MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016818	ATT	2	6	1250439	1250444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_016818	TG	3	6	1250446	1250451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016818	TGC	2	6	1250455	1250460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_016818	GCA	2	6	1250542	1250547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_016818	CTCC	2	8	1251579	1251586	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3006	NC_016818	TGGGG	2	10	1251604	1251613	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_016818	TGAAC	2	10	1251695	1251704	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3008	NC_016818	GTTCA	2	10	1253099	1253108	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3009	NC_016818	GAG	2	6	1253118	1253123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_016818	TTC	2	6	1253142	1253147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_016818	CTCC	2	8	1253173	1253180	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3012	NC_016818	TGGGG	2	10	1253198	1253207	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_016818	AAGGG	2	10	1253289	1253298	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_016818	A	6	6	1253301	1253306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_016818	CCA	2	6	1253315	1253320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_016818	CGGTG	2	10	1254104	1254113	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_016818	GGCG	2	8	1254122	1254129	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_016818	A	6	6	1254139	1254144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_016818	TTA	2	6	1255932	1255937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_016818	CAA	2	6	1257911	1257916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_016818	TTCAGA	2	12	1257949	1257960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3022	NC_016818	TGT	2	6	1259820	1259825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_016818	GTGA	2	8	1259896	1259903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016818	TCC	2	6	1259907	1259912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_016818	A	7	7	1260448	1260454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_016818	GTC	2	6	1261360	1261365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_016818	CCCTG	2	10	1262881	1262890	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3028	NC_016818	ATTTT	2	10	1262950	1262959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016818	ATA	2	6	1263027	1263032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016818	GGT	2	6	1263039	1263044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_016818	TTAT	2	8	1263096	1263103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_016818	TAAA	2	8	1263115	1263122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_016818	TATG	2	8	1263141	1263148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016818	AGA	2	6	1263176	1263181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016818	ATT	2	6	1263190	1263195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016818	ATTA	2	8	1263255	1263262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016818	TAA	2	6	1263297	1263302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016818	CTT	2	6	1263358	1263363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_016818	CTG	2	6	1263380	1263385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_016818	AG	3	6	1263468	1263473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016818	TG	3	6	1263493	1263498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016818	ATT	2	6	1263499	1263504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016818	GCC	2	6	1263603	1263608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_016818	TGA	2	6	1263619	1263624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_016818	ACG	2	6	1263641	1263646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_016818	AATC	2	8	1263681	1263688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_016818	CAG	2	6	1263692	1263697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_016818	TA	3	6	1263728	1263733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_016818	T	8	8	1264809	1264816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_016818	CTCC	2	8	1268556	1268563	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3051	NC_016818	TGGGG	2	10	1268581	1268590	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_016818	GAG	2	6	1268658	1268663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_016818	GAG	2	6	1268686	1268691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_016818	GAC	2	6	1271490	1271495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_016818	ATTTT	2	10	1271563	1271572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_016818	ATGTC	2	10	1271606	1271615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3057	NC_016818	CGC	2	6	1275727	1275732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_016818	A	6	6	1279335	1279340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016818	TAA	2	6	1279374	1279379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016818	AAC	2	6	1279992	1279997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_016818	TAT	2	6	1280003	1280008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_016818	TAAGT	2	10	1280012	1280021	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_016818	AT	3	6	1280089	1280094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_016818	GACG	2	8	1280095	1280102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3065	NC_016818	TTC	2	6	1280128	1280133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_016818	A	6	6	1280153	1280158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_016818	CT	3	6	1280193	1280198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_016818	TTA	2	6	1280199	1280204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_016818	TCT	2	6	1280206	1280211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_016818	G	6	6	1283876	1283881	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_016818	A	6	6	1283943	1283948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_016818	TCC	2	6	1287034	1287039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_016818	CAG	2	6	1287442	1287447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3075	NC_016818	CTC	2	6	1289620	1289625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_016818	CGG	2	6	1289652	1289657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_016818	GAC	3	9	1289682	1289690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3079	NC_016818	ATT	2	6	1289732	1289737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_016818	GCC	2	6	1290720	1290725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_016818	T	7	7	1291589	1291595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_016818	GGCG	2	8	1291656	1291663	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_016818	AAG	2	6	1292746	1292751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_016818	TAAT	2	8	1292781	1292788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_016818	CAT	2	6	1292800	1292805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3087	NC_016818	A	8	8	1292858	1292865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_016818	TAC	2	6	1292871	1292876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_016818	GAA	2	6	1292896	1292901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_016818	TAA	2	6	1292932	1292937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_016818	GAG	2	6	1292974	1292979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016818	TAA	3	9	1296276	1296284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016818	ATA	3	9	1296300	1296308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016818	GCA	2	6	1297862	1297867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_016818	TCA	2	6	1298431	1298436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_016818	TC	3	6	1298443	1298448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_016818	