MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 7867

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016908	TCAA	2	8	180769	180776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_016908	AAC	2	6	180778	180783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016908	T	7	7	180798	180804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016908	CTT	2	6	180859	180864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_016908	AAG	2	6	180921	180926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016908	T	7	7	180951	180957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016908	AAT	2	6	181000	181005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016908	ATT	2	6	181038	181043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016908	A	7	7	181127	181133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016908	TAT	2	6	181134	181139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016908	CAA	2	6	181149	181154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_016908	AAATC	2	10	181166	181175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_016908	TTTAA	2	10	181234	181243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016908	TATTT	2	10	181272	181281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016908	ATAA	2	8	181349	181356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016908	TA	3	6	181366	181371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016908	ATT	2	6	181405	181410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016908	TAA	2	6	181438	181443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016908	TTA	2	6	181462	181467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016908	A	8	8	181475	181482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016908	TGA	2	6	181485	181490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016908	ATT	2	6	181519	181524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016908	TCAG	2	8	181575	181582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_016908	A	6	6	185737	185742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016908	T	6	6	185747	185752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016908	GAG	2	6	185859	185864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016908	TA	3	6	185938	185943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016908	GTC	2	6	190122	190127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_016908	A	6	6	190232	190237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016908	ATA	2	6	190285	190290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016908	GGT	2	6	190347	190352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016908	CTAG	2	8	190373	190380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_016908	TAC	2	6	190403	190408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_016908	ATT	2	6	190411	190416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016908	A	7	7	190420	190426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016908	T	6	6	190444	190449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016908	ATT	2	6	191677	191682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016908	A	6	6	191715	191720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016908	ATAA	2	8	191796	191803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016908	ATA	2	6	191822	191827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016908	GTC	2	6	193381	193386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016908	AGC	2	6	193393	193398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016908	TTAC	2	8	193448	193455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_016908	ATG	2	6	193470	193475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016908	A	6	6	193477	193482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016908	AT	5	10	194390	194399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016908	AAGAG	2	10	194428	194437	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016908	TA	3	6	194933	194938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016908	TAA	2	6	194953	194958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016908	TGT	2	6	196789	196794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016908	ATG	2	6	196800	196805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016908	A	7	7	196902	196908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016908	TAA	2	6	196952	196957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016908	CAA	2	6	197048	197053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_016908	GTT	2	6	199211	199216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016908	TCA	2	6	199233	199238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_016908	T	7	7	199299	199305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016908	ATT	2	6	199306	199311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016908	T	6	6	199310	199315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016908	ATG	2	6	199348	199353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016908	A	6	6	199503	199508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016908	ATA	2	6	200292	200297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016908	T	6	6	200319	200324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016908	TAA	2	6	201076	201081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016908	AGTA	2	8	201088	201095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016908	TTA	2	6	201179	201184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016908	ACG	2	6	201186	201191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_016908	T	6	6	201247	201252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016908	TAA	2	6	201262	201267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016908	A	6	6	201298	201303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016908	GCA	2	6	201315	201320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_016908	A	6	6	201320	201325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016908	AAT	2	6	202528	202533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016908	TTG	2	6	202580	202585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016908	GTA	2	6	202621	202626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016908	CAA	2	6	202710	202715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_016908	GCT	2	6	202724	202729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_016908	TAT	2	6	206028	206033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016908	GTC	2	6	206095	206100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_016908	TTTAT	2	10	206175	206184	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016908	A	6	6	206191	206196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016908	T	6	6	206209	206214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016908	TTA	2	6	206226	206231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016908	ACC	2	6	206237	206242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_016908	CTTT	2	8	206248	206255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_016908	T	7	7	206253	206259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016908	T	6	6	206261	206266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016908	AT	3	6	206275	206280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016908	TTG	2	6	206546	206551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016908	TTG	2	6	206602	206607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016908	CTG	2	6	206623	206628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_016908	ATT	2	6	206669	206674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016908	T	6	6	206679	206684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016908	CAA	2	6	206747	206752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_016908	CAA	2	6	206785	206790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_016908	TTTA	2	8	207379	207386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016908	AT	3	6	207390	207395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016908	A	6	6	207519	207524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016908	T	6	6	207540	207545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016908	ATT	2	6	207546	207551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016908	GCT	2	6	207578	207583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_016908	CAA	2	6	207608	207613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_016908	ACA	2	6	207643	207648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_016908	AATTA	2	10	210282	210291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016908	TAAAT	2	10	210299	210308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016908	TAA	2	6	210314	210319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016908	AT	3	6	210325	210330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016908	TAAAA	2	10	210334	210343	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016908	A	6	6	210340	210345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016908	TATT	2	8	210377	210384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016908	ATA	2	6	210405	210410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016908	TATTTA	2	12	210425	210436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016908	ATA	2	6	210441	210446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016908	TGAT	2	8	210453	210460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016908	TTA	2	6	210461	210466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016908	ATT	2	6	210728	210733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016908	AAG	2	6	210755	210760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016908	GTT	2	6	210935	210940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016908	TAA	2	6	211019	211024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016908	TGC	2	6	211041	211046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_016908	TATT	2	8	211058	211065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016908	ATG	2	6	211305	211310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016908	A	6	6	211316	211321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016908	TAA	2	6	211945	211950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016908	TTA	2	6	211982	211987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016908	TTG	3	9	212001	212009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016908	T	6	6	212021	212026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016908	TC	4	8	212036	212043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_016908	TAT	2	6	212085	212090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016908	T	6	6	212111	212116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016908	T	6	6	212165	212170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016908	ATA	2	6	212227	212232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016908	T	7	7	212254	212260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016908	ATT	2	6	212309	212314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016908	AGA	2	6	212366	212371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016908	ATTAT	2	10	212457	212466	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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