MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 7992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016911	ATA	2	6	704654	704659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016911	AAC	2	6	704670	704675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016911	TTAA	2	8	704682	704689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016911	GGA	2	6	704719	704724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016911	A	7	7	704789	704795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016911	GGA	2	6	704825	704830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016911	AATA	2	8	704919	704926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016911	A	6	6	706816	706821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016911	T	7	7	706837	706843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016911	ATT	2	6	706844	706849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_016911	T	6	6	706848	706853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_016911	AAT	2	6	708238	708243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016911	ATT	2	6	708270	708275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016911	AAT	2	6	708325	708330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016911	TTTG	2	8	708605	708612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016911	ATA	2	6	708617	708622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016911	A	6	6	708625	708630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4019	NC_016911	ATT	2	6	708650	708655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016911	TCT	2	6	708678	708683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_016911	TCT	2	6	708884	708889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_016911	ATT	2	6	708928	708933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016911	CTTT	2	8	708971	708978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_016911	AAT	2	6	709006	709011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016911	T	6	6	709018	709023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016911	CTT	2	6	709093	709098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_016911	T	6	6	709097	709102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_016911	TCT	2	6	709108	709113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_016911	AGAAA	2	10	709125	709134	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_016911	TAT	2	6	709171	709176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016911	TG	3	6	709990	709995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016911	GCT	2	6	710083	710088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_016911	CAA	2	6	711426	711431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_016911	AACC	2	8	712977	712984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_016911	TA	3	6	713038	713043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016911	ATTAT	2	10	713044	713053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016911	TAA	2	6	713055	713060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016911	A	6	6	713059	713064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_016911	TAG	2	6	713106	713111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016911	AGA	3	9	713121	713129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016911	GTT	2	6	713171	713176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016911	A	6	6	713186	713191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016911	CTAG	2	8	713209	713216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_016911	TCA	2	6	713241	713246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_016911	ATT	2	6	713292	713297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016911	CAA	2	6	713355	713360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_016911	T	6	6	713596	713601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4049	NC_016911	TAT	2	6	713736	713741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016911	TGC	2	6	713787	713792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_016911	ATT	2	6	713913	713918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016911	CTTT	2	8	713929	713936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_016911	TAG	2	6	713942	713947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016911	GAG	2	6	713983	713988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016911	AAT	2	6	713998	714003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016911	T	7	7	714010	714016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016911	CCCAT	2	10	714051	714060	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4058	NC_016911	GAT	2	6	714089	714094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016911	ACT	2	6	714121	714126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_016911	CTA	2	6	714143	714148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_016911	TTA	2	6	714206	714211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016911	TCT	2	6	714270	714275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_016911	TAT	2	6	714299	714304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016911	CTT	2	6	714341	714346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_016911	AGC	2	6	714375	714380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4067	NC_016911	T	6	6	714407	714412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_016911	AATT	2	8	714424	714431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016911	TGA	2	6	714444	714449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016911	ATACCG	2	12	714462	714473	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4073	NC_016911	ATT	2	6	714533	714538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4081	NC_016911	T	6	6	714850	714855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016911	TAAA	2	8	714869	714876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016911	A	7	7	714882	714888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016911	T	7	7	714925	714931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016911	AAT	2	6	714932	714937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016911	T	7	7	714944	714950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_016911	GTA	2	6	715070	715075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016911	TAA	2	6	715080	715085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_016911	T	6	6	715504	715509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016911	GAC	2	6	715518	715523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4097	NC_016911	AT	3	6	715551	715556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016911	CTT	2	6	715565	715570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_016911	ATT	2	6	715587	715592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016911	ATTG	2	8	715610	715617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016911	ATA	2	6	715618	715623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_016911	TGA	2	6	715647	715652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016911	AAT	2	6	715667	715672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016911	TTA	2	6	715682	715687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016911	ATT	2	6	715714	715719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016911	TA	3	6	715775	715780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016911	TCC	2	6	715842	715847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_016911	ATA	2	6	715859	715864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016911	TA	3	6	716060	716065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016911	A	6	6	716159	716164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016911	AT	3	6	716340	716345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016911	T	6	6	716362	716367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016911	ATA	2	6	716426	716431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016911	ATT	2	6	716432	716437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4117	NC_016911	TAC	2	6	716760	716765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_016911	TAAA	2	8	716827	716834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016911	AAT	2	6	716870	716875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016911	TTA	2	6	716934	716939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016911	TGAAA	2	10	716951	716960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016911	GAT	2	6	716962	716967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016911	AAAAT	2	10	716974	716983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016911	GAA	2	6	717008	717013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016911	ATT	2	6	717426	717431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_016911	T	6	6	717444	717449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016911	TGT	2	6	717472	717477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016911	GAA	2	6	717518	717523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016911	AT	3	6	718587	718592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016911	AT	3	6	719675	719680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016911	T	6	6	719708	719713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016911	T	6	6	719725	719730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016911	TAA	2	6	719740	719745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_016911	A	8	8	719776	719783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_016911	GCA	2	6	719794	719799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_016911	A	6	6	719799	719804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_016911	AAT	2	6	719859	719864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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