MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 7992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016911	A	8	8	77322	77329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016911	N	53	53	77350	77402	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016911	T	7	7	77425	77431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016911	TAA	2	6	78754	78759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016911	GCT	2	6	83308	83313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016911	TA	4	8	83324	83331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016911	AAAT	2	8	83345	83352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016911	ATACA	2	10	83427	83436	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
509	NC_016911	GTA	2	6	83437	83442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016911	ATA	3	9	83443	83451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016911	AT	4	8	86339	86346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016911	TAA	2	6	86382	86387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016911	T	6	6	86388	86393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016911	A	6	6	86401	86406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016911	TGT	2	6	86454	86459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016911	T	7	7	86477	86483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016911	TA	3	6	86536	86541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016911	AAT	2	6	86548	86553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016911	ATT	2	6	86565	86570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016911	ATATAA	2	12	86629	86640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016911	AT	3	6	86889	86894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016911	A	6	6	86974	86979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016911	TATC	2	8	86992	86999	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_016911	A	7	7	87003	87009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016911	TA	3	6	87016	87021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016911	AGA	2	6	87027	87032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016911	TTAAA	2	10	87041	87050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016911	GCT	2	6	87064	87069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016911	TAGC	2	8	87095	87102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_016911	GAA	2	6	87109	87114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016911	TAA	2	6	87350	87355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016911	CAA	2	6	87357	87362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_016911	ATA	2	6	87432	87437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016911	ATC	2	6	87475	87480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016911	TTA	2	6	87496	87501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016911	AAT	2	6	87524	87529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016911	CAA	3	9	87543	87551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016911	GAT	2	6	87591	87596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016911	TAA	2	6	87598	87603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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541	NC_016911	AAGGAC	2	12	87646	87657	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
542	NC_016911	CAA	2	6	87710	87715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016911	TGC	2	6	87898	87903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_016911	TAA	2	6	87929	87934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016911	TA	3	6	88323	88328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016911	TGT	2	6	88358	88363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016911	ATA	2	6	88419	88424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016911	CAA	2	6	88480	88485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_016911	TGC	2	6	89688	89693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016911	TCC	2	6	89714	89719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_016911	TTA	2	6	89720	89725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016911	TAA	2	6	89760	89765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016911	TAA	2	6	89770	89775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016911	AGG	2	6	91531	91536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016911	GTC	2	6	91558	91563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016911	AGC	2	6	91570	91575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016911	ATA	2	6	91602	91607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016911	TAT	2	6	91662	91667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016911	TTTTAA	2	12	92412	92423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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561	NC_016911	CAA	2	6	92490	92495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016911	TAAA	2	8	92502	92509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016911	A	6	6	94830	94835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016911	TGC	2	6	94842	94847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016911	T	6	6	94910	94915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016911	ATA	2	6	95064	95069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016911	AT	3	6	95076	95081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016911	AT	3	6	95094	95099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016911	AT	3	6	95115	95120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016911	TAAAAA	2	12	95144	95155	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016911	AT	3	6	95162	95167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016911	TTTA	2	8	95171	95178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016911	AAAT	2	8	95195	95202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016911	AGA	2	6	95301	95306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016911	ATT	2	6	95316	95321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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577	NC_016911	A	8	8	95357	95364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_016911	AATT	2	8	95418	95425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_016911	TAA	2	6	96767	96772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016911	TAAA	2	8	96776	96783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016911	TAA	2	6	96814	96819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016911	TAATA	2	10	96837	96846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016911	A	6	6	96868	96873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016911	TAA	2	6	96887	96892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016911	AT	3	6	96904	96909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016911	TGT	2	6	96912	96917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016911	ATT	2	6	96918	96923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016911	ATT	2	6	96933	96938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016911	TTGTA	2	10	96975	96984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016911	AAT	2	6	96985	96990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016911	ATTA	2	8	97013	97020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016911	T	6	6	97604	97609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016911	ATT	2	6	98119	98124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016911	CATTT	2	10	98130	98139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
597	NC_016911	TAT	2	6	98215	98220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016911	AATG	2	8	98222	98229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016911	A	6	6	98245	98250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016911	AAT	2	6	98267	98272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016911	AATTA	2	10	98280	98289	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016911	T	7	7	99999	100005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016911	TCCA	2	8	100052	100059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_016911	AAT	2	6	100135	100140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016911	AAGC	2	8	100147	100154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_016911	T	6	6	100752	100757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016911	ATGT	2	8	102202	102209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016911	TAT	2	6	102213	102218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016911	A	8	8	102259	102266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016911	A	7	7	102268	102274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016911	TAT	3	9	103106	103114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016911	TA	3	6	103129	103134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016911	ATT	2	6	103206	103211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016911	TAC	2	6	105582	105587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016911	AAG	2	6	105614	105619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016911	T	6	6	105848	105853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016911	AAT	2	6	105922	105927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016911	CTA	2	6	105932	105937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016911	TAG	2	6	105995	106000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016911	CAC	3	9	106001	106009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_016911	TAT	2	6	106087	106092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016911	TAT	2	6	106095	106100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016911	TTTAT	2	10	106102	106111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016911	ATA	2	6	106127	106132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016911	ATT	2	6	106172	106177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016911	TTA	2	6	106178	106183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016911	TC	3	6	106510	106515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_016911	GTT	2	6	106544	106549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016911	AAC	2	6	106657	106662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016911	AT	4	8	106719	106726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016911	AAT	2	6	106758	106763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016911	A	6	6	106796	106801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016911	T	6	6	106822	106827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016911	TTA	2	6	106835	106840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016911	TAG	2	6	106841	106846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016911	T	6	6	106922	106927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016911	T	6	6	106938	106943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016911	AAAG	2	8	106975	106982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016911	TAT	2	6	107007	107012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016911	TAATA	2	10	107016	107025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_016911	TAA	3	9	107033	107041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_016911	CTA	2	6	107063	107068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_016911	TA	3	6	107099	107104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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