MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 10356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016050	AGC	2	6	46544	46549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016050	AGC	2	6	46583	46588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_016050	TAG	2	6	46591	46596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016050	TAG	2	6	46606	46611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016050	CAA	2	6	46687	46692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016050	TTAAGG	2	12	46708	46719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016050	CAA	2	6	46762	46767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_016050	TGC	2	6	46794	46799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016050	ATA	2	6	46956	46961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016050	CTAAC	2	10	47016	47025	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
511	NC_016050	TAG	2	6	47031	47036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016050	CAA	2	6	47060	47065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016050	AG	3	6	47150	47155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016050	A	6	6	47165	47170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016050	CAAT	2	8	47196	47203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_016050	AAG	2	6	47252	47257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016050	ATA	2	6	47333	47338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016050	AAG	2	6	47351	47356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016050	ATG	2	6	47363	47368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016050	TGT	2	6	47373	47378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016050	AAAAC	2	10	47386	47395	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
522	NC_016050	ATT	2	6	47409	47414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016050	A	7	7	47451	47457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016050	GTA	2	6	47458	47463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016050	ACT	2	6	47521	47526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016050	TAA	2	6	47532	47537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016050	GCA	2	6	47569	47574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016050	TGA	2	6	47577	47582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016050	A	6	6	47602	47607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016050	CGG	2	6	47688	47693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_016050	CGG	2	6	47700	47705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016050	TA	3	6	47744	47749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016050	TAT	2	6	47817	47822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016050	CAA	3	9	47836	47844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016050	CAA	2	6	47898	47903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_016050	ATA	2	6	48052	48057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016050	AAT	2	6	48090	48095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016050	TAACT	2	10	48119	48128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
539	NC_016050	ATTT	2	8	48254	48261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016050	AGC	2	6	48294	48299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_016050	TTAC	2	8	48333	48340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
542	NC_016050	GCA	2	6	48388	48393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016050	CCA	2	6	48404	48409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_016050	TTAAAG	2	12	48418	48429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016050	AGC	2	6	48481	48486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016050	ATA	2	6	48513	48518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016050	A	6	6	48574	48579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016050	CA	3	6	48587	48592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_016050	TTC	2	6	48652	48657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_016050	GTT	2	6	50010	50015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016050	TTG	2	6	50028	50033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016050	GTA	2	6	50034	50039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016050	CAT	3	9	50040	50048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016050	TTC	3	9	50125	50133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016050	ACA	3	9	50147	50155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016050	A	6	6	50191	50196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016050	CT	3	6	50275	50280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_016050	TTA	2	6	50585	50590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016050	AGT	2	6	50649	50654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016050	TA	3	6	50661	50666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016050	ATG	2	6	50672	50677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016050	CTT	2	6	50687	50692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016050	GTA	2	6	50695	50700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016050	AAC	2	6	50716	50721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016050	AT	3	6	50738	50743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016050	ATG	2	6	50751	50756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016050	TAT	2	6	50831	50836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016050	CAT	2	6	50857	50862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_016050	A	6	6	50898	50903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016050	GCT	2	6	50910	50915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_016050	GTC	2	6	50918	50923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016050	AAGAG	2	10	50945	50954	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016050	ACT	2	6	50986	50991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_016050	AGC	2	6	51012	51017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_016050	ATAC	2	8	51019	51026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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577	NC_016050	T	7	7	51146	51152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016050	TTGC	2	8	51163	51170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
579	NC_016050	ACT	2	6	51200	51205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_016050	TC	3	6	51207	51212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_016050	ATA	2	6	51214	51219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016050	TAG	2	6	51229	51234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016050	TTA	2	6	51237	51242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016050	TTC	2	6	51278	51283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016050	AT	5	10	51301	51310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016050	AGTAC	2	10	51317	51326	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
587	NC_016050	TAA	2	6	51367	51372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016050	TA	3	6	51399	51404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016050	GCT	2	6	51407	51412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016050	ATT	2	6	51461	51466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016050	ATA	2	6	51467	51472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016050	AAGT	2	8	51486	51493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016050	ATA	3	9	51503	51511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016050	TAT	2	6	51531	51536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016050	AT	3	6	51551	51556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016050	CTT	2	6	51563	51568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_016050	TAT	2	6	51642	51647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016050	GCC	2	6	51674	51679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_016050	T	6	6	51737	51742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_016050	TTC	2	6	51779	51784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_016050	TTC	2	6	51827	51832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016050	GAA	2	6	51860	51865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016050	T	6	6	51891	51896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016050	ATT	2	6	51960	51965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016050	TTA	2	6	51989	51994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_016050	ATCT	2	8	52119	52126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_016050	T	8	8	52138	52145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016050	TTTA	2	8	52155	52162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016050	TTTCT	2	10	52191	52200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
612	NC_016050	T	6	6	52228	52233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016050	AAC	2	6	52242	52247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_016050	CCGC	2	8	52260	52267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
615	NC_016050	TAC	2	6	52273	52278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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617	NC_016050	TAT	2	6	52373	52378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016050	TTA	2	6	52381	52386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016050	CA	3	6	52412	52417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
620	NC_016050	TTC	2	6	52428	52433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_016050	TTA	2	6	52445	52450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016050	AT	3	6	52517	52522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016050	TGCT	2	8	52596	52603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_016050	T	6	6	52609	52614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016050	T	6	6	52629	52634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016050	CTG	2	6	52682	52687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016050	TTTA	2	8	52701	52708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_016050	A	7	7	52713	52719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016050	TCA	2	6	52759	52764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016050	T	6	6	52786	52791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016050	TCAC	2	8	52810	52817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_016050	TAAA	2	8	52850	52857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016050	AGTATT	2	12	52866	52877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016050	T	7	7	52902	52908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016050	CAA	2	6	52916	52921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016050	CCA	2	6	52936	52941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_016050	T	6	6	53033	53038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_016050	CAA	2	6	53166	53171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_016050	CAA	2	6	53232	53237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_016050	CATTA	2	10	53257	53266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
641	NC_016050	TTC	2	6	53308	53313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_016050	TCA	2	6	53366	53371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_016050	TGA	2	6	53373	53378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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