MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseburia hominis A2-183 chromosome

Total Repeats: 1077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015977	TTTC	2	8	1438	1445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015977	TTTC	2	8	1451	1458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015977	AGGA	2	8	1666	1673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015977	TTTA	2	8	9436	9443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015977	GAAC	2	8	9520	9527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015977	GTTA	2	8	19216	19223	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015977	GAAA	2	8	19258	19265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015977	TCCG	2	8	20126	20133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015977	ATGA	2	8	25152	25159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015977	GACG	2	8	25366	25373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015977	AAAC	2	8	25450	25457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015977	CGAA	2	8	25522	25529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015977	CGAG	2	8	27147	27154	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015977	CGAA	2	8	27468	27475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015977	ACGA	2	8	27580	27587	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015977	AGAA	2	8	27885	27892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015977	GCGG	2	8	30279	30286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015977	GGAC	2	8	30331	30338	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015977	ATCG	2	8	30535	30542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015977	TATG	2	8	34172	34179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015977	ATAA	2	8	34202	34209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015977	TGAC	2	8	37180	37187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015977	CTGC	2	8	37242	37249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015977	CTGT	2	8	37369	37376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015977	ATAA	2	8	37388	37395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015977	CGTT	2	8	37401	37408	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015977	CTTT	2	8	45279	45286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015977	GTTC	2	8	45607	45614	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015977	AAAT	2	8	45703	45710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015977	GCAG	2	8	46407	46414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015977	ACAG	2	8	46495	46502	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015977	TTCT	2	8	46749	46756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015977	ATGA	2	8	46788	46795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015977	GATA	2	8	47959	47966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015977	TTTA	2	8	49324	49331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015977	CTTT	2	8	67234	67241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015977	GGAT	2	8	75473	75480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015977	GCAG	2	8	77356	77363	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015977	TTAT	2	8	77369	77376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015977	AGAC	2	8	81166	81173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015977	GGAC	2	8	89298	89305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015977	AGCA	2	8	91903	91910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015977	TATG	2	8	92697	92704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015977	TGGC	2	8	96946	96953	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015977	AAAT	2	8	107476	107483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015977	GCAG	2	8	110509	110516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015977	AGGA	2	8	112087	112094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015977	TCAG	2	8	115601	115608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015977	GACA	2	8	122450	122457	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015977	TGGC	2	8	133590	133597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015977	GAAG	2	8	140245	140252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015977	AATG	2	8	141369	141376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015977	GAAC	2	8	154120	154127	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015977	AATC	2	8	161264	161271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015977	ACCG	2	8	165560	165567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015977	GGAT	2	8	172612	172619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015977	AATG	2	8	192622	192629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015977	ATGG	2	8	192638	192645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015977	AGAT	2	8	208801	208808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015977	CCCA	2	8	208932	208939	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_015977	GCCA	2	8	213949	213956	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015977	AAAT	2	8	215633	215640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015977	ATTG	2	8	215678	215685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015977	GAAT	2	8	216775	216782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015977	GCAG	2	8	218942	218949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015977	AAAT	2	8	219484	219491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015977	TAAA	2	8	221786	221793	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015977	CGGG	2	8	238734	238741	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015977	TACG	2	8	241264	241271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015977	ACCG	2	8	247863	247870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015977	ATGA	2	8	248475	248482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015977	TTCT	2	8	248573	248580	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015977	GACG	2	8	248839	248846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015977	AACT	2	8	250385	250392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_015977	ATCT	2	8	261550	261557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015977	GGAT	2	8	261571	261578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015977	GGAT	2	8	261594	261601	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015977	GGAT	2	8	261617	261624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015977	GGAT	2	8	261640	261647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015977	GAGG	2	8	261716	261723	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015977	AAGA	2	8	265692	265699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015977	TGAT	2	8	271287	271294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015977	AGAC	2	8	271639	271646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015977	GCAA	2	8	277452	277459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015977	AGCC	2	8	283329	283336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015977	AGGA	2	8	291118	291125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015977	AGAA	2	8	294349	294356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015977	AGAC	2	8	301430	301437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015977	AGGA	2	8	301572	301579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015977	TTTC	2	8	303171	303178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015977	ATAC	2	8	304702	304709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015977	GATA	2	8	305087	305094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015977	AAGG	2	8	305123	305130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015977	AAGG	2	8	306891	306898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015977	TTGC	2	8	308846	308853	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015977	AAGG	2	8	315072	315079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015977	GAGG	2	8	317680	317687	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015977	AAAG	2	8	322843	322850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015977	TAAA	2	8	324532	324539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015977	CGTG	2	8	341360	341367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015977	AAGA	2	8	341885	341892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015977	GTAC	3	12	346080	346091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015977	CTGC	2	8	347159	347166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015977	AAAT	2	8	353571	353578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015977	GATT	2	8	353816	353823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015977	AGGA	2	8	354340	354347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015977	CTGT	2	8	355276	355283	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015977	TTTA	2	8	358964	358971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015977	CCGA	2	8	364173	364180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015977	AAAT	2	8	364306	364313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015977	AAAC	2	8	369420	369427	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015977	CTAA	2	8	369428	369435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015977	AAGC	2	8	369609	369616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015977	TCCC	2	8	369735	369742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_015977	CCAA	2	8	369827	369834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015977	TAAA	2	8	369999	370006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015977	CGCC	2	8	373072	373079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_015977	AAAC	2	8	374081	374088	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015977	ACAG	2	8	378512	378519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015977	GCTG	2	8	378558	378565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015977	CTTT	2	8	383458	383465	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015977	TTAT	2	8	383568	383575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015977	GTAT	2	8	388781	388788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015977	AGGC	2	8	391631	391638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015977	GGCA	2	8	391786	391793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015977	TATT	2	8	391890	391897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015977	GCTG	2	8	391949	391956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015977	CAAT	2	8	392217	392224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015977	GAAA	2	8	400073	400080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015977	GCTG	2	8	400086	400093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015977	TCAA	2	8	400430	400437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015977	TTTC	2	8	400517	400524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015977	TGGC	2	8	407301	407308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015977	GGAA	2	8	414349	414356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015977	CCAA	2	8	422572	422579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015977	GATA	2	8	432524	432531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015977	GGAG	2	8	432542	432549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015977	TTGC	2	8	436451	436458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015977	TCAC	2	8	436506	436513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015977	TAGG	2	8	436976	436983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015977	GAAA	2	8	439096	439103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015977	ATCT	2	8	456848	456855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015977	AGGA	2	8	456862	456869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015977	CCTT	2	8	457409	457416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015977	GAGG	2	8	457443	457450	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015977	GTAG	2	8	463677	463684	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015977	AATA	2	8	463884	463891	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015977	TAAA	2	8	463940	463947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015977	ATGA	2	8	464877	464884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015977	CATT	2	8	465729	465736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015977	TGAA	2	8	471496	471503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015977	TGAC	2	8	475225	475232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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