MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016818	TGA	2	6	1653246	1653251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016818	GCT	2	6	1653291	1653296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_016818	TTTC	2	8	1655574	1655581	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_016818	AAT	2	6	1658445	1658450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016818	TATG	2	8	1658520	1658527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016818	TCC	2	6	1658546	1658551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_016818	GAT	2	6	1658571	1658576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016818	TCC	2	6	1658603	1658608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_016818	TGA	2	6	1658907	1658912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016818	AAC	2	6	1658918	1658923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_016818	CAG	2	6	1658942	1658947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_016818	CCG	2	6	1658956	1658961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_016818	CGT	2	6	1659010	1659015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_016818	AAT	2	6	1659028	1659033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_016818	T	6	6	1659061	1659066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016818	A	7	7	1659069	1659075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016818	AAT	2	6	1659106	1659111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_016818	A	6	6	1659112	1659117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016818	GT	3	6	1659118	1659123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016818	AAAG	2	8	1659137	1659144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_016818	TGT	2	6	1659377	1659382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_016818	GTTGA	2	10	1659388	1659397	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016818	TGC	2	6	1659444	1659449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016818	GAT	2	6	1660730	1660735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016818	GAT	2	6	1660780	1660785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016818	A	7	7	1660847	1660853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016818	TCC	2	6	1660882	1660887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_016818	T	6	6	1660898	1660903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016818	ACC	2	6	1660987	1660992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_016818	GGA	2	6	1661055	1661060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_016818	ATC	2	6	1662055	1662060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_016818	GC	3	6	1662080	1662085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_016818	TTTG	2	8	1662118	1662125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016818	TCA	2	6	1662158	1662163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_016818	A	6	6	1663895	1663900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016818	GAT	2	6	1663928	1663933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016818	CGC	2	6	1663978	1663983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_016818	CAT	2	6	1663989	1663994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_016818	CAA	2	6	1663996	1664001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_016818	GTGA	2	8	1671310	1671317	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016818	CATT	2	8	1671364	1671371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_016818	AAG	2	6	1671388	1671393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016818	TGC	2	6	1671432	1671437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_016818	ACA	2	6	1671463	1671468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_016818	TTTA	2	8	1671490	1671497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_016818	A	7	7	1671561	1671567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016818	TA	3	6	1671578	1671583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_016818	GCT	2	6	1671596	1671601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_016818	TCAGA	2	10	1673634	1673643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4050	NC_016818	CT	3	6	1673656	1673661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_016818	TG	3	6	1674234	1674239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016818	CTG	2	6	1674939	1674944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_016818	T	6	6	1674988	1674993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_016818	AAAG	2	8	1676291	1676298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_016818	AAT	2	6	1677644	1677649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_016818	GTG	2	6	1677711	1677716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016818	CTA	2	6	1677739	1677744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_016818	A	6	6	1677769	1677774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016818	ATCT	2	8	1677816	1677823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_016818	TC	3	6	1679304	1679309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_016818	TA	3	6	1679316	1679321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016818	GA	3	6	1679458	1679463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016818	TA	3	6	1679497	1679502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016818	AAGGA	2	10	1679503	1679512	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016818	ACAA	2	8	1680806	1680813	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_016818	A	8	8	1680823	1680830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016818	TCA	2	6	1680890	1680895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_016818	CAT	2	6	1680896	1680901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_016818	AAGA	2	8	1681022	1681029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016818	A	7	7	1681029	1681035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016818	AAT	2	6	1681100	1681105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016818	T	6	6	1681128	1681133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016818	CAA	2	6	1681301	1681306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_016818	GTC	2	6	1681358	1681363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_016818	TCA	2	6	1681404	1681409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_016818	ATT	2	6	1681421	1681426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_016818	AAC	2	6	1681427	1681432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_016818	T	6	6	1681448	1681453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016818	T	6	6	1684113	1684118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016818	GGA	2	6	1684817	1684822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_016818	TATT	2	8	1684823	1684830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016818	GAAGT	2	10	1689277	1689286	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016818	AGC	2	6	1689293	1689298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_016818	GC	3	6	1689368	1689373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_016818	