MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 4443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016909	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016909	TGT	2	6	940	945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016909	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016909	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016909	TTC	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016909	TCT	2	6	7695	7700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016909	AAT	2	6	7738	7743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016909	GCT	2	6	7820	7825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016909	GAC	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016909	CAA	3	9	7851	7859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016909	TAT	2	6	8966	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016909	CAA	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016909	ATG	2	6	9017	9022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016909	AGC	2	6	9034	9039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016909	ATA	2	6	9064	9069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016909	CAA	2	6	9139	9144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016909	AAG	2	6	9214	9219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016909	TAA	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016909	AGA	2	6	9536	9541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016909	TAT	2	6	10209	10214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016909	AAC	2	6	10215	10220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016909	TTG	2	6	10323	10328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016909	AAT	2	6	10415	10420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016909	ATC	2	6	10451	10456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016909	GTT	2	6	10471	10476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016909	GGT	2	6	10503	10508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016909	GTA	2	6	10558	10563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016909	ACT	2	6	10604	10609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016909	TTG	2	6	10619	10624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016909	CTT	2	6	10669	10674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016909	TAT	2	6	10751	10756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016909	ATA	2	6	10872	10877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016909	TAC	2	6	10882	10887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016909	AAC	2	6	10946	10951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016909	ATT	2	6	10984	10989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016909	TAT	2	6	11000	11005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016909	TGG	2	6	11161	11166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016909	AGA	2	6	11262	11267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016909	CAT	2	6	11338	11343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016909	TTA	2	6	11377	11382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016909	ATA	2	6	11445	11450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016909	TTA	2	6	12362	12367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016909	GTG	2	6	12466	12471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016909	TCG	2	6	12574	12579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016909	TTA	2	6	12684	12689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016909	TAA	2	6	14765	14770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016909	GTT	2	6	14786	14791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016909	GAA	2	6	14804	14809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016909	GTC	2	6	17903	17908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016909	ATT	2	6	17978	17983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016909	TTA	2	6	18150	18155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016909	TTA	2	6	18160	18165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016909	TTA	2	6	18234	18239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016909	ATT	2	6	19310	19315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016909	GTA	2	6	19532	19537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016909	TAC	2	6	19678	19683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016909	TCC	2	6	19687	19692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016909	AAT	2	6	19803	19808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016909	TTG	2	6	19889	19894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016909	AAT	2	6	19929	19934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016909	ATT	2	6	19971	19976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016909	ACC	2	6	25924	25929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016909	AAT	2	6	26004	26009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016909	CAC	2	6	26023	26028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016909	TAC	2	6	26240	26245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016909	AAT	2	6	26381	26386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016909	CTT	2	6	26709	26714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016909	AAT	2	6	26788	26793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016909	AGT	2	6	26907	26912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016909	TAA	2	6	26971	26976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016909	TAA	2	6	26992	26997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016909	GAT	2	6	28086	28091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016909	GTA	2	6	28158	28163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016909	ATG	2	6	28174	28179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016909	ATA	2	6	28371	28376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016909	TAT	2	6	28515	28520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016909	ATG	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016909	TAA	2	6	29987	29992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016909	CGA	2	6	31144	31149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016909	TTA	2	6	32064	32069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016909	TAA	2	6	32125	32130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016909	ATA	2	6	32157	32162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016909	GGA	2	6	32199	32204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016909	CTC	2	6	32815	32820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016909	ACT	2	6	32917	32922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016909	CAA	2	6	32949	32954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016909	ATA	2	6	34676	34681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016909	ATT	2	6	35000	35005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016909	AAT	2	6	36106	36111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016909	CTT	2	6	36463	36468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016909	TTC	3	9	36523	36531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016909	TGA	2	6	36621	36626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016909	GAT	2	6	36696	36701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016909	TAT	2	6	37358	37363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016909	CGC	2	6	38571	38576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016909	TAT	2	6	38777	38782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016909	GAG	2	6	38801	38806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016909	GTG	2	6	38846	38851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016909	TTA	2	6	38887	38892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016909	AAT	2	6	38917	38922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016909	ATA	2	6	38948	38953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016909	CAC	2	6	39697	39702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016909	ATT	2	6	39808	39813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016909	ATA	2	6	39817	39822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016909	GAA	2	6	39833	39838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016909	AAT	2	6	39849	39854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016909	TCT	2	6	39935	39940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016909	GAA	2	6	40007	40012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016909	ATT	2	6	40013	40018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016909	ATA	2	6	40044	40049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016909	TTC	2	6	40075	40080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016909	ATT	2	6	40193	40198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016909	CTT	2	6	40215	40220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016909	TAA	2	6	40260	40265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016909	CTT	2	6	40277	40282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016909	AGT	2	6	40299	40304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016909	AGC	2	6	40395	40400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016909	TTG	2	6	40436	40441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016909	TTG	2	6	40467	40472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016909	TAA	2	6	40563	40568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016909	TAT	2	6	40748	40753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016909	AAT	2	6	40804	40809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016909	TAA	2	6	41011	41016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016909	CTT	2	6	41366	41371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016909	ATC	2	6	41460	41465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016909	TCA	2	6	41588	41593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016909	ATT	2	6	41617	41622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016909	ACT	2	6	41643	41648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016909	TCT	2	6	42027	42032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016909	TTA	2	6	42060	42065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016909	AAT	2	6	42074	42079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016909	TCT	2	6	42176	42181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016909	CAT	2	6	42190	42195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016909	ATT	2	6	42232	42237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016909	TTG	3	9	42290	42298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016909	CTA	2	6	42325	42330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016909	GTT	2	6	42415	42420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016909	TAA	2	6	42428	42433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016909	TAA	2	6	42461	42466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016909	GAT	2	6	42528	42533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016909	TAT	2	6	42564	42569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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