MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015970	GCAAG	2	10	157	166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015970	TGCGT	2	10	846	855	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015970	GGACG	2	10	3679	3688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015970	GGGTG	2	10	5867	5876	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015970	AAACC	2	10	13777	13786	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015970	CGGGC	2	10	38977	38986	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_015970	CGCAT	2	10	39307	39316	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015970	GCCTC	2	10	48691	48700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015970	GCGTG	2	10	48706	48715	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015970	CCGAC	2	10	49582	49591	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_015970	CCAGT	2	10	73038	73047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_015970	AGGGG	2	10	73429	73438	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015970	AGCGA	2	10	79033	79042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015970	AGGTC	2	10	91002	91011	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015970	CCACC	2	10	95429	95438	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_015970	AATCA	2	10	97024	97033	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015970	CCCAT	2	10	98963	98972	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_015970	TGCTT	2	10	99318	99327	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015970	GACCA	2	10	99468	99477	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015970	GGCCA	2	10	100094	100103	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015970	CGTTG	2	10	100146	100155	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015970	CCTTC	2	10	100675	100684	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_015970	CCCAT	2	10	102889	102898	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.