AGGA	2	8	1689393	1689400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016818	A	6	6	1689420	1689425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016818	ATT	2	6	1689449	1689454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016818	AAT	2	6	1689500	1689505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_016818	TTTA	2	8	1690583	1690590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_016818	TCGTT	2	10	1690653	1690662	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4091	NC_016818	TCT	2	6	1691287	1691292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_016818	AAC	2	6	1692454	1692459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_016818	CAA	2	6	1692501	1692506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_016818	GAG	2	6	1696630	1696635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016818	T	7	7	1700121	1700127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016818	TAA	2	6	1700133	1700138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016818	T	7	7	1700191	1700197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_016818	T	6	6	1700219	1700224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016818	GC	3	6	1700241	1700246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_016818	AAT	2	6	1700252	1700257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016818	CTC	2	6	1700303	1700308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_016818	ACCTG	2	10	1700364	1700373	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4103	NC_016818	AAT	2	6	1700374	1700379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_016818	GC	3	6	1700597	1700602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4105	NC_016818	TTTG	2	8	1700610	1700617	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_016818	A	7	7	1700656	1700662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016818	TTC	2	6	1700685	1700690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_016818	TGA	2	6	1701250	1701255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016818	AAC	2	6	1701287	1701292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_016818	AATA	2	8	1703110	1703117	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016818	TTG	2	6	1703164	1703169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_016818	A	6	6	1703181	1703186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_016818	CTGA	2	8	1703771	1703778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_016818	A	9	9	1703783	1703791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016818	ATC	2	6	1704933	1704938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_016818	ATT	2	6	1704997	1705002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016818	A	7	7	1705112	1705118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016818	ATT	2	6	1705217	1705222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016818	ATT	2	6	1705246	1705251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016818	TGTA	3	12	1705807	1705818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_016818	TGTT	2	8	1705906	1705913	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016818	A	6	6	1708797	1708802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016818	ATG	2	6	1708823	1708828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016818	A	6	6	1709324	1709329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016818	CAA	2	6	1711541	1711546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_016818	CTT	2	6	1711567	1711572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_016818	AAT	2	6	1712137	1712142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_016818	AAG	2	6	1712151	1712156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_016818	TC	3	6	1712844	1712849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_016818	TAT	2	6	1712875	1712880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016818	TG	3	6	1712895	1712900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_016818	A	7	7	1713465	1713471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_016818	GCT	2	6	1713475	1713480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4155	NC_016818	CTC	3	9	1717394	1717402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4250	NC_016818	GA	3	6	1764047	1764052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_016818	TGT	2	6	1764219	1764224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4254	NC_016818	TTA	2	6	1764344	1764349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4257	NC_016818	TAA	2	6	1768298	1768303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_016818	GCC	2	6	1768349	1768354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4260	NC_016818	TCAT	2	8	1769872	1769879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4261	NC_016818	TTA	2	6	1769917	1769922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_016818	GAAC	2	8	1769951	1769958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4390	NC_016818	TGAT	2	8	1810123	1810130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_016818	TATTT	2	10	1810134	1810143	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_016818	CA	3	6	1810151	1810156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4393	NC_016818	AATA	2	8	1810192	1810199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4397	NC_016818	ATC	3	9	1811513	1811521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4398	NC_016818	AGG	2	6	1811543	1811548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_016818	TAT	2	6	1811593	1811598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_016818	AAC	2	6	1811666	1811671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4401	NC_016818	AC	3	6	1811683	1811688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4402	NC_016818	C	6	6	1811712	1811717	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4403	NC_016818	CG	3	6	1811722	1811727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4404	NC_016818	TAT	2	6	1811814	1811819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_016818	ATG	2	6	1811845	1811850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4406	NC_016818	T	6	6	1811865	1811870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4407	NC_016818	TTTC	2	8	1812450	1812457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4417	NC_016818	GTA	2	6	1813615	1813620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4430	NC_016818	TTA	2	6	1818746	1818751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4431	NC_016818	TGG	2	6	1820668	1820673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4432	NC_016818	TG	3	6	1820675	1820680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4433	NC_016818	TAACGC	2	12	1820692	1820703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4435	NC_016818	GCTG	2	8	1822159	1822166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4486	NC_016818	GTCA	2	8	1838926	1838933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4500	NC_016818	TGCG	2	8	1849303	1849310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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