MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 455

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015966	AC	5	10	4808	4817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015966	GT	3	6	9247	9252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015966	GC	3	6	19496	19501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015966	CG	3	6	20125	20130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015966	CG	3	6	23166	23171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015966	TG	3	6	31536	31541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015966	TG	3	6	43464	43469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015966	GA	4	8	43627	43634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015966	CG	3	6	47030	47035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015966	GC	3	6	49229	49234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015966	TA	3	6	53510	53515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015966	GA	3	6	59617	59622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015966	TG	3	6	59728	59733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015966	TC	3	6	82337	82342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015966	CG	3	6	88246	88251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015966	GC	3	6	93201	93206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015966	TC	3	6	93517	93522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015966	GT	3	6	102148	102153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015966	CG	4	8	105380	105387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015966	AT	3	6	116160	116165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015966	GC	3	6	130116	130121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015966	GT	3	6	142600	142605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015966	CA	3	6	148626	148631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015966	CG	3	6	150333	150338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015966	GC	3	6	150341	150346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015966	GT	3	6	165953	165958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015966	CT	3	6	166059	166064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015966	AC	3	6	167451	167456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015966	CT	3	6	169902	169907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015966	CG	3	6	172433	172438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015966	CG	3	6	172650	172655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015966	CG	3	6	172682	172687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015966	TC	3	6	172750	172755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015966	TG	3	6	190205	190210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015966	GC	3	6	201822	201827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015966	AG	3	6	201828	201833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015966	TC	3	6	202244	202249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015966	AC	3	6	210027	210032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015966	GA	3	6	221451	221456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015966	GA	3	6	230758	230763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015966	TC	3	6	234956	234961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015966	TG	3	6	244480	244485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015966	TC	3	6	245333	245338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015966	CG	3	6	249942	249947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015966	TG	3	6	260585	260590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015966	GC	3	6	314241	314246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015966	TG	3	6	323227	323232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015966	CG	3	6	326403	326408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015966	GA	3	6	332768	332773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015966	TG	3	6	332810	332815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015966	TG	3	6	336800	336805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015966	CA	3	6	357559	357564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015966	GC	3	6	385311	385316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015966	GC	3	6	396165	396170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015966	AG	4	8	409459	409466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015966	CA	3	6	423356	423361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015966	GC	3	6	423609	423614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015966	CG	3	6	424313	424318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015966	GC	3	6	424423	424428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015966	GC	3	6	436514	436519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015966	CG	3	6	447463	447468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015966	GC	3	6	448744	448749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015966	GC	4	8	450563	450570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015966	GC	3	6	451403	451408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015966	GC	3	6	453340	453345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015966	AG	3	6	453527	453532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015966	CT	3	6	466638	466643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015966	GT	3	6	477140	477145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015966	GC	3	6	477231	477236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015966	GC	3	6	479949	479954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015966	CA	3	6	488956	488961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015966	AC	5	10	501917	501926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015966	TC	3	6	513428	513433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015966	CG	3	6	549206	549211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015966	CG	3	6	549563	549568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015966	CG	3	6	554257	554262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015966	AT	3	6	557713	557718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015966	GA	3	6	572630	572635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015966	CG	3	6	597103	597108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015966	CT	3	6	597167	597172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015966	AC	3	6	599320	599325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015966	TG	3	6	609351	609356	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015966	TC	3	6	609821	609826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015966	GC	3	6	616842	616847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015966	CG	3	6	617088	617093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015966	AG	3	6	622041	622046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015966	CA	3	6	627335	627340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015966	CT	3	6	633478	633483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015966	CG	3	6	635565	635570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015966	CG	3	6	652013	652018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015966	GC	3	6	658177	658182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015966	GC	3	6	658683	658688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015966	TA	3	6	667080	667085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015966	CG	3	6	673419	673424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015966	TG	3	6	683024	683029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015966	GC	3	6	701305	701310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015966	CG	3	6	702641	702646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015966	CG	3	6	702973	702978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015966	GC	3	6	703213	703218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015966	CG	3	6	703528	703533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015966	TG	3	6	704257	704262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015966	TA	3	6	707881	707886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015966	TG	3	6	708077	708082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015966	GT	3	6	708151	708156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015966	CG	3	6	727860	727865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015966	CA	3	6	729435	729440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015966	CG	3	6	729547	729552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015966	AG	3	6	729748	729753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015966	AT	3	6	729786	729791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015966	GT	3	6	730566	730571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015966	GC	3	6	737341	737346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015966	GC	3	6	759639	759644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015966	TG	3	6	766378	766383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015966	AC	3	6	774424	774429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015966	CG	3	6	774476	774481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015966	CA	3	6	784421	784426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015966	GC	3	6	784641	784646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015966	GC	3	6	784667	784672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015966	GC	3	6	793395	793400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015966	TG	3	6	797558	797563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015966	CG	3	6	824493	824498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015966	GC	3	6	824533	824538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015966	GC	3	6	828929	828934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015966	AT	3	6	831063	831068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015966	TG	3	6	864397	864402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015966	GA	3	6	869207	869212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015966	GA	3	6	872560	872565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015966	AC	3	6	873751	873756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015966	GC	3	6	888613	888618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015966	CG	3	6	890915	890920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015966	GC	3	6	890970	890975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015966	GC	3	6	891666	891671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015966	GC	3	6	891929	891934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015966	GC	3	6	893123	893128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015966	TC	3	6	903796	903801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015966	GC	3	6	908202	908207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015966	CG	4	8	908933	908940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015966	CG	3	6	909007	909012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015966	CG	3	6	910345	910350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015966	CG	3	6	910427	910432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015966	CG	3	6	914254	914259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015966	CG	3	6	935087	935092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015966	TG	3	6	939586	939591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015966	GC	3	6	944539	944544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015966	GC	3	6	944563	944568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015966	GC	3	6	951362	951367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015966	GA	3	6	975317	975322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015966	CA	3	6	975898	975903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015966	CG	3	6	990809	990814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015966	GC	4	8	990890	990897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015966	GC	3	6	991157	991162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_015966	GC	3	6	992339	992344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015966	CG	3	6	1024742	1024747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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448	NC_015966	GC	3	6	3170403	3170408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
449	NC_015966	CG	3	6	3177722	3177727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
450	NC_015966	GC	3	6	3186705	3186710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
451	NC_015966	GA	3	6	3188070	3188075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_015966	AG	3	6	3193528	3193533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015966	CT	3	6	3193556	3193561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_015966	AT	3	6	3194532	3194537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_015966	GC	3	6	3214521	3214526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.