MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 10356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016050	GTT	2	6	119132	119137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016050	TTC	2	6	119265	119270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016050	ATA	2	6	119292	119297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016050	TGT	3	9	120310	120318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016050	ACTAGT	2	12	120384	120395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1006	NC_016050	T	7	7	120443	120449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016050	AAT	2	6	120458	120463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016050	A	6	6	120497	120502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016050	ACTC	2	8	120512	120519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_016050	CAAA	2	8	120534	120541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_016050	TC	3	6	120585	120590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_016050	CTAT	2	8	120604	120611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_016050	TAA	2	6	120612	120617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016050	T	6	6	120629	120634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016050	TAA	2	6	120641	120646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016050	TTA	3	9	120690	120698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016050	TGC	2	6	120742	120747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016050	ATG	2	6	120801	120806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016050	TTA	2	6	120822	120827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_016050	TA	3	6	120974	120979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016050	A	7	7	121111	121117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016050	GTC	2	6	121190	121195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_016050	CTA	2	6	121251	121256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_016050	GTT	2	6	121265	121270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016050	TAC	2	6	121408	121413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016050	AGA	2	6	121414	121419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_016050	TAT	2	6	121636	121641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016050	T	7	7	123805	123811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016050	TAAG	2	8	123860	123867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016050	GCT	2	6	123916	123921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_016050	AAAT	2	8	125209	125216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016050	CTAC	2	8	125729	125736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_016050	ATT	3	9	125792	125800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016050	AT	3	6	125819	125824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016050	TAT	2	6	125829	125834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016050	AGTA	2	8	125835	125842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016050	GAG	2	6	128282	128287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016050	TTG	2	6	128291	128296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_016050	TCG	2	6	128307	128312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016050	TTA	2	6	128363	128368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016050	CAA	2	6	128426	128431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1045	NC_016050	ACA	2	6	128455	128460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1047	NC_016050	GCAG	2	8	128485	128492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_016050	TAA	2	6	128496	128501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016050	AT	3	6	128541	128546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016050	GTT	2	6	128670	128675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016050	TAG	2	6	128681	128686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1053	NC_016050	AAT	2	6	128715	128720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016050	GCAAG	2	10	128747	128756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_016050	ATA	2	6	128757	128762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016050	CTA	2	6	128784	128789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1058	NC_016050	ATTG	2	8	128840	128847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016050	TA	3	6	128909	128914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016050	A	6	6	128984	128989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016050	TA	3	6	129019	129024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016050	AAAG	2	8	129028	129035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016050	ATAA	2	8	129040	129047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016050	GAT	2	6	129057	129062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016050	TGA	2	6	129105	129110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016050	TAT	2	6	129111	129116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_016050	TAA	2	6	129255	129260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016050	GCA	2	6	129287	129292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1072	NC_016050	ATA	2	6	129438	129443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016050	ATC	2	6	129456	129461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_016050	TCT	2	6	132688	132693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_016050	TAT	3	9	132821	132829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_016050	TTG	2	6	133127	133132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016050	T	8	8	133209	133216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016050	T	6	6	133252	133257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016050	TAC	2	6	133265	133270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1107	NC_016050	T	6	6	133310	133315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016050	TATTTT	2	12	133584	133595	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_016050	TTG	3	9	134221	134229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_016050	TTG	2	6	134316	134321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016050	GAAA	2	8	134384	134391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016050	TTG	2	6	134428	134433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016050	CAA	2	6	134448	134453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_016050	GAT	2	6	134454	134459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016050	GCT	2	6	134500	134505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1121	NC_016050	TAA	2	6	134639	134644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016050	TAAT	2	8	134664	134671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016050	TA	3	6	134681	134686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016050	TAA	2	6	134700	134705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016050	AAT	2	6	134737	134742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016050	G	6	6	134758	134763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016050	