MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 9577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016639	TTA	2	6	581813	581818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016639	TAT	2	6	581835	581840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_016639	A	7	7	582208	582214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_016639	TTA	2	6	582346	582351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_016639	TAA	2	6	582408	582413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016639	AAT	2	6	583052	583057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016639	GTT	2	6	583058	583063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_016639	A	9	9	583116	583124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016639	A	6	6	583127	583132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_016639	ACA	2	6	583163	583168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_016639	GCGA	2	8	584859	584866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_016639	TTTAA	2	10	587088	587097	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_016639	A	7	7	587096	587102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_016639	TAC	2	6	587201	587206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_016639	AATATA	2	12	587277	587288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_016639	GAG	2	6	588182	588187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_016639	GTC	2	6	588212	588217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_016639	ATA	2	6	588256	588261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_016639	TCG	2	6	588281	588286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_016639	TAC	2	6	588290	588295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_016639	TTC	2	6	588300	588305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_016639	TAA	2	6	588320	588325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_016639	A	7	7	588343	588349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_016639	A	6	6	589810	589815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_016639	TTG	2	6	590628	590633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_016639	TTG	2	6	590676	590681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_016639	ATC	2	6	590694	590699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_016639	GAG	2	6	590705	590710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016639	GAC	2	6	590783	590788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_016639	CAA	2	6	590803	590808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_016639	TAG	2	6	590813	590818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_016639	T	7	7	591701	591707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016639	TTA	2	6	591710	591715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016639	AAT	2	6	591730	591735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_016639	TTTTA	2	10	591745	591754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_016639	T	6	6	591795	591800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016639	T	7	7	591803	591809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016639	ACA	2	6	591863	591868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_016639	ATTT	2	8	593070	593077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016639	TA	3	6	593760	593765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016639	TAT	2	6	593776	593781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016639	TAA	2	6	593843	593848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_016639	TGA	2	6	593851	593856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016639	AAT	2	6	593879	593884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_016639	AGC	2	6	593899	593904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_016639	T	7	7	593916	593922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_016639	AAAC	2	8	593968	593975	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_016639	ATG	2	6	593989	593994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_016639	TTA	2	6	594009	594014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_016639	TAA	2	6	594034	594039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_016639	T	7	7	594080	594086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_016639	TTA	3	9	594147	594155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_016639	AAC	2	6	594166	594171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_016639	ACTATA	2	12	594260	594271	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4055	NC_016639	ACTT	2	8	594352	594359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_016639	A	6	6	594409	594414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_016639	A	6	6	594419	594424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_016639	TAT	2	6	594428	594433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_016639	TTA	2	6	597270	597275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_016639	ATT	2	6	597280	597285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_016639	A	7	7	597301	597307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_016639	TAA	2	6	597326	597331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_016639	ATTT	2	8	597340	597347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_016639	ATT	2	6	597394	597399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_016639	ATT	2	6	597403	597408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_016639	ATG	2	6	597430	597435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_016639	CAT	2	6	597445	597450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_016639	TAT	2	6	597462	597467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_016639	TGT	2	6	597496	597501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_016639	ATT	2	6	597542	597547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_016639	ATT	2	6	598148	598153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016639	A	6	6	598178	598183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016639	TAAT	2	8	598189	598196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_016639	ATAA	2	8	598297	598304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016639	A	6	6	598339	598344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_016639	TAAC	2	8	598351	598358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_016639	TAT	2	6	598379	598384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_016639	ACATA	2	10	598387	598396	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4079	NC_016639	A	6	6	598416	598421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016639	ATTC	2	8	598455	598462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_016639	AAG	2	6	598500	598505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_016639	TAA	3	9	598653	598661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016639	T	7	7	598662	598668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016639	ATT	2	6	598674	598679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016639	AT	3	6	599493	599498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_016639	TA	3	6	600199	600204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_016639	GAG	2	6	600209	600214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016639	ACG	2	6	600259	600264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_016639	TAA	2	6	600907	600912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_016639	TTA	2	6	600915	600920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016639	TGA	2	6	600937	600942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_016639	GAT	2	6	600950	600955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_016639	CAT	2	6	600977	600982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_016639	TGA	2	6	600994	600999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016639	AT	3	6	601040	601045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016639	GAA	2	6	601050	601055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016639	ACT	2	6	601084	601089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_016639	T	6	6	601089	601094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_016639	TGT	2	6	601123	601128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_016639	TA	3	6	601130	601135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_016639	TCTT	2	8	601141	601148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_016639	TAT	2	6	601209	601214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_016639	CTTT	2	8	601236	601243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_016639	TTA	2	6	601289	601294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_016639	GCTTGT	2	12	601307	601318	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4106	NC_016639	AT	3	6	601364	601369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_016639	TTATT	2	10	601424	601433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_016639	T	6	6	601442	601447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_016639	TA	3	6	601481	601486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_016639	TGT	2	6	601491	601496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_016639	TTCA	2	8	601560	601567	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_016639	CAG	3	9	601577	601585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_016639	ATTG	2	8	601589	601596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_016639	AT	3	6	601606	601611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_016639	ATTTA	2	10	601668	601677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_016639	T	6	6	601753	601758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_016639	TAAA	2	8	601782	601789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_016639	TGA	2	6	601809	601814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_016639	TAA	2	6	601848	601853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_016639	TTC	2	6	601857	601862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_016639	TAT	3	9	601883	601891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_016639	AAAT	2	8	601918	601925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_016639	GTG	2	6	601973	601978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_016639	TTA	2	6	601988	601993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_016639	TCA	2	6	601996	602001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_016639	T	6	6	602004	602009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_016639	AGCA	2	8	602013	602020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_016639	TCT	2	6	602053	602058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_016639	TAA	2	6	602075	602080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_016639	ATA	2	6	602108	602113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_016639	CTT	2	6	602214	602219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_016639	CTA	2	6	602241	602246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_016639	AGA	2	6	602308	602313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_016639	A	6	6	602335	602340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_016639	ATTA	2	8	602362	602369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4137	NC_016639	T	6	6	602437	602442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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