MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016835	GA	3	6	9214	9219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016835	TA	3	6	12784	12789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016835	TA	4	8	18686	18693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016835	TG	3	6	18754	18759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016835	GT	3	6	24524	24529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016835	GA	3	6	32898	32903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016835	CA	3	6	38866	38871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016835	CG	3	6	39084	39089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016835	AC	3	6	39210	39215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016835	TA	3	6	52080	52085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016835	TA	3	6	52149	52154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016835	GT	3	6	62768	62773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016835	GC	3	6	66647	66652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016835	CG	3	6	66870	66875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016835	GA	3	6	66993	66998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016835	AG	3	6	67003	67008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016835	CT	3	6	67022	67027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016835	AG	3	6	70634	70639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016835	TG	3	6	70682	70687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016835	GA	3	6	73939	73944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016835	TC	3	6	84898	84903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016835	TC	3	6	86922	86927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016835	GA	3	6	88186	88191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016835	CA	3	6	96048	96053	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016835	CA	3	6	96067	96072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016835	AT	3	6	96497	96502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016835	CG	3	6	100433	100438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016835	AT	3	6	102972	102977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016835	GC	3	6	107576	107581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016835	TC	4	8	114761	114768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016835	TA	3	6	117538	117543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016835	AT	3	6	134092	134097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016835	GC	3	6	134333	134338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016835	AT	3	6	136148	136153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016835	GC	4	8	136339	136346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016835	AT	3	6	136766	136771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016835	GC	3	6	138909	138914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016835	GC	3	6	138986	138991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016835	CA	3	6	141295	141300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016835	CA	3	6	142231	142236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016835	GT	3	6	143260	143265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016835	TA	3	6	143744	143749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016835	GA	3	6	145821	145826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016835	TG	3	6	158085	158090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016835	GT	3	6	166053	166058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016835	TA	3	6	166902	166907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016835	TG	3	6	170929	170934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016835	CA	3	6	171275	171280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016835	AC	3	6	180897	180902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016835	GT	3	6	186253	186258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016835	TA	3	6	186406	186411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016835	GA	3	6	186944	186949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016835	TA	4	8	193991	193998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016835	TC	3	6	196198	196203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016835	CT	3	6	198165	198170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016835	TA	3	6	220037	220042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016835	AT	4	8	220240	220247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016835	TC	3	6	226921	226926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016835	CT	3	6	232599	232604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016835	AT	3	6	236931	236936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016835	AT	3	6	241116	241121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016835	AG	3	6	241145	241150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016835	AT	3	6	246747	246752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016835	TA	3	6	246757	246762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016835	AT	3	6	246774	246779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016835	TC	5	10	252856	252865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016835	TG	3	6	253021	253026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016835	TA	3	6	253633	253638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016835	AC	3	6	255396	255401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016835	TC	3	6	263062	263067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016835	GA	3	6	263133	263138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016835	GC	3	6	272339	272344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016835	TC	3	6	272415	272420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016835	GA	3	6	272588	272593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016835	CT	3	6	275151	275156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016835	CG	3	6	275355	275360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016835	TC	3	6	275464	275469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016835	AC	3	6	276922	276927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016835	AT	3	6	282146	282151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016835	AT	3	6	285685	285690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016835	AT	3	6	286061	286066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016835	GA	3	6	286146	286151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016835	TC	3	6	291586	291591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016835	CT	3	6	291651	291656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016835	CA	3	6	297887	297892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016835	AT	3	6	299377	299382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016835	AG	3	6	305343	305348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016835	TG	3	6	305516	305521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016835	TC	3	6	305763	305768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016835	AG	3	6	306437	306442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016835	AG	3	6	306515	306520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016835	TA	3	6	307564	307569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016835	TG	3	6	313746	313751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016835	TC	3	6	315994	315999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016835	CT	3	6	336609	336614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016835	GA	3	6	339437	339442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016835	GC	3	6	340653	340658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016835	TA	3	6	340724	340729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016835	CA	3	6	345702	345707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016835	GA	3	6	345800	345805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016835	CG	3	6	351055	351060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016835	TA	3	6	351658	351663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016835	AT	3	6	351777	351782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016835	TA	3	6	354680	354685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016835	TA	3	6	359649	359654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016835	TA	3	6	363296	363301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016835	GC	3	6	363809	363814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016835	GA	3	6	369984	369989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016835	TA	3	6	387790	387795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016835	TA	3	6	389629	389634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016835	AG	3	6	401440	401445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016835	TA	3	6	401494	401499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016835	AC	3	6	401602	401607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016835	TC	3	6	403887	403892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016835	AT	3	6	405353	405358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016835	CA	3	6	406769	406774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016835	GT	3	6	410968	410973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016835	CG	3	6	413630	413635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016835	TC	4	8	414197	414204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016835	AT	4	8	418779	418786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016835	TA	4	8	419786	419793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016835	AG	3	6	419871	419876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016835	AT	3	6	419890	419895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016835	GC	3	6	420033	420038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016835	CA	3	6	426937	426942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016835	GA	3	6	438755	438760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016835	AC	3	6	439533	439538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016835	AT	5	10	445932	445941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016835	AT	3	6	446071	446076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016835	GA	4	8	446311	446318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016835	AG	3	6	446342	446347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016835	TC	3	6	446447	446452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016835	CA	3	6	446864	446869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016835	GC	3	6	447446	447451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016835	TA	3	6	450013	450018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016835	TA	3	6	451800	451805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016835	AT	3	6	457214	457219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016835	AC	3	6	457361	457366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.