MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 12759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016818	CTGT	2	8	2022062	2022069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_016818	TGCCC	2	10	2022174	2022183	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5003	NC_016818	TCTATT	2	12	2022235	2022246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5004	NC_016818	AT	5	10	2022253	2022262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016818	A	6	6	2022289	2022294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016818	AC	3	6	2023758	2023763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_016818	AT	3	6	2023768	2023773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_016818	TGA	2	6	2023789	2023794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_016818	CAG	3	9	2027355	2027363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_016818	TTC	2	6	2027406	2027411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_016818	GGT	2	6	2030585	2030590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016818	ATT	2	6	2030620	2030625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016818	A	6	6	2030663	2030668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016818	TGAT	2	8	2031519	2031526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016818	GTAAA	2	10	2031619	2031628	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016818	GA	4	8	2031654	2031661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_016818	CTG	2	6	2032726	2032731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_016818	CGG	2	6	2032760	2032765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_016818	CGG	2	6	2032771	2032776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_016818	TGT	2	6	2032855	2032860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016818	GAAGG	2	10	2032890	2032899	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016818	TTC	2	6	2036659	2036664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_016818	A	6	6	2036670	2036675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016818	TCAT	2	8	2042986	2042993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_016818	ATTC	2	8	2043003	2043010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_016818	CGC	2	6	2043014	2043019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_016818	CTG	2	6	2043025	2043030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_016818	TGA	2	6	2043069	2043074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_016818	AG	3	6	2043163	2043168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_016818	GTG	2	6	2044129	2044134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_016818	C	6	6	2044331	2044336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5032	NC_016818	GAT	2	6	2044343	2044348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016818	AGGAG	2	10	2044350	2044359	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016818	A	7	7	2047837	2047843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016818	T	6	6	2047869	2047874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_016818	ACA	2	6	2048089	2048094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_016818	ATT	2	6	2048269	2048274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_016818	AATA	2	8	2048861	2048868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016818	TTTG	2	8	2049848	2049855	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016818	AGG	2	6	2049860	2049865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016818	G	6	6	2049864	2049869	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016818	CTTT	2	8	2049901	2049908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_016818	GGT	2	6	2051219	2051224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016818	AAG	2	6	2051311	2051316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016818	GGCGC	2	10	2052095	2052104	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5046	NC_016818	CG	3	6	2052749	2052754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_016818	GAG	2	6	2052774	2052779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016818	TTA	2	6	2053704	2053709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016818	ATG	2	6	2053753	2053758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016818	CAA	2	6	2053779	2053784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_016818	T	6	6	2053819	2053824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016818	ATT	2	6	2053898	2053903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016818	ATA	2	6	2053909	2053914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_016818	GCT	2	6	2056182	2056187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_016818	GGA	2	6	2056212	2056217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_016818	TGT	2	6	2056239	2056244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016818	TC	3	6	2056572	2056577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_016818	TTGT	2	8	2056579	2056586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_016818	TC	3	6	2056666	2056671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_016818	AAC	2	6	2056751	2056756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_016818	GCC	2	6	2056758	2056763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_016818	TTTTAT	2	12	2056770	2056781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016818	ACAA	2	8	2056863	2056870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_016818	CAAG	2	8	2056888	2056895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_016818	GAA	2	6	2056936	2056941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_016818	GAAA	2	8	2057031	2057038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016818	AAAC	2	8	2057043	2057050	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_016818	AGTT	2	8	2057061	2057068	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_016818	A	6	6	2057074	2057079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016818	CTA	2	6	2057123	2057128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_016818	TCTG	2	8	2057167	2057174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_016818	TCA	2	6	2057176	2057181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_016818	ACT	2	6	2057206	2057211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_016818	TGA	2	6	2057249	2057254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_016818	TCC	2	6	2057270	2057275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_016818	CAGTT	2	10	2057356	2057365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_016818	ACT	2	6	2057366	2057371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_016818	GTT	2	6	2057387	2057392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_016818	CCG	2	6	2057411	2057416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_016818	TAATG	2	10	2057417	2057426	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_016818	CAT	2	6	