T	6	6	1298549	1298554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_016818	CTT	2	6	1298555	1298560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_016818	T	6	6	1298577	1298582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_016818	CTG	2	6	1298597	1298602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_016818	T	6	6	1298635	1298640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_016818	A	7	7	1298645	1298651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_016818	CTG	2	6	1299495	1299500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_016818	ATC	2	6	1299501	1299506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_016818	T	6	6	1299532	1299537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_016818	TGT	2	6	1299834	1299839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_016818	GAG	2	6	1299864	1299869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_016818	AGT	2	6	1299911	1299916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016818	TAA	2	6	1299938	1299943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_016818	TG	3	6	1299987	1299992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_016818	AATG	2	8	1300048	1300055	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_016818	CCA	2	6	1300142	1300147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_016818	T	6	6	1302300	1302305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016818	CATA	2	8	1302778	1302785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_016818	TC	3	6	1302786	1302791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_016818	AAT	2	6	1302796	1302801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016818	CG	3	6	1302819	1302824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_016818	ATGCAT	2	12	1302870	1302881	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3119	NC_016818	GC	3	6	1302895	1302900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_016818	CAC	2	6	1302966	1302971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_016818	AAAG	2	8	1303046	1303053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_016818	AAT	2	6	1303918	1303923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_016818	GAC	2	6	1303971	1303976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_016818	CGG	2	6	1303981	1303986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_016818	TAA	2	6	1304030	1304035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016818	AGAAA	2	10	1304040	1304049	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_016818	A	7	7	1304304	1304310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_016818	TAT	2	6	1304343	1304348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_016818	GTA	2	6	1304372	1304377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_016818	TAC	2	6	1304416	1304421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_016818	GTA	2	6	1304446	1304451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_016818	TAC	2	6	1304494	1304499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_016818	GTA	2	6	1304514	1304519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_016818	TAC	2	6	1304568	1304573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_016818	TAA	3	9	1304580	1304588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_016818	CCT	2	6	1304624	1304629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3137	NC_016818	AAAC	2	8	1304642	1304649	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3138	NC_016818	TCT	2	6	1304744	1304749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3140	NC_016818	ATC	2	6	1304874	1304879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_016818	TGA	2	6	1304915	1304920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_016818	CTT	2	6	1304948	1304953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_016818	GCG	2	6	1305007	1305012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3144	NC_016818	CGCC	2	8	1305065	1305072	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3145	NC_016818	CAG	2	6	1305078	1305083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3150	NC_016818	TAA	3	9	1305581	1305589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_016818	GTT	2	6	1305609	1305614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3153	NC_016818	TGCC	2	8	1306719	1306726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3154	NC_016818	ATG	2	6	1306756	1306761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3161	NC_016818	ATT	2	6	1308334	1308339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_016818	AGA	2	6	1308359	1308364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_016818	A	6	6	1308364	1308369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_016818	AAT	2	6	1308421	1308426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3168	NC_016818	A	6	6	1315036	1315041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3220	NC_016818	TTCT	2	8	1338224	1338231	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3221	NC_016818	T	7	7	1339385	1339391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_016818	ATC	3	9	1339450	1339458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3224	NC_016818	T	6	6	1342151	1342156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3227	NC_016818	T	6	6	1342245	1342250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3228	NC_016818	CA	3	6	1342260	1342265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3231	NC_016818	GCC	2	6	1343315	1343320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3232	NC_016818	ACAG	2	8	1343340	1343347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3233	NC_016818	CTG	2	6	1343393	1343398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3236	NC_016818	ACCCC	2	10	1345595	1345604	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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3240	NC_016818	CTGG	2	8	1345697	1345704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3241	NC_016818	TGC	2	6	1345720	1345725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3242	NC_016818	T	7	7	1345734	1345740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_016818	TAT	2	6	1345747	1345752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_016818	TTTTCT	2	12	1345790	1345801	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3245	NC_016818	CGC	2	6	1345811	1345816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3246	NC_016818	TC	3	6	1347924	1347929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3247	NC_016818	GC	3	6	1347932	1347937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3248	NC_016818	CGGG	2	8	1347953	1347960	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3249	NC_016818	T	7	7	1347965	1347971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_016818	CAC	2	6	1347997	1348002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3251	NC_016818	CAA	2	6	1348660	1348665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_016818	TTC	2	6	1348716	1348721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_016818	T	6	6	1348757	1348762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_016818	TTCA	2	8	1348879	1348886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3255	NC_016818	CA	4	8	1348889	1348896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_016818	AAT	2	6	1348910	1348915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_016818	CGT	2	6	1349718	1349723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_016818	GCG	2	6	1349741	1349746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_016818	CGT	2	6	1349776	1349781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_016818	A	6	6	1349813	1349818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_016818	ATT	2	6	1351223	1351228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_016818	AT	3	6	1353369	1353374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_016818	GAA	2	6	1353435	1353440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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