MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 plasmid pRHOM17201

Total Repeats: 595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015970	CCGG	2	8	92681	92688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_015970	TGT	3	9	93318	93326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015970	TAC	2	6	93422	93427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_015970	TAC	2	6	93494	93499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015970	TAT	2	6	94685	94690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015970	CGG	2	6	94721	94726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015970	GCG	2	6	94735	94740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015970	AAC	2	6	95318	95323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015970	CCACC	2	10	95429	95438	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
510	NC_015970	T	7	7	95562	95568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015970	CAG	2	6	95576	95581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015970	CGT	2	6	95649	95654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015970	CGT	2	6	95692	95697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015970	A	6	6	95732	95737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015970	CAA	2	6	95745	95750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015970	A	6	6	95753	95758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015970	CTG	2	6	96868	96873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015970	AAC	2	6	96915	96920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015970	TAC	2	6	96935	96940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015970	ATG	2	6	96954	96959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015970	GCG	2	6	96979	96984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015970	GCC	2	6	97013	97018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_015970	AATCA	2	10	97024	97033	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
524	NC_015970	CAT	2	6	97111	97116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015970	AGG	2	6	97685	97690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015970	GAA	2	6	97731	97736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015970	ATCG	2	8	97739	97746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_015970	AGGC	2	8	98483	98490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_015970	CTG	2	6	98587	98592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015970	CTT	2	6	98628	98633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015970	CA	3	6	98727	98732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_015970	GAG	2	6	98739	98744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015970	TCCA	2	8	98796	98803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_015970	AGC	2	6	98812	98817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015970	CCG	2	6	98850	98855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_015970	TGGG	2	8	98869	98876	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015970	CCCAT	2	10	98963	98972	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
538	NC_015970	CTT	2	6	99003	99008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015970	TCC	2	6	99102	99107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_015970	GCTC	2	8	99117	99124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
541	NC_015970	GTTC	2	8	99130	99137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_015970	GGC	2	6	99170	99175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015970	CCA	2	6	99196	99201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_015970	GGA	2	6	99249	99254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015970	GCA	2	6	99274	99279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015970	TGCTT	2	10	99318	99327	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
547	NC_015970	TCC	2	6	99351	99356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_015970	CGCC	2	8	99368	99375	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
549	NC_015970	GTT	2	6	99451	99456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015970	GACCA	2	10	99468	99477	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
551	NC_015970	ACGC	2	8	99491	99498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
552	NC_015970	GGCG	2	8	99544	99551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
553	NC_015970	ATGG	2	8	99751	99758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015970	GAG	2	6	99764	99769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015970	AGTA	2	8	99777	99784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015970	GGT	2	6	99789	99794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015970	GCA	2	6	99884	99889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_015970	GTC	2	6	99912	99917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015970	TTG	2	6	99967	99972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015970	GAA	2	6	99975	99980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015970	GGCCA	2	10	100094	100103	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
562	NC_015970	CGTTG	2	10	100146	100155	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
563	NC_015970	TCC	2	6	100177	100182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_015970	GGA	2	6	100190	100195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015970	CTTG	2	8	100214	100221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_015970	CTT	2	6	100357	100362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015970	CCT	2	6	100363	100368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_015970	GAT	2	6	100487	100492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015970	GGA	2	6	100502	100507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015970	ATA	2	6	100558	100563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015970	CTTC	2	8	100656	100663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_015970	CCTTC	2	10	100675	100684	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
573	NC_015970	CGA	2	6	100765	100770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_015970	T	7	7	100772	100778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015970	TTCA	2	8	101964	101971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
576	NC_015970	CTC	2	6	101973	101978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_015970	ATG	2	6	101980	101985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015970	CT	3	6	101999	102004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_015970	GAG	2	6	102008	102013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015970	TCGG	2	8	102027	102034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
581	NC_015970	GAG	2	6	102665	102670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015970	TCCA	2	8	102722	102729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_015970	AGC	2	6	102738	102743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015970	CCG	2	6	102776	102781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_015970	TGGG	2	8	102795	102802	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015970	CCCAT	2	10	102889	102898	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
587	NC_015970	CACCAG	2	12	102899	102910	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015970	CTT	2	6	102929	102934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015970	CCG	2	6	103033	103038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_015970	CCA	2	6	103123	103128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_015970	GGA	2	6	103174	103179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015970	CGC	2	6	103186	103191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_015970	GCA	2	6	103199	103204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015970	AGG	2	6	103254	103259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015970	CCCT	2	8	105320	105327	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

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