MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016818	ACGAA	2	10	1456923	1456932	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3502	NC_016818	CGG	2	6	1456966	1456971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_016818	T	7	7	1457739	1457745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_016818	AGC	2	6	1457754	1457759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_016818	TCC	2	6	1458967	1458972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_016818	CTG	2	6	1459006	1459011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_016818	CTCC	2	8	1459045	1459052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3508	NC_016818	TGAAC	2	10	1459061	1459070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3509	NC_016818	GAG	2	6	1460483	1460488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016818	TAA	2	6	1461901	1461906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016818	CGG	2	6	1462009	1462014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_016818	ATG	3	9	1463097	1463105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016818	T	6	6	1463127	1463132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016818	A	6	6	1464777	1464782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016818	TTA	2	6	1468552	1468557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016818	CCG	2	6	1468596	1468601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_016818	TGTC	2	8	1468603	1468610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_016818	GAT	2	6	1468641	1468646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_016818	AGA	2	6	1468654	1468659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_016818	CAAA	2	8	1468670	1468677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_016818	TTA	2	6	1468688	1468693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016818	ATG	2	6	1468717	1468722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_016818	CGG	2	6	1468725	1468730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_016818	CAT	2	6	1468779	1468784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_016818	TTG	2	6	1468810	1468815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_016818	ATT	2	6	1468818	1468823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_016818	TCGT	2	8	1468844	1468851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_016818	AAT	2	6	1468878	1468883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_016818	CGA	2	6	1469025	1469030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_016818	TTAAT	2	10	1469033	1469042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_016818	ATT	2	6	1469047	1469052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016818	TCT	2	6	1469542	1469547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_016818	TGA	2	6	1475144	1475149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016818	ATG	2	6	1475157	1475162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016818	ACG	2	6	1475221	1475226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_016818	TGT	2	6	1476905	1476910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016818	GTC	2	6	1476944	1476949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_016818	A	7	7	1476950	1476956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_016818	TTA	2	6	1476977	1476982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016818	A	7	7	1476990	1476996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_016818	T	7	7	1477015	1477021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_016818	ACA	2	6	1477038	1477043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_016818	GTT	2	6	1477649	1477654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_016818	TTA	2	6	1477684	1477689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_016818	AT	3	6	1477720	1477725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_016818	G	6	6	1477745	1477750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_016818	TC	3	6	1477775	1477780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_016818	TAT	2	6	1477855	1477860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_016818	T	6	6	1477865	1477870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_016818	GTAA	2	8	1477896	1477903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_016818	ATG	2	6	1477915	1477920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_016818	CAT	2	6	1477953	1477958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_016818	ATC	2	6	1478026	1478031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_016818	ATT	2	6	1478050	1478055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_016818	ATGT	2	8	1478056	1478063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_016818	TTAG	2	8	1478823	1478830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_016818	GGCA	2	8	1479923	1479930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_016818	ATTT	2	8	1479937	1479944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_016818	ATG	2	6	1480021	1480026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_016818	CCG	2	6	1481330	1481335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_016818	ATAA	2	8	1481337	1481344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_016818	GCA	2	6	1481356	1481361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_016818	AAAT	2	8	1482879	1482886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016818	CGA	2	6	1482946	1482951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_016818	A	6	6	1483080	1483085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_016818	CAG	2	6	1483107	1483112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_016818	ATAA	2	8	1483701	1483708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_016818	GA	4	8	1483717	1483724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_016818	AAT	2	6	1483727	1483732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_016818	CGC	2	6	1483750	1483755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_016818	TGG	2	6	1483883	1483888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_016818	CGC	2	6	1483896	1483901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3573	NC_016818	GAG	2	6	1483932	1483937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_016818	A	8	8	1485471	1485478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_016818	ATC	2	6	1485494	1485499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_016818	AAT	2	6	1485533	1485538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_016818	GAT	2	6	1485568	1485573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_016818	GCTT	2	8	1485617	1485624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_016818	A	6	6	1485711	1485716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_016818	GAG	2	6	1485864	1485869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3585	NC_016818	ACCCC	2	10	1489802	1489811	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3586	NC_016818	GGGA	2	8	1489829	1489836	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_016818	CTC	2	6	1490755	1490760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_016818	AGG	2	6	1490804	1490809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_016818	GCA	2	6	1490811	1490816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_016818	AGC	2	6	1490830	1490835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_016818	TGA	2	6	1491968	1491973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_016818	CGC	2	6	1491984	1491989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_016818	TA	3	6	1491993	1491998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_016818	ATT	2	6	1492011	1492016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_016818	CAAT	2	8	1492050	1492057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_016818	T	8	8	1494661	1494668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_016818	ATT	2	6	1494762	1494767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_016818	TTTC	2	8	1494772	1494779	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_016818	CCG	2	6	1494810	1494815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_016818	CTCC	2	8	1496816	1496823	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3601	NC_016818	GGGGT	2	10	1496842	1496851	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016818	GAG	2	6	1496939	1496944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016818	AAGA	2	8	1497787	1497794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_016818	A	7	7	1497920	1497926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_016818	T	6	6	1499159	1499164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_016818	T	6	6	1499206	1499211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_016818	CTTTTT	2	12	1499252	1499263	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3608	NC_016818	T	7	7	1499259	1499265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016818	CGT	2	6	1499269	1499274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_016818	T	6	6	1499278	1499283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_016818	TG	3	6	1499349	1499354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_016818	CTT	2	6	1501578	1501583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_016818	CTCC	2	8	1502610	1502617	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3614	NC_016818	GAG	2	6	1502629	1502634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_016818	A	6	6	1502637	1502642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_016818	A	6	6	1502692	1502697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_016818	T	7	7	1502775	1502781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_016818	CCTG	2	8	1503160	1503167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_016818	CAG	2	6	1503244	1503249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3621	NC_016818	TGA	2	6	1505146	1505151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_016818	T	7	7	1505185	1505191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016818	TGCA	2	8	1505931	1505938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_016818	GGC	3	9	1505946	1505954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_016818	GGC	2	6	1507109	1507114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_016818	AG	3	6	1507213	1507218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_016818	CT	3	6	1507232	1507237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_016818	TC	3	6	1507242	1507247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3629	NC_016818	T	7	7	1507253	1507259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_016818	GC	3	6	1507263	1507268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_016818	CGCT	2	8	1507271	1507278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3632	NC_016818	ACC	2	6	1507294	1507299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3899	NC_016818	ATT	2	6	1618350	1618355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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