MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 7954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016909	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016909	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016909	TGT	2	6	940	945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016909	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016909	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016909	T	7	7	6326	6332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016909	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016909	TTC	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016909	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016909	TCT	2	6	7695	7700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016909	AAT	2	6	7738	7743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016909	T	7	7	7792	7798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016909	GCT	2	6	7820	7825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016909	GAC	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016909	CAA	3	9	7851	7859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016909	TA	3	6	8949	8954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016909	TAT	2	6	8966	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016909	CAA	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016909	ATG	2	6	9017	9022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016909	AGC	2	6	9034	9039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016909	ATA	2	6	9064	9069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016909	CAA	2	6	9139	9144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016909	A	7	7	9170	9176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016909	AAG	2	6	9214	9219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016909	AATTA	2	10	9220	9229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016909	TAA	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016909	AGA	2	6	9536	9541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016909	A	6	6	9603	9608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016909	TAT	2	6	10209	10214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016909	AAC	2	6	10215	10220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016909	TTG	2	6	10323	10328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016909	AAT	2	6	10415	10420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016909	ATC	2	6	10451	10456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016909	GTT	2	6	10471	10476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016909	GGT	2	6	10503	10508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016909	GTA	2	6	10558	10563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016909	ACT	2	6	10604	10609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016909	TTG	2	6	10619	10624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016909	CTT	2	6	10669	10674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016909	TAT	2	6	10751	10756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016909	T	7	7	10772	10778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016909	AAAGAC	2	12	10782	10793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016909	AGAAT	2	10	10837	10846	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016909	A	6	6	10858	10863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016909	ATA	2	6	10872	10877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016909	TAC	2	6	10882	10887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016909	ATTA	2	8	10891	10898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016909	AAC	2	6	10946	10951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016909	ATT	2	6	10984	10989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016909	TAT	2	6	11000	11005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016909	T	6	6	11023	11028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016909	ATTA	2	8	11105	11112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016909	A	6	6	11117	11122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016909	TGG	2	6	11161	11166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016909	GAATT	2	10	11193	11202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016909	AGA	2	6	11262	11267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016909	T	6	6	11313	11318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016909	CAT	2	6	11338	11343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016909	TTA	2	6	11377	11382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016909	ATCT	2	8	11411	11418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016909	ATA	2	6	11445	11450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016909	A	6	6	11487	11492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016909	G	6	6	11493	11498	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016909	T	6	6	11649	11654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016909	A	7	7	11682	11688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016909	T	7	7	12332	12338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016909	TTA	2	6	12362	12367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016909	TTAA	2	8	12376	12383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016909	TAACG	2	10	12437	12446	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016909	GTG	2	6	12466	12471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016909	TA	3	6	12544	12549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016909	TCG	2	6	12574	12579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016909	GCTCT	2	10	12615	12624	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016909	TTA	2	6	12684	12689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016909	TTAG	2	8	14752	14759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016909	TAA	2	6	14765	14770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016909	GTT	2	6	14786	14791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016909	GAA	2	6	14804	14809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016909	TTGC	2	8	16334	16341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016909	GTC	2	6	17903	17908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016909	A	6	6	17950	17955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016909	T	7	7	17971	17977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016909	ATT	2	6	17978	17983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016909	AGAACA	2	12	18064	18075	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016909	T	7	7	18136	18142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016909	TTA	2	6	18150	18155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016909	TTA	2	6	18160	18165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016909	TTA	2	6	18234	18239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016909	T	6	6	18247	18252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016909	A	6	6	18519	18524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016909	A	6	6	18532	18537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016909	ATT	2	6	19310	19315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016909	GTA	2	6	19532	19537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016909	TA	3	6	19602	19607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016909	T	6	6	19608	19613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016909	T	6	6	19653	19658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016909	TAC	2	6	19678	19683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016909	TCC	2	6	19687	19692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016909	AAT	2	6	19803	19808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016909	AGTA	2	8	19814	19821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016909	AT	3	6	19832	19837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016909	AAAC	2	8	19864	19871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016909	A	6	6	19874	19879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016909	A	7	7	19882	19888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016909	TTG	2	6	19889	19894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016909	AAT	2	6	19929	19934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016909	TAAA	2	8	19939	19946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016909	ATT	2	6	19971	19976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016909	AT	3	6	20117	20122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016909	TTAT	2	8	20137	20144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016909	TTTAA	2	10	20164	20173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016909	TA	3	6	25820	25825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016909	ACTA	2	8	25870	25877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016909	ACC	2	6	25924	25929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016909	TATAA	2	10	25987	25996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016909	AAT	2	6	26004	26009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016909	CAC	2	6	26023	26028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016909	TAC	2	6	26240	26245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016909	AAT	2	6	26381	26386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016909	AT	3	6	26674	26679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016909	CTT	2	6	26709	26714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016909	AAT	2	6	26788	26793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016909	CAAATA	2	12	26887	26898	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016909	AGT	2	6	26907	26912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016909	A	6	6	26952	26957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016909	TAA	2	6	26971	26976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016909	TAA	2	6	26992	26997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016909	TAAAGT	2	12	27050	27061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016909	AG	3	6	27072	27077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016909	GAT	2	6	28086	28091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016909	GTA	2	6	28158	28163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016909	ATG	2	6	28174	28179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016909	ATA	2	6	28371	28376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016909	TTTAGG	2	12	28428	28439	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016909	A	7	7	28466	28472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016909	A	6	6	28489	28494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016909	TAT	2	6	28515	28520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016909	A	6	6	28560	28565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016909	TAAA	2	8	28581	28588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016909	AT	4	8	28589	28596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016909	AGGA	2	8	28639	28646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016909	ATG	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016909	TAAA	2	8	28671	28678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016909	GCTA	2	8	28681	28688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016909	A	7	7	29913	29919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016909	TAAT	2	8	29928	29935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016909	A	6	6	29937	29942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016909	TAA	2	6	29987	29992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016909	A	6	6	30036	30041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016909	CGA	2	6	31144	31149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_016909	TAA	2	6	32125	32130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016909	ATA	2	6	32157	32162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_016909	AT	3	6	37477	37482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_016909	AACA	2	8	38759	38766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
182	NC_016909	TAT	2	6	38777	38782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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