MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 6998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	ATG	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016818	CAG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016818	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016818	GGC	2	6	6533	6538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016818	GAG	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016818	ACA	2	6	9402	9407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016818	ACG	2	6	9466	9471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016818	AGG	2	6	9473	9478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016818	TTC	2	6	9495	9500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016818	TCA	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016818	GGA	2	6	9532	9537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016818	CAA	2	6	9543	9548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016818	ATC	2	6	10114	10119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016818	AAG	2	6	10128	10133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016818	GGA	2	6	10607	10612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016818	TCC	2	6	10623	10628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016818	TGA	2	6	11936	11941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016818	CCA	2	6	11942	11947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016818	ACC	2	6	11977	11982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016818	AGC	2	6	11992	11997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016818	TAT	2	6	12067	12072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016818	TAA	2	6	12092	12097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016818	ATT	2	6	12133	12138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016818	GTT	2	6	16589	16594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016818	GAA	2	6	16678	16683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016818	GAA	2	6	16700	16705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016818	AGA	2	6	21304	21309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016818	TGA	2	6	21333	21338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016818	TGA	2	6	22516	22521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016818	TTA	2	6	23224	23229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016818	GGA	2	6	23312	23317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016818	GCG	2	6	23328	23333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016818	GTC	2	6	24439	24444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016818	CCT	2	6	24521	24526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016818	ATT	2	6	24604	24609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016818	GCG	2	6	30081	30086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016818	GTT	2	6	30097	30102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016818	GAA	3	9	30220	30228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016818	TGA	2	6	30990	30995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016818	AAT	2	6	31047	31052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016818	AAT	2	6	31083	31088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016818	AAT	2	6	31300	31305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016818	GTC	2	6	31306	31311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016818	TCT	2	6	31352	31357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016818	ATC	2	6	34451	34456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016818	TCT	2	6	36651	36656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016818	CTT	2	6	36749	36754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016818	TTC	2	6	36755	36760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016818	TAA	2	6	38807	38812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016818	AAT	2	6	38852	38857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016818	AAC	2	6	39050	39055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016818	TTG	2	6	41094	41099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016818	GGC	2	6	41111	41116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016818	AAT	2	6	45805	45810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016818	CTC	2	6	46337	46342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016818	AGC	2	6	46358	46363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016818	TGC	2	6	47452	47457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016818	ATA	2	6	47482	47487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016818	ACG	2	6	47515	47520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016818	GCT	2	6	48349	48354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016818	GCG	2	6	50494	50499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016818	AGA	2	6	50543	50548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016818	CCG	2	6	50614	50619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016818	CAT	2	6	50630	50635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016818	GGC	2	6	50649	50654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016818	GGC	2	6	51307	51312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016818	AAT	2	6	51506	51511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016818	ATT	2	6	53068	53073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016818	TAA	2	6	53082	53087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016818	GAT	2	6	53113	53118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016818	GAT	2	6	54236	54241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016818	GCT	2	6	59830	59835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016818	GAG	2	6	59863	59868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016818	CTG	2	6	60595	60600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016818	AAT	2	6	62250	62255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016818	CCT	2	6	62294	62299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016818	TAT	2	6	62330	62335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016818	ATC	2	6	62379	62384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016818	AGA	2	6	64048	64053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016818	CTT	2	6	73802	73807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016818	GTT	2	6	73849	73854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016818	ATA	2	6	73863	73868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016818	ATT	2	6	73885	73890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016818	TGA	2	6	73905	73910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016818	TAT	2	6	73911	73916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016818	ATT	2	6	73917	73922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016818	TAA	2	6	74124	74129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016818	ATT	2	6	75738	75743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016818	AAC	2	6	75835	75840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016818	AAG	2	6	75849	75854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016818	GAA	2	6	78905	78910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016818	ATA	2	6	78934	78939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016818	GAA	2	6	80533	80538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016818	ATG	2	6	80553	80558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016818	GAC	2	6	80571	80576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016818	CCG	2	6	80586	80591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016818	TCG	2	6	82394	82399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016818	CTG	2	6	83714	83719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016818	GAG	2	6	84371	84376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016818	CAG	2	6	85897	85902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016818	GAT	2	6	87586	87591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016818	ATC	2	6	87650	87655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016818	TTC	2	6	87700	87705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016818	TGA	2	6	89467	89472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016818	CTG	2	6	90099	90104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016818	AAG	2	6	90152	90157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016818	GGA	2	6	90262	90267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016818	TGA	2	6	90547	90552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016818	TCA	2	6	91261	91266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016818	CGC	2	6	95910	95915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016818	GAG	2	6	95956	95961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016818	ACA	2	6	97430	97435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016818	TGT	2	6	98180	98185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016818	TTG	2	6	103762	103767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016818	TTG	2	6	103802	103807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016818	ATT	2	6	103891	103896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016818	AAT	2	6	103900	103905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016818	ATA	2	6	105455	105460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016818	CTT	2	6	105993	105998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016818	TGT	2	6	106539	106544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016818	AGG	2	6	106568	106573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016818	CCT	2	6	106580	106585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_016818	GGC	2	6	108466	108471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016818	GTA	2	6	108679	108684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016818	AGG	2	6	108705	108710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016818	CAT	2	6	108778	108783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016818	GTA	2	6	108844	108849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016818	AGG	2	6	108870	108875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016818	CAT	2	6	108943	108948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016818	ATG	2	6	109874	109879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016818	CAA	2	6	110536	110541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016818	TCG	2	6	110623	110628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016818	AGA	3	9	117414	117422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016818	GAG	2	6	117456	117461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016818	TCC	2	6	117554	117559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016818	GGA	2	6	119073	119078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016818	CAC	2	6	120361	120366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016818	GCT	2	6	120466	120471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016818	TCA	2	6	120507	120512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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