MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 9577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016639	ATT	3	9	123167	123175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016639	TAT	2	6	123204	123209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016639	AGTA	2	8	123210	123217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016639	GAG	2	6	125657	125662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016639	TTG	2	6	125666	125671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016639	TCG	2	6	125682	125687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_016639	TTA	2	6	125738	125743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016639	CAA	2	6	125801	125806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_016639	CGCT	2	8	125811	125818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_016639	ACA	2	6	125830	125835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016639	TCAC	2	8	125840	125847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_016639	AGT	2	6	125867	125872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016639	AT	3	6	125917	125922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016639	GTT	2	6	126046	126051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016639	TAG	2	6	126057	126062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016639	GCA	2	6	126065	126070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_016639	A	7	7	126070	126076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016639	AAT	2	6	126093	126098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016639	GCAAG	2	10	126124	126133	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_016639	ATA	2	6	126134	126139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016639	T	6	6	126180	126185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016639	T	6	6	126247	126252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016639	TA	3	6	126287	126292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016639	A	6	6	126362	126367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016639	TA	3	6	126397	126402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016639	AAAG	2	8	126406	126413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016639	ATAA	2	8	126418	126425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016639	ATCA	2	8	126442	126449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_016639	AGT	2	6	126452	126457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016639	TGA	2	6	126484	126489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016639	TAT	2	6	126490	126495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016639	AGC	2	6	126520	126525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_016639	GCCG	2	8	126590	126597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_016639	ATA	2	6	126612	126617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016639	TAA	2	6	126638	126643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016639	GCA	2	6	126670	126675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016639	ATA	2	6	126820	126825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016639	ATC	2	6	126838	126843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_016639	TAA	2	6	126854	126859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016639	A	7	7	127973	127979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016639	A	6	6	127982	127987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_016639	TTAAA	2	10	128067	128076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016639	A	6	6	128080	128085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016639	TGT	2	6	128901	128906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016639	T	6	6	128913	128918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016639	ACGT	2	8	128926	128933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_016639	A	6	6	128951	128956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016639	T	7	7	128999	129005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016639	TCT	2	6	130074	130079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_016639	TAAT	2	8	130339	130346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016639	TGT	2	6	130356	130361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016639	TTTA	2	8	130513	130520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016639	ATT	2	6	130529	130534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016639	TAA	2	6	130962	130967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016639	AAT	2	6	130977	130982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016639	TTG	2	6	130989	130994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016639	TATTTT	2	12	131021	131032	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016639	GTT	2	6	131104	131109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016639	TTGCT	2	10	131697	131706	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_016639	TTG	2	6	131736	131741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016639	GAAA	2	8	131811	131818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016639	TTG	2	6	131855	131860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016639	GTT	2	6	131863	131868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016639	CAA	2	6	131875	131880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_016639	GAT	2	6	131881	131886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016639	TA	3	6	131891	131896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016639	GCT	2	6	131922	131927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_016639	AT	3	6	131982	131987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016639	T	6	6	132017	132022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016639	TAA	2	6	132061	132066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016639	TAAT	2	8	132086	132093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016639	TA	3	6	132103	132108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016639	TAA	2	6	132122	132127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016639	AAT	2	6	132159	132164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016639	TA	3	6	132212	132217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016639	CGT	2	6	132242	132247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_016639	TTA	2	6	132271	132276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016639	TTTG	2	8	132920	132927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016639	T	7	7	133006	133012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016639	ATT	2	6	133013	133018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016639	T	6	6	133017	133022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016639	ACT	2	6	133045	133050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016639	AAC	2	6	133075	133080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_016639	ATT	2	6	133113	133118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016639	AGC	2	6	133128	133133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_016639	CTG	2	6	133239	133244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_016639	TTC	2	6	133973	133978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_016639	ATA	2	6	134007	134012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016639	GTA	2	6	134017	134022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016639	T	6	6	134835	134840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016639	ACA	2	6	135250	135255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_016639	A	6	6	135255	135260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016639	AAAT	2	8	135311	135318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016639	CTGT	2	8	137766	137773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_016639	AAT	2	6	146144	146149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016639	ATA	2	6	149136	149141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016639	TAA	2	6	152611	152616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016639	T	8	8	152620	152627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016639	TA	3	6	152639	152644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016639	AAAC	2	8	152655	152662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_016639	TGA	2	6	152667	152672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016639	GAA	2	6	152696	152701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016639	ATC	2	6	152713	152718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_016639	GAA	2	6	152749	152754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016639	CTA	2	6	152780	152785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_016639	T	7	7	152790	152796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016639	GAAG	2	8	152799	152806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016639	AGA	2	6	152807	152812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016639	ATT	2	6	152840	152845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016639	TGAT	2	8	152850	152857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016639	AT	3	6	152856	152861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016639	A	6	6	152952	152957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016639	T	7	7	152962	152968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016639	CAA	2	6	153030	153035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_016639	AAT	2	6	153101	153106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016639	ATTA	2	8	153120	153127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016639	TA	3	6	153131	153136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016639	TTA	2	6	153162	153167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016639	GAA	2	6	153178	153183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016639	ATA	2	6	153191	153196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016639	T	6	6	153205	153210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016639	TAC	2	6	153238	153243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_016639	CTC	2	6	153249	153254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_016639	TGA	2	6	153280	153285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016639	AGC	2	6	153286	153291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_016639	AGT	2	6	153349	153354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016639	CGAT	2	8	153360	153367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_016639	TAA	2	6	153411	153416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016639	ACA	2	6	153432	153437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_016639	TAA	2	6	153462	153467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016639	TAAT	2	8	153491	153498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016639	AGC	2	6	153516	153521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_016639	A	7	7	153522	153528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_016639	TAT	2	6	153564	153569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_016639	TAA	2	6	211423	211428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_016639	AT	3	6	211434	211439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_016639	TAAAA	2	10	211443	211452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_016639	AGACA	2	10	211505	211514	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1421	NC_016639	AT	3	6	211517	211522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_016639	TAA	2	6	211571	211576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_016639	TGC	2	6	212150	212155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1433	NC_016639	ATG	2	6	212421	212426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1444	NC_016639	TCT	2	6	212922	212927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_016639	TTA	2	6	213100	213105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_016639	TGT	2	6	213123	213128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1467	NC_016639	AAT	2	6	216189	216194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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