MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 10356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016050	ACA	2	6	210879	210884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_016050	AATTA	2	10	213504	213513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016050	TAAAT	2	10	213521	213530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016050	TAA	2	6	213536	213541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016050	AT	3	6	213547	213552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016050	TAAAA	2	10	213556	213565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016050	A	6	6	213562	213567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016050	TATT	2	8	213599	213606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016050	AGACA	2	10	213618	213627	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1510	NC_016050	AT	3	6	213630	213635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016050	TATTTA	2	12	213647	213658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016050	ATA	2	6	213663	213668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016050	TGAT	2	8	213675	213682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016050	TTA	2	6	213683	213688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016050	ATTA	2	8	213706	213713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016050	ATT	2	6	213950	213955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016050	AAG	2	6	213977	213982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016050	AT	3	6	214027	214032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016050	T	6	6	214037	214042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016050	A	6	6	214086	214091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016050	GTTTT	2	10	214096	214105	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016050	ATT	2	6	214111	214116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016050	GTT	2	6	214153	214158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016050	TAA	2	6	214237	214242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016050	ATG	2	6	214531	214536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016050	A	6	6	214542	214547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016050	GTA	2	6	214708	214713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016050	TCT	2	6	214783	214788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_016050	TA	3	6	214815	214820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016050	AACC	2	8	214834	214841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_016050	TA	3	6	214881	214886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016050	TCA	2	6	214891	214896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_016050	AAATGA	2	12	214957	214968	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016050	TTG	2	6	214971	214976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016050	TCT	2	6	215029	215034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_016050	TA	3	6	215073	215078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016050	AT	3	6	215098	215103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016050	TCT	2	6	215107	215112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_016050	ATTT	2	8	215115	215122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016050	T	6	6	215120	215125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016050	AAT	2	6	215171	215176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016050	ATT	3	9	215197	215205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016050	TGT	2	6	215224	215229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016050	T	6	6	215240	215245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016050	TC	4	8	215255	215262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_016050	ACC	2	6	215296	215301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_016050	TAT	2	6	215304	215309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016050	T	6	6	215330	215335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016050	T	6	6	215384	215389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016050	ATA	2	6	215446	215451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016050	GTT	2	6	215469	215474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016050	T	7	7	215473	215479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016050	ATT	2	6	215528	215533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_016050	AGA	2	6	215585	215590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016050	ATTAT	2	10	215676	215685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016050	GCGA	2	8	215724	215731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_016050	TGAC	2	8	215732	215739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_016050	A	6	6	215760	215765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_016050	CTT	2	6	218152	218157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_016050	ATTTA	2	10	218162	218171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016050	A	6	6	218218	218223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016050	TAA	2	6	218224	218229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016050	AAT	2	6	218290	218295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_016050	CTAA	2	8	218307	218314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_016050	TAAT	2	8	218327	218334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016050	TAG	2	6	218346	218351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016050	ATA	2	6	218352	218357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_016050	AGCA	2	8	218366	218373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_016050	TAA	2	6	219477	219482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016050	ATT	2	6	219483	219488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016050	TCG	2	6	219523	219528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_016050	A	8	8	219590	219597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016050	T	6	6	219644	219649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_016050	AAATT	2	10	219711	219720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016050	TTTCT	2	10	219726	219735	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1576	NC_016050	TAT	2	6	220240	220245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016050	TTC	2	6	220311	220316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_016050	TAT	2	6	221067	221072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016050	T	7	7	221081	221087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016050	T	6	6	222189	222194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016050	A	6	6	222197	222202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016050	GTCAA	2	10	222204	222213	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1583	NC_016050	TTA	2	6	222224	222229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016050	TAT	2	6	222233	222238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016050	TGT	2	6	222268	222273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016050	GCT	2	6	224855	224860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_016050	TTG	2	6	225152	225157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016050	TAT	2	6	225225	225230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016050	GTG	2	6	225251	225256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_016050	CAA	2	6	225296	225301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_016050	AAT	2	6	225313	225318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016050	TAA	2	6	225356	225361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016050	AT	3	6	228401	228406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_016050	ATT	2	6	228448	228453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016050	TA	3	6	228484	228489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016050	TA	3	6	228529	228534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016050	T	6	6	228538	228543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_016050	A	6	6	228547	228552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016050	T	6	6	228560	228565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016050	TAC	2	6	228594	228599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_016050	TAATA	2	10	228673	228682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016050	TA	3	6	228686	228691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016050	A	6	6	228756	228761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016050	TAA	2	6	229209	229214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016050	CTT	2	6	229305	229310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_016050	ACA	2	6	230174	230179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_016050	AT	3	6	230182	230187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016050	T	10	10	230198	230207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016050	ATTTA	2	10	230259	230268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016050	GTA	2	6	230299	230304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016050	TA	3	6	230303	230308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016050	TAAAT	2	10	230328	230337	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016050	TATAT	2	10	231698	231707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016050	CAA	2	6	231873	231878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016050	T	8	8	232001	232008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016050	AGT	2	6	232018	232023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016050	ATA	2	6	232024	232029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016050	TAAT	2	8	232059	232066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016050	A	6	6	232088	232093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016050	AAT	2	6	232111	232116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016050	CACTAC	2	12	232135	232146	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_016050	TA	3	6	232156	232161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016050	AAGT	2	8	232173	232180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016050	TTC	2	6	232219	232224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_016050	AC	3	6	232239	232244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_016050	GTG	2	6	232309	232314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016050	T	6	6	232319	232324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016050	TCT	2	6	232338	232343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_016050	AAAT	2	8	232436	232443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016050	CCG	2	6	232479	232484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_016050	TCC	2	6	232490	232495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_016050	TTA	2	6	232534	232539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016050	GA	3	6	232693	232698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016050	T	6	6	232775	232780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016050	TAA	2	6	232879	232884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_016050	ATAG	2	8	232913	232920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_016050	GGA	2	6	232923	232928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_016050	TCT	2	6	232959	232964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1917	NC_016050	AGC	2	6	266373	266378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1918	NC_016050	TCC	2	6	266379	266384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1919	NC_016050	TGA	2	6	266448	266453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1921	NC_016050	GAA	2	6	266512	266517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1922	NC_016050	AAT	2	6	266619	266624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_016050	AGA	2	6	266705	266710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_016050	ATT	2	6	266738	266743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1932	NC_016050	AAATAA	2	12	266991	267002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1934	NC_016050	AAT	2	6	267089	267094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_016050	TAA	2	6	267136	267141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_016050	ATA	2	6	267156	267161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_016050	AAAT	2	8	267198	267205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1938	NC_016050	TAA	2	6	267214	267219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_016050	ATAG	2	8	267251	267258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1947	NC_016050	GTT	2	6	267785	267790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1950	NC_016050	AAGGA	2	10	267849	267858	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_016050	AGA	2	6	267880	267885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1952	NC_016050	AAG	2	6	267960	267965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1996	NC_016050	TA	5	10	272717	272726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1997	NC_016050	T	6	6	275019	275024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_016050	AT	3	6	275046	275051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_016050	A	7	7	275060	275066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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