MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 3893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015966	CCA	2	6	104	109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_015966	CGC	2	6	201	206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_015966	ATT	2	6	4708	4713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015966	GAA	2	6	4729	4734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015966	GGC	2	6	4835	4840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015966	ACG	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015966	CGA	2	6	4892	4897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015966	GCC	2	6	5809	5814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_015966	ACG	2	6	6787	6792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015966	TCT	2	6	12055	12060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015966	GTC	2	6	12099	12104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015966	CTT	2	6	15182	15187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015966	CCG	2	6	15212	15217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015966	CCG	2	6	15293	15298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015966	CGG	2	6	19320	19325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015966	GCT	2	6	19337	19342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015966	GGC	2	6	19381	19386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015966	CTG	2	6	20187	20192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015966	CGA	2	6	23131	23136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015966	AAC	2	6	23158	23163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015966	CGC	2	6	24459	24464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015966	CGT	2	6	24491	24496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015966	TCT	2	6	24524	24529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015966	CTT	2	6	28151	28156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015966	GTC	2	6	31628	31633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015966	GTT	2	6	31693	31698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015966	GGC	2	6	33296	33301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015966	GTT	2	6	34600	34605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015966	AAC	2	6	34619	34624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015966	GCT	2	6	35339	35344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015966	TGC	2	6	35386	35391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015966	AGG	2	6	35426	35431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015966	GCG	2	6	35451	35456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015966	CTT	2	6	36614	36619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015966	ATA	2	6	36629	36634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015966	CAA	2	6	43373	43378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015966	TGA	2	6	43513	43518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015966	GAG	2	6	43553	43558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015966	AGC	2	6	49213	49218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015966	TCG	2	6	50750	50755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015966	AGC	2	6	53472	53477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015966	GCA	2	6	53534	53539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015966	AGG	2	6	54015	54020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015966	GAA	2	6	58491	58496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015966	GGC	2	6	58549	58554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015966	CGC	2	6	58717	58722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015966	CGC	2	6	58746	58751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015966	GCC	2	6	58773	58778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015966	GGC	2	6	58864	58869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015966	GCA	2	6	58888	58893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015966	CGG	2	6	58908	58913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015966	GGA	2	6	58982	58987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015966	GGC	2	6	59069	59074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015966	CCG	2	6	59087	59092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015966	GAC	2	6	59191	59196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015966	TGG	2	6	59308	59313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015966	GGC	2	6	59321	59326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015966	CGG	2	6	59371	59376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015966	GGC	2	6	59402	59407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015966	AGC	2	6	59466	59471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015966	CGG	2	6	59476	59481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015966	GGA	2	6	59489	59494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015966	GCC	2	6	59562	59567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015966	GCT	2	6	59579	59584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015966	CGT	2	6	59624	59629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015966	GAA	2	6	59710	59715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015966	ATT	2	6	59757	59762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015966	CTT	2	6	63360	63365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015966	GCC	2	6	63461	63466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_015966	TGG	2	6	63548	63553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015966	AAC	2	6	72632	72637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015966	GCG	2	6	72660	72665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015966	GTT	2	6	72690	72695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015966	CAA	2	6	79159	79164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015966	CGA	2	6	79526	79531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015966	GCA	2	6	81510	81515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015966	CGT	2	6	81654	81659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015966	CGC	2	6	82352	82357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015966	GCG	2	6	83292	83297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015966	CGA	2	6	87458	87463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015966	GCC	2	6	87490	87495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015966	CGC	2	6	87556	87561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015966	GCC	2	6	88656	88661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015966	GCC	2	6	92220	92225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015966	CGT	2	6	93207	93212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015966	GAA	2	6	93274	93279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015966	CGG	2	6	93523	93528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015966	ACC	2	6	93577	93582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015966	CGC	2	6	100959	100964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015966	GGA	2	6	101613	101618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015966	CTG	2	6	101650	101655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015966	GCT	2	6	101673	101678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015966	ATG	2	6	101710	101715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015966	GCT	2	6	101745	101750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015966	CGT	2	6	101808	101813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015966	CCG	2	6	101888	101893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015966	CGG	2	6	102044	102049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015966	TCC	2	6	105071	105076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_015966	CCA	2	6	105132	105137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015966	AGC	2	6	105319	105324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015966	CGC	2	6	105349	105354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015966	TGA	2	6	105374	105379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015966	TTC	2	6	107853	107858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015966	AAG	2	6	107865	107870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015966	CGA	2	6	110721	110726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015966	GTC	2	6	113931	113936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015966	GAT	2	6	114897	114902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015966	ACT	2	6	114978	114983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015966	GTC	2	6	115871	115876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015966	CAA	2	6	115959	115964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015966	CCG	2	6	116076	116081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015966	GTT	2	6	116463	116468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015966	ACG	2	6	119249	119254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015966	CGG	2	6	119278	119283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015966	CGG	2	6	120111	120116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015966	AGG	2	6	121417	121422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015966	CGT	2	6	121426	121431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015966	AGC	2	6	126668	126673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015966	AGA	2	6	126710	126715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015966	GCC	2	6	132550	132555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015966	TTC	2	6	135045	135050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015966	GTT	2	6	136031	136036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015966	GAA	2	6	136100	136105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015966	GAG	2	6	136136	136141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015966	TGT	2	6	141239	141244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015966	GAT	2	6	141281	141286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015966	CAT	2	6	142583	142588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015966	TGG	2	6	148585	148590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015966	GCA	2	6	148632	148637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015966	CGG	2	6	150309	150314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015966	AGC	2	6	154516	154521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015966	GCA	2	6	154748	154753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015966	TCT	2	6	155519	155524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015966	GCT	2	6	155545	155550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015966	AGG	2	6	162707	162712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015966	CTT	2	6	163682	163687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015966	CTT	2	6	163807	163812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015966	GGC	2	6	165658	165663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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