MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 7992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016911	TCA	2	6	1004594	1004599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_016911	GTC	2	6	1004605	1004610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_016911	TTA	2	6	1004659	1004664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_016911	CA	3	6	1004679	1004684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6505	NC_016911	A	6	6	1004707	1004712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_016911	CA	3	6	1004720	1004725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_016911	A	6	6	1004751	1004756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_016911	TAA	2	6	1006688	1006693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_016911	T	6	6	1006742	1006747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_016911	T	7	7	1006764	1006770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_016911	TAA	2	6	1006873	1006878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_016911	A	7	7	1008794	1008800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_016911	ATT	2	6	1008831	1008836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_016911	T	6	6	1010148	1010153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_016911	ACT	2	6	1010154	1010159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_016911	AAC	2	6	1010160	1010165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_016911	A	6	6	1010233	1010238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_016911	T	6	6	1010335	1010340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_016911	TAT	2	6	1010358	1010363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_016911	AT	3	6	1010419	1010424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_016911	GAT	2	6	1012163	1012168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_016911	ATT	2	6	1012191	1012196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_016911	ATT	2	6	1012291	1012296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_016911	AT	4	8	1012300	1012307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_016911	CAG	2	6	1012311	1012316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_016911	CCT	2	6	1012335	1012340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_016911	CAA	2	6	1012401	1012406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_016911	ATA	2	6	1012436	1012441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_016911	T	6	6	1012489	1012494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_016911	T	6	6	1012580	1012585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_016911	TCATA	2	10	1012597	1012606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6532	NC_016911	TAA	2	6	1012616	1012621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_016911	ATT	2	6	1012649	1012654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_016911	AAAT	2	8	1012691	1012698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_016911	TTC	3	9	1012747	1012755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_016911	AAT	2	6	1012785	1012790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_016911	ATA	2	6	1012802	1012807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_016911	TA	3	6	1012806	1012811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_016911	CTA	2	6	1012831	1012836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_016911	TTGA	2	8	1012841	1012848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_016911	CAT	2	6	1012859	1012864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_016911	T	7	7	1012872	1012878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_016911	TCT	2	6	1012884	1012889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_016911	CCGAA	2	10	1012918	1012927	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6545	NC_016911	TCA	2	6	1012965	1012970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_016911	AATTTA	2	12	1013096	1013107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_016911	T	6	6	1013143	1013148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_016911	TA	3	6	1013153	1013158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_016911	GAA	2	6	1013164	1013169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_016911	TAA	2	6	1013184	1013189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_016911	TA	3	6	1013209	1013214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_016911	AT	3	6	1013218	1013223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_016911	T	6	6	1013238	1013243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_016911	TAAT	2	8	1013245	1013252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_016911	TATT	2	8	1013364	1013371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_016911	T	6	6	1013379	1013384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_016911	CAT	2	6	1013386	1013391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_016911	ATC	3	9	1013465	1013473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_016911	TAA	2	6	1013504	1013509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_016911	ATT	2	6	1013528	1013533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_016911	TTA	2	6	1013737	1013742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_016911	AT	3	6	1013764	1013769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_016911	T	6	6	1013769	1013774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_016911	ATA	2	6	1013827	1013832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_016911	ATA	2	6	1013855	1013860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_016911	TACT	2	8	1013935	1013942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6567	NC_016911	TCTT	2	8	1013958	1013965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6568	NC_016911	TCT	2	6	1013979	1013984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_016911	CAAT	2	8	1014060	1014067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6570	NC_016911	CTA	2	6	1014148	1014153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_016911	TATT	2	8	1014168	1014175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_016911	TTA	2	6	1014278	1014283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_016911	ATA	2	6	1014289	1014294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_016911	AT	3	6	1014304	1014309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_016911	T	7	7	1014309	1014315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_016911	ATA	2	6	1014317	1014322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_016911	TTA	2	6	1014324	1014329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_016911	G	6	6	1014409	1014414	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_016911	GTT	2	6	1014450	1014455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_016911	T	6	6	1014554	1014559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_016911	CAA	2	6	1014604	1014609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_016911	GAA	2	6	1014623	1014628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_016911	AACA	2	8	1014631	1014638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6584	NC_016911	T	6	6	1014647	1014652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_016911	T	6	6	1014663	1014668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_016911	GGA	2	6	1014671	1014676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_016911	TA	3	6	1019812	1019817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_016911	TA	3	6	1019821	1019826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_016911	T	7	7	1019846	1019852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_016911	TAA	2	6	1019862	1019867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_016911	A	8	8	1019936	1019943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_016911	TAA	2	6	1019949	1019954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_016911	T	6	6	1019969	1019974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_016911	CCT	2	6	1020671	1020676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6595	NC_016911	TTAT	2	8	1020728	1020735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_016911	AATT	2	8	1020738	1020745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_016911	A	6	6	1020761	1020766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_016911	T	6	6	1020788	1020793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_016911	TAAT	2	8	1020807	1020814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_016911	AAG	2	6	1020874	1020879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_016911	AAT	2	6	1020914	1020919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_016911	TTCTT	2	10	1021875	1021884	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6603	NC_016911	TTG	2	6	1022221	1022226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_016911	ATT	2	6	1022293	1022298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_016911	A	7	7	1022313	1022319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_016911	T	6	6	1022324	1022329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_016911	ACA	2	6	1022390	1022395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_016911	CAA	2	6	1022399	1022404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_016911	CGA	2	6	1022768	1022773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6611	NC_016911	ATT	2	6	1023331	1023336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_016911	TAT	3	9	1023343	1023351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_016911	CTTA	2	8	1023365	1023372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6614	NC_016911	ATC	2	6	1023374	1023379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_016911	T	6	6	1023383	1023388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_016911	TCTA	2	8	1023397	1023404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6617	NC_016911	TTC	2	6	1023407	1023412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_016911	ATC	2	6	1023419	1023424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_016911	T	6	6	1023569	1023574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_016911	TAA	2	6	1023589	1023594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_016911	TTC	2	6	1023626	1023631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_016911	CTTT	2	8	1023663	1023670	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6623	NC_016911	TAA	2	6	1023682	1023687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_016911	TAT	2	6	1023702	1023707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_016911	ATAA	2	8	1023719	1023726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_016911	AT	3	6	1023765	1023770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_016911	AAAT	2	8	1023783	1023790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_016911	T	7	7	1024292	1024298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_016911	GCT	2	6	1024374	1024379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6631	NC_016911	T	6	6	1027961	1027966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_016911	AAGT	2	8	1027989	1027996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6633	NC_016911	TAT	2	6	1028010	1028015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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