MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016818	CCA	2	6	670679	670684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_016818	GGC	2	6	670686	670691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_016818	GCT	2	6	670779	670784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_016818	TTA	2	6	670786	670791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016818	GCC	2	6	670835	670840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_016818	ATT	2	6	670855	670860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016818	AT	3	6	670869	670874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016818	CTA	2	6	672712	672717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_016818	GTTT	2	8	673015	673022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016818	TGT	2	6	673028	673033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016818	CGCT	2	8	673143	673150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_016818	GCG	2	6	673161	673166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016818	TA	3	6	673169	673174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016818	CAAT	2	8	673176	673183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_016818	GCA	2	6	673236	673241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016818	TG	3	6	673254	673259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016818	GC	3	6	673267	673272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_016818	ATG	2	6	673292	673297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016818	TGC	2	6	674360	674365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_016818	TGC	2	6	674396	674401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_016818	TCAG	2	8	674438	674445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_016818	A	6	6	674458	674463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016818	A	7	7	674469	674475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016818	T	7	7	674493	674499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016818	TAA	2	6	675160	675165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016818	ATA	2	6	675193	675198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016818	CTG	2	6	675207	675212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_016818	AAG	2	6	675659	675664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016818	ATG	2	6	675717	675722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016818	T	6	6	675727	675732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016818	AGGGT	2	10	675777	675786	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016818	A	6	6	676684	676689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016818	TCA	2	6	677969	677974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_016818	TGAT	2	8	678000	678007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016818	TCT	2	6	678748	678753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_016818	GAC	2	6	678829	678834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_016818	GC	3	6	678888	678893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_016818	T	8	8	680304	680311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016818	GATTT	2	10	683224	683233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016818	TCC	2	6	684684	684689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_016818	CTTTT	2	10	684734	684743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1542	NC_016818	CAG	2	6	686065	686070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_016818	TGA	2	6	686079	686084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016818	AGG	2	6	686391	686396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016818	TGCTC	2	10	686471	686480	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1546	NC_016818	GTT	2	6	686497	686502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_016818	CGG	2	6	686537	686542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_016818	AGGA	2	8	686558	686565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016818	TCA	2	6	686566	686571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016818	CAG	2	6	686622	686627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016818	GA	3	6	686669	686674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016818	CCT	2	6	686755	686760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_016818	TCA	2	6	687584	687589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_016818	TCA	2	6	687633	687638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016818	TCA	2	6	687656	687661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_016818	TCAC	2	8	687671	687678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_016818	T	6	6	690421	690426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016818	AGC	2	6	690476	690481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_016818	GCG	2	6	690511	690516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_016818	A	8	8	690527	690534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016818	TTG	2	6	692086	692091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016818	GCA	2	6	692093	692098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_016818	TGT	2	6	692100	692105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016818	TATG	2	8	692106	692113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_016818	AAC	2	6	692220	692225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_016818	ATT	3	9	692230	692238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016818	TCA	2	6	692248	692253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_016818	CAA	3	9	693373	693381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_016818	TGCT	2	8	694840	694847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_016818	AAT	2	6	694906	694911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016818	CGC	2	6	696819	696824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_016818	A	6	6	696831	696836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016818	AAT	2	6	697936	697941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016818	TGT	2	6	697972	697977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016818	GAT	2	6	698034	698039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016818	CAT	2	6	698053	698058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_016818	GC	3	6	698080	698085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_016818	CTG	2	6	700426	700431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_016818	TAA	2	6	700530	700535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016818	GGC	3	9	701414	701422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_016818	GTTTT	2	10	701440	701449	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016818	CAAA	2	8	702890	702897	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_016818	CGG	2	6	702907	702912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_016818	GTTTTT	2	12	702913	702924	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016818	CCG	2	6	703795	703800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_016818	TCC	2	6	704938	704943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_016818	AAT	2	6	704962	704967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016818	A	6	6	704991	704996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016818	GT	3	6	705078	705083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016818	GA	3	6	706969	706974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016818	ATT	2	6	706983	706988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016818	CGAA	2	8	706998	707005	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_016818	GCGCG	2	10	708276	708285	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1594	NC_016818	TTAAC	2	10	708309	708318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1595	NC_016818	ATG	2	6	708319	708324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016818	CAGC	2	8	708367	708374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_016818	A	7	7	708380	708386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016818	GAC	2	6	708396	708401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_016818	CAA	2	6	711493	711498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_016818	GTT	2	6	711530	711535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016818	GAT	2	6	711558	711563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016818	T	8	8	711579	711586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016818	GCC	2	6	711663	711668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_016818	ATA	2	6	711685	711690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016818	T	9	9	711715	711723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016818	ATTC	2	8	711740	711747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_016818	CTGG	2	8	711764	711771	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_016818	AATCA	2	10	713170	713179	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1609	NC_016818	A	6	6	713187	713192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016818	TTA	2	6	714822	714827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016818	A	6	6	714841	714846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016818	AAT	2	6	714876	714881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016818	TGA	2	6	714976	714981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016818	TG	3	6	714991	714996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016818	TCC	2	6	715072	715077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_016818	TG	3	6	715086	715091	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016818	CAG	2	6	715114	715119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016818	T	6	6	715161	715166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016818	ATAA	2	8	715227	715234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016818	TGAA	2	8	715287	715294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016818	GCG	2	6	718459	718464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_016818	CG	3	6	718467	718472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_016818	GCAG	2	8	718501	718508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_016818	A	6	6	719729	719734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016818	TATTT	2	10	719768	719777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016818	CCTGT	2	10	721139	721148	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1627	NC_016818	TAA	2	6	723951	723956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016818	CTTTT	2	10	727626	727635	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1629	NC_016818	T	6	6	727632	727637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016818	CAA	2	6	728580	728585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_016818	TGT	2	6	728648	728653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016818	A	6	6	728667	728672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016818	CA	3	6	728750	728755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_016818	CAT	2	6	728792	728797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_016818	AACCT	2	10	728803	728812	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1911	NC_016818	TAA	2	6	815718	815723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1912	NC_016818	CGC	2	6	815757	815762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1913	NC_016818	AAT	2	6	815776	815781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_016818	A	6	6	815840	815845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1993	NC_016818	TGC	2	6	847244	847249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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