MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 4392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016908	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016908	TGT	2	6	940	945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016908	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016908	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016908	TTC	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016908	TCT	2	6	7693	7698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016908	AAT	2	6	7736	7741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016908	GCT	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016908	GAC	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016908	CAA	3	9	7849	7857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016908	TAT	2	6	8964	8969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016908	CAA	2	6	8971	8976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016908	ATG	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016908	AGC	2	6	9032	9037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016908	ATA	2	6	9062	9067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016908	CAA	2	6	9137	9142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016908	AAG	2	6	9212	9217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016908	TAA	2	6	9450	9455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016908	AGA	2	6	9534	9539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016908	TAT	2	6	10207	10212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016908	AAC	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016908	TTG	2	6	10321	10326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016908	AAT	2	6	10413	10418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016908	ATC	2	6	10449	10454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016908	GTT	2	6	10469	10474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016908	GGT	2	6	10501	10506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016908	GTA	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016908	ACT	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016908	TTG	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016908	CTT	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016908	TAT	2	6	10749	10754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016908	ATA	2	6	10870	10875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016908	TAC	2	6	10880	10885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016908	AAC	2	6	10944	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016908	ATT	2	6	10982	10987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016908	TAT	2	6	10998	11003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016908	TGG	2	6	11159	11164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016908	AGA	2	6	11260	11265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016908	CAT	2	6	11336	11341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016908	TTA	2	6	11375	11380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016908	ATA	2	6	11443	11448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016908	TCG	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016908	TTA	2	6	12682	12687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016908	TAA	2	6	14763	14768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016908	GTT	2	6	14784	14789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016908	GAA	2	6	14802	14807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016908	GTC	2	6	17901	17906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016908	ATT	2	6	17976	17981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016908	TTA	2	6	18148	18153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016908	TTA	2	6	18158	18163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016908	TTA	2	6	18232	18237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016908	ATG	2	6	18801	18806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016908	AAG	2	6	18813	18818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016908	ACA	2	6	18918	18923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016908	ATA	2	6	18928	18933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016908	ATA	2	6	18988	18993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016908	ATA	2	6	19050	19055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016908	GCA	2	6	19071	19076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016908	TAA	2	6	19078	19083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016908	GCT	2	6	19095	19100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016908	AAT	2	6	19189	19194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016908	TAA	2	6	19205	19210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016908	GTA	2	6	19218	19223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016908	ATC	2	6	19233	19238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016908	ATT	2	6	19308	19313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016908	GTA	2	6	19530	19535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016908	AAT	2	6	19801	19806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016908	TTG	2	6	19887	19892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016908	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016908	ATT	2	6	19969	19974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016908	ACC	2	6	25932	25937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016908	AAT	2	6	26012	26017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016908	CAC	2	6	26031	26036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016908	TAC	2	6	26248	26253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016908	AAT	2	6	26389	26394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016908	CTT	2	6	26717	26722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016908	AAT	2	6	26796	26801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016908	AGT	2	6	26915	26920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016908	TAA	2	6	26979	26984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016908	TAA	2	6	27000	27005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016908	GAT	2	6	28094	28099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016908	GTA	2	6	28166	28171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016908	ATG	2	6	28182	28187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016908	ATA	2	6	28379	28384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016908	TAT	2	6	28523	28528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016908	ATG	2	6	28664	28669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016908	TAA	2	6	29995	30000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016908	CGA	2	6	31152	31157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016908	TTA	2	6	32072	32077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016908	TAA	2	6	32133	32138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016908	ATA	2	6	32165	32170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016908	GGA	2	6	32207	32212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016908	CTC	2	6	32823	32828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016908	ACT	2	6	32925	32930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016908	CAA	2	6	32957	32962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016908	ATA	2	6	34684	34689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016908	ATT	2	6	35008	35013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016908	AAT	2	6	36114	36119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016908	CTT	2	6	36471	36476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016908	TTC	3	9	36531	36539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016908	TGA	2	6	36629	36634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016908	GAT	2	6	36704	36709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016908	AAT	2	6	37327	37332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016908	TAT	2	6	37366	37371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016908	CGC	2	6	38579	38584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016908	TAT	2	6	38785	38790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016908	GAG	2	6	38809	38814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016908	GTG	2	6	38854	38859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016908	TTA	2	6	38895	38900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016908	AAT	2	6	38925	38930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016908	ATA	2	6	38956	38961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016908	CAC	2	6	39705	39710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016908	ATT	2	6	39816	39821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016908	ATA	2	6	39825	39830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016908	GAA	2	6	39841	39846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016908	AAT	2	6	39857	39862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016908	TCT	2	6	39943	39948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016908	GAA	2	6	40015	40020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016908	ATT	2	6	40021	40026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016908	ATA	2	6	40052	40057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016908	TTC	2	6	40083	40088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016908	ATT	2	6	40201	40206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016908	CTT	2	6	40223	40228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016908	TAA	2	6	40268	40273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016908	CTT	2	6	40285	40290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016908	AGT	2	6	40307	40312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016908	AGC	2	6	40403	40408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016908	TTG	2	6	40444	40449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016908	TTG	2	6	40475	40480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016908	TAA	2	6	40571	40576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016908	TAT	2	6	40756	40761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016908	AAT	2	6	40812	40817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016908	TAA	2	6	41017	41022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016908	CTT	2	6	41372	41377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016908	ATC	2	6	41466	41471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016908	TCA	2	6	41594	41599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016908	ATT	2	6	41623	41628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016908	ACT	2	6	41649	41654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016908	TCT	2	6	42033	42038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016908	TTA	2	6	42066	42071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016908	AAT	2	6	42080	42085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_016908	TAA	2	6	131422	131427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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