TA	3	6	134790	134795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016050	CGCTC	2	10	134862	134871	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1129	NC_016050	TTTG	2	8	135499	135506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016050	T	7	7	135585	135591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016050	ATT	2	6	135592	135597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016050	T	6	6	135596	135601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016050	ACT	2	6	135624	135629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_016050	GTA	2	6	135666	135671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016050	TCAAT	2	10	135706	135715	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1137	NC_016050	T	6	6	135798	135803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_016050	T	6	6	137391	137396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_016050	AGC	2	6	156971	156976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_016050	TA	4	8	157018	157025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1274	NC_016050	ATG	2	6	157116	157121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_016050	CAA	2	6	184595	184600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_016050	ATAA	2	8	184601	184608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_016050	AAATC	2	10	184612	184621	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1415	NC_016050	TTTAA	2	10	184680	184689	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_016050	AT	3	6	184715	184720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_016050	ATAA	2	8	184790	184797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_016050	TA	3	6	184807	184812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_016050	TAA	2	6	184878	184883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_016050	GAGAG	2	10	184891	184900	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_016050	TTA	2	6	184902	184907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_016050	A	7	7	184915	184921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_016050	ATT	2	6	184958	184963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_016050	TCA	2	6	184985	184990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1425	NC_016050	TCAG	2	8	185014	185021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1426	NC_016050	A	6	6	189176	189181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_016050	T	6	6	189186	189191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_016050	GAG	2	6	189298	189303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_016050	TA	3	6	189359	189364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_016050	GTC	2	6	193545	193550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_016050	CGCTC	2	10	193585	193594	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1432	NC_016050	GTAT	2	8	193636	193643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_016050	ATA	2	6	193708	193713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_016050	GTG	2	6	193767	193772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_016050	CAA	2	6	193779	193784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1436	NC_016050	CTAG	2	8	193792	193799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1437	NC_016050	TAC	2	6	193825	193830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1438	NC_016050	ATT	2	6	193833	193838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_016050	A	8	8	193840	193847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_016050	A	6	6	193854	193859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_016050	T	6	6	193865	193870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_016050	ATT	2	6	195086	195091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_016050	A	6	6	195125	195130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_016050	AGC	2	6	196805	196810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1445	NC_016050	TTAC	2	8	196860	196867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1446	NC_016050	A	6	6	196889	196894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_016050	AT	5	10	197807	197816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_016050	TA	3	6	198345	198350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_016050	TAA	2	6	198368	198373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_016050	GTT	2	6	200202	200207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_016050	TTA	2	6	200213	200218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_016050	A	6	6	200282	200287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_016050	A	6	6	200291	200296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_016050	CAA	2	6	200425	200430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1455	NC_016050	GTT	2	6	202588	202593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_016050	TCA	2	6	202610	202615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1459	NC_016050	ATT	2	6	202683	202688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1460	NC_016050	T	6	6	202687	202692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1461	NC_016050	T	6	6	202697	202702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_016050	ATG	2	6	202735	202740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1464	NC_016050	CAA	2	6	202802	202807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1466	NC_016050	ATA	2	6	203680	203685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1468	NC_016050	TAA	2	6	204464	204469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1469	NC_016050	AGTA	2	8	204476	204483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1470	NC_016050	TTA	2	6	204565	204570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1471	NC_016050	GAC	2	6	204571	204576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1473	NC_016050	T	6	6	204640	204645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1474	NC_016050	TAA	2	6	204655	204660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1475	NC_016050	GCA	2	6	204708	204713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1477	NC_016050	AAT	2	6	205921	205926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1478	NC_016050	TTG	2	6	205973	205978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1486	NC_016050	TTG	2	6	209816	209821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1487	NC_016050	TCGCT	2	10	209850	209859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1488	NC_016050	TTG	2	6	209872	209877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1489	NC_016050	ATT	2	6	209939	209944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1494	NC_016050	TAT	3	9	210626	210634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1496	NC_016050	T	6	6	210776	210781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1497	NC_016050	ATT	2	6	210782	210787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_016050	GCT	2	6	210814	210819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_016050	CAA	2	6	210844	210849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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