MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 7992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016911	TGA	2	6	266066	266071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016911	TGC	2	6	266159	266164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016911	GGT	2	6	266166	266171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016911	TA	3	6	266302	266307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016911	ATA	2	6	266423	266428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016911	TTA	2	6	266446	266451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016911	ATC	2	6	266459	266464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_016911	ATA	2	6	266704	266709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016911	A	6	6	266712	266717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016911	A	6	6	266941	266946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016911	A	6	6	266974	266979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016911	T	9	9	266995	267003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016911	T	6	6	267005	267010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016911	GCT	2	6	267033	267038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_016911	ATA	2	6	267090	267095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016911	T	6	6	269573	269578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016911	TA	4	8	269958	269965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016911	TA	4	8	269972	269979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016911	T	6	6	272272	272277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016911	AT	3	6	272299	272304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016911	A	7	7	272313	272319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016911	ATC	2	6	272933	272938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_016911	AGC	2	6	272945	272950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_016911	ATA	2	6	272977	272982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016911	ATGACG	2	12	273025	273036	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1526	NC_016911	ATA	2	6	275082	275087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016911	A	7	7	275102	275108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016911	AGG	2	6	275480	275485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016911	TTA	2	6	275489	275494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016911	TCGC	2	8	275523	275530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_016911	ATG	2	6	275571	275576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016911	AAAAC	2	10	275607	275616	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1533	NC_016911	ATTC	2	8	275625	275632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_016911	TC	3	6	275631	275636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_016911	CT	3	6	275692	275697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_016911	TAA	2	6	275722	275727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016911	AT	3	6	275753	275758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016911	TAAA	2	8	275770	275777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016911	ATT	2	6	275805	275810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016911	T	6	6	275863	275868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016911	AGT	2	6	276004	276009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016911	TAA	2	6	276114	276119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016911	AAT	2	6	276209	276214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016911	GAA	2	6	276266	276271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016911	CTA	2	6	276321	276326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_016911	ACT	2	6	276329	276334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_016911	A	6	6	276963	276968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016911	TTA	2	6	276986	276991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016911	GA	3	6	277027	277032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016911	ATTGCA	2	12	277066	277077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1551	NC_016911	A	6	6	277089	277094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016911	AT	3	6	277102	277107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016911	TGA	2	6	277113	277118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016911	CAA	2	6	277121	277126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016911	TAC	2	6	277191	277196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_016911	TAT	2	6	277224	277229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016911	TGC	2	6	277511	277516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_016911	A	7	7	277550	277556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016911	A	6	6	277599	277604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016911	TAT	2	6	277674	277679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016911	TAG	2	6	277723	277728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016911	TAT	2	6	277770	277775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016911	ACC	2	6	277808	277813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_016911	GGT	2	6	277830	277835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016911	AGC	2	6	278013	278018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_016911	AAT	2	6	278043	278048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016911	AT	3	6	278053	278058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016911	GTC	2	6	278110	278115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_016911	A	6	6	278184	278189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016911	TA	3	6	278222	278227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016911	A	6	6	278236	278241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_016911	CAA	2	6	278282	278287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_016911	GCA	2	6	278294	278299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1575	NC_016911	TAT	2	6	278363	278368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016911	TAT	2	6	278374	278379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016911	TCA	2	6	281217	281222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_016911	GAG	2	6	281227	281232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016911	TTG	2	6	281236	281241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016911	CAA	2	6	281314	281319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_016911	AGC	2	6	281329	281334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_016911	ATA	2	6	281361	281366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016911	TTA	2	6	281420	281425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016911	C	10	10	281451	281460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1585	NC_016911	A	9	9	281461	281469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016911	CT	3	6	281504	281509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_016911	ATA	2	6	281510	281515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016911	T	7	7	281557	281563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016911	ACT	2	6	281564	281569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1591	NC_016911	ATT	2	6	281642	281647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016911	TAT	2	6	281691	281696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016911	TCTA	2	8	281763	281770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_016911	ATT	2	6	281784	281789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016911	ATT	2	6	281800	281805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016911	TGT	2	6	281826	281831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_016911	ATT	2	6	281870	281875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016911	TGTT	2	8	281894	281901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016911	TA	3	6	281927	281932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016911	AT	3	6	281934	281939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016911	TTG	2	6	282475	282480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016911	TAA	2	6	282834	282839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016911	ATT	2	6	282902	282907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016911	ATT	3	9	283029	283037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016911	T	6	6	283036	283041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016911	GAA	2	6	283044	283049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016911	T	6	6	283058	283063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016911	TA	3	6	283081	283086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016911	TG	3	6	283119	283124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016911	AT	3	6	283132	283137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016911	TAA	2	6	283141	283146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016911	CCT	2	6	283586	283591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1614	NC_016911	TTAT	2	8	283608	283615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016911	TAT	2	6	283638	283643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016911	T	6	6	283643	283648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016911	ATT	2	6	283656	283661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016911	ATT	2	6	283672	283677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016911	TAT	2	6	283693	283698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016911	CTTT	2	8	283728	283735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_016911	ATTAAA	2	12	283759	283770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016911	TAT	3	9	285225	285233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016911	A	6	6	285244	285249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016911	TAAT	2	8	285338	285345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016911	TAG	2	6	285382	285387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016911	ATG	2	6	285388	285393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016911	ATC	2	6	285936	285941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_016911	ATA	2	6	286014	286019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016911	AAT	2	6	286057	286062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016911	AATT	2	8	286068	286075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_016911	ATA	2	6	286118	286123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016911	TGG	2	6	286132	286137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016911	ACCT	2	8	286236	286243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_016911	TTA	2	6	286247	286252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016911	GGA	2	6	286318	286323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_016911	A	7	7	286386	286392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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