2	8	96776	96783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016911	ATTA	2	8	97013	97020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016911	AATG	2	8	98222	98229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016911	TCCA	2	8	100052	100059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016911	AAGC	2	8	100147	100154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016911	ATGT	2	8	102202	102209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016911	AAAG	2	8	106975	106982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016911	ATTT	2	8	107126	107133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016911	TTTA	2	8	107167	107174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016911	ATTC	2	8	113010	113017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016911	ATTA	2	8	113091	113098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016911	GAAA	2	8	113212	113219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016911	ACTC	2	8	117150	117157	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016911	CAAA	2	8	117172	117179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016911	CTAT	2	8	117243	117250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016911	AAGT	2	8	120500	120507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016911	CTAC	2	8	122316	122323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016911	CGCT	2	8	125020	125027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016911	TCAC	2	8	125049	125056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016911	GCAG	2	8	125069	125076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016911	ACGT	2	8	128137	128144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016911	ATTC	2	8	129521	129528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016911	TAAT	2	8	129542	129549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016911	TTTA	2	8	129715	129722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016911	AATT	2	8	131361	131368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016911	TTTG	2	8	132194	132201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016911	AAAC	2	8	151448	151455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016911	TGAT	2	8	151643	151650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016911	ATTA	2	8	151911	151918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016911	CGAT	2	8	152151	152158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016911	TAAT	2	8	152286	152293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016911	TAGA	2	8	152684	152691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016911	ATTT	2	8	152931	152938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016911	ATAA	2	8	153119	153126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016911	TTGC	2	8	153822	153829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016911	GGTG	2	8	154643	154650	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016911	ATAA	2	8	154653	154660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016911	TCTA	2	8	167372	167379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016911	TTTA	2	8	167382	167389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016911	TTTA	2	8	169963	169970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016911	TCAT	2	8	172816	172823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016911	TAAT	2	8	176858	176865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016911	ATTA	2	8	178007	178014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016911	TTAA	2	8	180166	180173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016911	TCAA	2	8	180737	180744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016911	ATAA	2	8	181317	181324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016911	TCAG	2	8	181543	181550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016911	ATAA	2	8	191764	191771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016911	TTAC	2	8	193416	193423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016911	AGTA	2	8	201056	201063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016911	CTTT	2	8	206216	206223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016911	TTTA	2	8	207347	207354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016911	TATT	2	8	210345	210352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016911	TGAT	2	8	210421	210428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016911	TATT	2	8	211026	211033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016911	CTAA	2	8	215057	215064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016911	TAAT	2	8	215077	215084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016911	AGCA	2	8	215116	215123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016911	ATTT	2	8	217067	217074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016911	ATTT	2	8	217813	217820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016911	TAAA	2	8	218967	218974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016911	TTAA	2	8	228813	228820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016911	AAGT	2	8	228928	228935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016911	AATG	2	8	229127	229134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016911	TTCA	2	8	229782	229789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016911	AGCT	2	8	229918	229925	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016911	ATTT	2	8	230074	230081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016911	ATCC	2	8	230665	230672	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016911	TTTC	2	8	230745	230752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016911	TTTA	2	8	230967	230974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016911	TTTC	2	8	233862	233869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016911	TTAG	2	8	234288	234295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016911	TACT	2	8	235508	235515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016911	CTTT	2	8	236289	236296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016911	ATTT	2	8	237635	237642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016911	TAAA	2	8	245202	245209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016911	ATAC	2	8	250115	250122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016911	TAAT	2	8	250294	250301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016911	AACA	2	8	250579	250586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016911	TTTC	2	8	251517	251524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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