2057467	2057472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_016818	CAT	2	6	2057533	2057538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_016818	AAT	2	6	2057553	2057558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016818	TTCCA	2	10	2057587	2057596	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5085	NC_016818	TGC	2	6	2057635	2057640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_016818	GGCT	2	8	2057737	2057744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_016818	TGG	2	6	2057838	2057843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_016818	T	6	6	2057884	2057889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016818	GAT	2	6	2057907	2057912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016818	CCG	2	6	2057985	2057990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_016818	TCT	2	6	2058037	2058042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_016818	GATT	2	8	2058049	2058056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016818	GAA	2	6	2058079	2058084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_016818	AT	3	6	2058132	2058137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_016818	ATT	2	6	2058165	2058170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_016818	CAT	2	6	2060218	2060223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_016818	CA	3	6	2060246	2060251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_016818	TTA	2	6	2060352	2060357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_016818	TATC	2	8	2060425	2060432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_016818	CTG	2	6	2060482	2060487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_016818	GCG	2	6	2060509	2060514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_016818	GTG	2	6	2060549	2060554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016818	TAA	2	6	2060603	2060608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_016818	AATGAT	2	12	2060629	2060640	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016818	TCAT	2	8	2066481	2066488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_016818	A	6	6	2066495	2066500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_016818	TAA	2	6	2066520	2066525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_016818	ATG	2	6	2066536	2066541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_016818	TAA	2	6	2066692	2066697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016818	ACC	2	6	2066730	2066735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_016818	CAA	2	6	2066744	2066749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_016818	CTG	2	6	2066784	2066789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_016818	TGCG	2	8	2066806	2066813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_016818	GA	3	6	2066819	2066824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016818	T	6	6	2067005	2067010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_016818	CCG	2	6	2067035	2067040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_016818	ATT	2	6	2067144	2067149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016818	AAG	2	6	2067209	2067214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_016818	ACA	2	6	2067235	2067240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_016818	TAG	2	6	2067267	2067272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016818	AG	3	6	2067899	2067904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_016818	TGT	2	6	2067990	2067995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016818	AAC	2	6	2068018	2068023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_016818	ATA	2	6	2068032	2068037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_016818	TAG	2	6	2068047	2068052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_016818	CAG	2	6	2069367	2069372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_016818	CTAC	2	8	2069393	2069400	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5128	NC_016818	AATT	2	8	2069411	2069418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016818	ATC	2	6	2069432	2069437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_016818	T	6	6	2069470	2069475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016818	TGC	2	6	2069510	2069515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_016818	A	6	6	2069582	2069587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5256	NC_016818	GT	3	6	2112609	2112614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_016818	TTG	2	6	2112665	2112670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5260	NC_016818	ATT	2	6	2120848	2120853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_016818	TAT	2	6	2120854	2120859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_016818	A	6	6	2120918	2120923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_016818	AGCAAA	2	12	2121528	2121539	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5265	NC_016818	AGGAG	2	10	2121555	2121564	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_016818	TGGCTC	2	12	2125889	2125900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5273	NC_016818	CTT	2	6	2130726	2130731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5274	NC_016818	CAT	2	6	2130741	2130746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5278	NC_016818	T	7	7	2130859	2130865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5285	NC_016818	T	6	6	2134499	2134504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5375	NC_016818	AAGGG	2	10	2156892	2156901	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5376	NC_016818	A	7	7	2157555	2157561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_016818	AAAC	2	8	2157958	2157965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5378	NC_016818	ATT	2	6	2158034	2158039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5379	NC_016818	A	7	7	2158068	2158074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_016818	TCTG	2	8	2158124	2158131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5381	NC_016818	CTGT	2	8	2160150	2160157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5382	NC_016818	TGCG	2	8	2160173	2160180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5383	NC_016818	A	6	6	2164777	2164782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5386	NC_016818	CAT	2	6	2164884	2164889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5387	NC_016818	TCA	3	9	2164898	2164906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_016818	A	6	6	2166794	2166799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_016818	ATC	2	6	2166802	2166807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_016818	T	6	6	2166863	2166868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_016818	TAA	2	6	2166880	2166885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_016818	TGC	2	6	2166930	2166935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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