MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 9577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016639	TTTAA	2	10	50149	50158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016639	AT	3	6	50164	50169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016639	CTT	2	6	50176	50181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016639	TA	3	6	50182	50187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016639	TAT	2	6	50247	50252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016639	GCC	2	6	50279	50284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_016639	TCA	2	6	50325	50330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016639	TTC	2	6	50357	50362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016639	T	7	7	50377	50383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016639	AGC	2	6	50537	50542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016639	CTTG	2	8	50569	50576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_016639	TAT	2	6	50598	50603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016639	CTA	2	6	50641	50646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_016639	CAT	2	6	50684	50689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016639	TGA	2	6	50698	50703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016639	ATT	2	6	50742	50747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016639	T	7	7	50766	50772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016639	CTC	2	6	50775	50780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_016639	TTC	2	6	50808	50813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_016639	TCT	2	6	50857	50862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016639	A	6	6	50890	50895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016639	T	6	6	50920	50925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016639	ATT	2	6	50989	50994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016639	TTA	2	6	51018	51023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016639	AAC	2	6	51082	51087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016639	T	7	7	51128	51134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016639	ATCT	2	8	51145	51152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_016639	T	8	8	51163	51170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016639	TTA	2	6	51181	51186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016639	AGC	2	6	51210	51215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016639	TTTCT	2	10	51221	51230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_016639	T	6	6	51258	51263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016639	AAC	2	6	51272	51277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_016639	TTG	2	6	51281	51286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016639	TAC	2	6	51302	51307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_016639	TGCT	2	8	51309	51316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_016639	TAT	2	6	51402	51407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016639	CA	3	6	51441	51446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_016639	TTC	2	6	51457	51462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016639	TTA	2	6	51474	51479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016639	AT	3	6	51546	51551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016639	T	6	6	51638	51643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016639	T	7	7	51658	51664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016639	CTG	2	6	51711	51716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016639	TTTA	2	8	51730	51737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016639	A	7	7	51742	51748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016639	TCA	2	6	51788	51793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016639	T	6	6	51815	51820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016639	TCAC	2	8	51839	51846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_016639	TAAA	2	8	51879	51886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016639	AGTATT	2	12	51895	51906	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016639	T	7	7	51931	51937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016639	CAA	2	6	51945	51950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016639	GAA	2	6	52002	52007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016639	T	6	6	52059	52064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_016639	CAA	2	6	52191	52196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016639	CAA	2	6	52257	52262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_016639	CATTA	2	10	52282	52291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
559	NC_016639	TGT	2	6	52328	52333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016639	TCT	2	6	52334	52339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016639	TCA	2	6	52391	52396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_016639	TGA	2	6	52398	52403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016639	TCA	2	6	52433	52438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_016639	T	6	6	52496	52501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016639	TAA	2	6	52592	52597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016639	TTTA	2	8	52611	52618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016639	CTC	2	6	52667	52672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_016639	T	6	6	52721	52726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016639	T	6	6	52774	52779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016639	TAA	2	6	52854	52859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016639	T	7	7	52884	52890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016639	ATG	2	6	52892	52897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016639	ATT	2	6	52953	52958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016639	ATTA	2	8	52994	53001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016639	AT	3	6	53004	53009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016639	TAG	2	6	53061	53066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016639	TGC	2	6	53076	53081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016639	ATC	2	6	53090	53095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_016639	TAT	2	6	53117	53122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016639	GAA	2	6	53137	53142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016639	TTA	2	6	53162	53167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016639	ATA	2	6	53168	53173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016639	TTA	2	6	53191	53196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016639	TAAA	2	8	53219	53226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016639	GAGG	2	8	53245	53252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016639	TTC	2	6	53265	53270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016639	TAG	2	6	53301	53306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016639	ATA	2	6	53372	53377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016639	AAT	2	6	53401	53406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016639	TAA	3	9	53412	53420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016639	A	7	7	53419	53425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016639	A	6	6	53458	53463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016639	TGA	2	6	53568	53573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016639	AAG	2	6	53580	53585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016639	ACG	2	6	53604	53609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016639	AAT	2	6	53617	53622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016639	ATTG	2	8	53628	53635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016639	TTA	2	6	53714	53719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016639	TAT	2	6	53727	53732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016639	ATT	2	6	53836	53841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016639	TTAT	2	8	53842	53849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016639	TGCT	2	8	53924	53931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_016639	GTG	2	6	53933	53938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016639	CTA	2	6	53957	53962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016639	AT	3	6	53982	53987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016639	TCG	2	6	54009	54014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_016639	GTGA	2	8	54031	54038	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016639	CAT	2	6	54097	54102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_016639	GCA	2	6	54133	54138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_016639	TTGAT	2	10	54191	54200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016639	TGA	2	6	54201	54206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016639	AGA	2	6	54246	54251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016639	TGA	2	6	54255	54260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016639	CGT	2	6	54268	54273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016639	ATT	2	6	54274	54279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016639	GCA	2	6	54298	54303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016639	A	6	6	54307	54312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016639	AGA	2	6	54447	54452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016639	ATA	2	6	54578	54583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016639	TAT	2	6	54627	54632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016639	AAG	2	6	54765	54770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016639	GTTC	2	8	54809	54816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_016639	GACC	2	8	54827	54834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
624	NC_016639	TGA	2	6	54882	54887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016639	AT	4	8	54921	54928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016639	CTC	2	6	54961	54966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_016639	ATT	2	6	55037	55042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016639	TGA	2	6	55043	55048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016639	TGC	2	6	55084	55089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016639	TGA	2	6	55097	55102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016639	TAAAG	2	10	55220	55229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016639	ATTAT	2	10	55293	55302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016639	TAA	2	6	55319	55324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016639	ATT	2	6	55386	55391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016639	TGA	2	6	55400	55405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016639	ATT	2	6	55417	55422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016639	AAT	2	6	55494	55499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016639	AAAT	2	8	55549	55556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016639	T	6	6	55597	55602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016639	TAA	2	6	55653	55658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_016639	TGAT	2	8	55659	55666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
642	NC_016639	TTG	2	6	55693	55698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_016639	A	6	6	55707	55712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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