MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 9577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016639	TCA	2	6	825340	825345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_016639	CGG	2	6	825423	825428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_016639	TCC	2	6	825429	825434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_016639	ATT	2	6	825436	825441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_016639	T	6	6	825588	825593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016639	TCA	2	6	825631	825636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016639	AAG	2	6	825729	825734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_016639	A	6	6	825870	825875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_016639	TTA	2	6	825898	825903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_016639	ATA	2	6	825915	825920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_016639	TTA	2	6	825937	825942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_016639	TATAA	2	10	825960	825969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016639	ATTAT	2	10	825977	825986	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_016639	T	6	6	826029	826034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_016639	T	6	6	826585	826590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_016639	ATGA	2	8	826833	826840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_016639	A	7	7	826852	826858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_016639	AT	3	6	826941	826946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_016639	ACA	2	6	826952	826957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_016639	A	6	6	827023	827028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_016639	CCA	2	6	827050	827055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_016639	GA	4	8	827094	827101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_016639	T	6	6	827123	827128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_016639	AGC	2	6	827129	827134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_016639	ATA	2	6	827218	827223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_016639	TA	3	6	827237	827242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_016639	AAT	2	6	827283	827288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_016639	ATT	2	6	827378	827383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_016639	T	6	6	827402	827407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_016639	AAC	2	6	827408	827413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_016639	CAA	2	6	827416	827421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_016639	AAT	2	6	827422	827427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016639	T	6	6	827461	827466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016639	ATT	2	6	827479	827484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_016639	ATG	2	6	827494	827499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016639	AAG	2	6	827563	827568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_016639	TAT	2	6	827570	827575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_016639	CAT	2	6	827605	827610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_016639	T	7	7	827629	827635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016639	TAT	2	6	827671	827676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016639	TAT	2	6	827684	827689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016639	TTAT	2	8	827694	827701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016639	TCA	2	6	827838	827843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_016639	TA	3	6	827866	827871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016639	T	7	7	827872	827878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016639	TTA	2	6	827922	827927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_016639	TTC	2	6	827956	827961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_016639	CAA	2	6	828013	828018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_016639	GTA	2	6	828120	828125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016639	A	6	6	828130	828135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016639	TAT	2	6	828147	828152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_016639	A	6	6	828157	828162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016639	TCT	2	6	828170	828175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_016639	TCT	2	6	828179	828184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_016639	TTC	2	6	828295	828300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_016639	ATC	2	6	828433	828438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_016639	T	6	6	828451	828456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_016639	AAT	2	6	828457	828462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016639	TAT	2	6	828465	828470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_016639	T	6	6	828500	828505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_016639	TCA	2	6	828557	828562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_016639	AAC	2	6	828574	828579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_016639	ACTT	2	8	828586	828593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_016639	ATC	2	6	828601	828606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_016639	T	6	6	828613	828618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_016639	AACG	2	8	828621	828628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6067	NC_016639	TTTG	2	8	828734	828741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_016639	ATC	2	6	828746	828751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_016639	GCT	2	6	828779	828784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_016639	TCT	2	6	828788	828793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_016639	ACT	2	6	828851	828856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_016639	ATT	2	6	828859	828864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016639	GTA	2	6	828866	828871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_016639	CTA	2	6	828957	828962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_016639	TCT	2	6	829100	829105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_016639	TGTAT	2	10	829118	829127	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_016639	GTA	2	6	829141	829146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_016639	TAT	2	6	829172	829177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_016639	AAG	2	6	829198	829203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_016639	TCT	2	6	829252	829257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_016639	CTA	2	6	829268	829273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_016639	A	6	6	829327	829332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_016639	TAAA	2	8	829351	829358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_016639	TCT	2	6	829410	829415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_016639	ATT	2	6	829424	829429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_016639	CAAT	2	8	829591	829598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6087	NC_016639	TTA	2	6	829611	829616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_016639	ATTT	2	8	829619	829626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_016639	ATT	2	6	829664	829669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_016639	TAC	2	6	829678	829683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_016639	T	7	7	829864	829870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_016639	TAA	2	6	829899	829904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_016639	TAT	2	6	829907	829912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_016639	TTTC	2	8	829958	829965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6095	NC_016639	GTG	2	6	830163	830168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_016639	ATT	2	6	830240	830245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_016639	GAA	2	6	830512	830517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_016639	TAT	2	6	830667	830672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_016639	TCGC	2	8	830700	830707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_016639	CAT	2	6	830811	830816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6102	NC_016639	TTA	2	6	830827	830832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016639	CGA	2	6	830845	830850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_016639	CTA	2	6	830866	830871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_016639	CAT	2	6	830890	830895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_016639	AT	3	6	830894	830899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_016639	TA	3	6	830965	830970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_016639	TCA	2	6	830973	830978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_016639	TCC	2	6	831037	831042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6110	NC_016639	CTC	2	6	831137	831142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_016639	TTC	2	6	831223	831228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_016639	T	8	8	831258	831265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016639	ATT	2	6	831298	831303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_016639	AGT	2	6	831325	831330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_016639	ACT	3	9	831448	831456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_016639	TTAT	2	8	831517	831524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_016639	GCTT	2	8	831576	831583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_016639	AGC	2	6	831606	831611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_016639	ATA	2	6	831638	831643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016639	GAA	2	6	832014	832019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_016639	T	6	6	832076	832081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_016639	TAT	2	6	832138	832143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016639	GTC	2	6	835983	835988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_016639	TTA	2	6	836037	836042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_016639	CAA	2	6	836099	836104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_016639	CA	3	6	836131	836136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_016639	TAC	2	6	836952	836957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_016639	AAAT	2	8	836958	836965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_016639	ATT	2	6	838364	838369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_016639	GAG	2	6	838394	838399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_016639	TA	3	6	840879	840884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_016639	TTG	2	6	840899	840904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_016639	TTA	2	6	840936	840941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_016639	TCT	2	6	842232	842237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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