MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 6365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015966	GT	3	6	2165652	2165657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015966	TATC	2	8	2165671	2165678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4003	NC_015966	CGCA	2	8	2165804	2165811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_015966	CAC	2	6	2165812	2165817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_015966	CG	3	6	2165844	2165849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_015966	CGG	2	6	2165955	2165960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_015966	CAG	2	6	2166002	2166007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_015966	GT	3	6	2166321	2166326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015966	A	7	7	2168261	2168267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015966	TTC	2	6	2168593	2168598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_015966	CAC	2	6	2168674	2168679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_015966	GAA	2	6	2168691	2168696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015966	AGC	2	6	2168859	2168864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015966	GAA	2	6	2171946	2171951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_015966	ACCG	2	8	2172055	2172062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_015966	ACC	2	6	2172160	2172165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_015966	CGG	2	6	2174195	2174200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_015966	TAC	2	6	2176047	2176052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_015966	GGCC	2	8	2176317	2176324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_015966	GTC	2	6	2178468	2178473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015966	CG	3	6	2178536	2178541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_015966	TCG	2	6	2178558	2178563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_015966	ACG	2	6	2178589	2178594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015966	TGC	2	6	2178639	2178644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015966	CAC	2	6	2178714	2178719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_015966	T	6	6	2178742	2178747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015966	AT	3	6	2179870	2179875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4029	NC_015966	AC	3	6	2180650	2180655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_015966	GAG	2	6	2180657	2180662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015966	GCACG	2	10	2180896	2180905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4032	NC_015966	GCCT	2	8	2180921	2180928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_015966	TCG	2	6	2182252	2182257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_015966	ATG	2	6	2182274	2182279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015966	GCAC	2	8	2182297	2182304	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_015966	A	6	6	2182335	2182340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015966	CCT	3	9	2183619	2183627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_015966	TAAA	2	8	2183656	2183663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015966	A	6	6	2183661	2183666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015966	TTG	2	6	2183705	2183710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015966	TGT	2	6	2184925	2184930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015966	AAACAA	2	12	2184933	2184944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4043	NC_015966	GCC	2	6	2189017	2189022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_015966	GAGC	2	8	2189172	2189179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_015966	CAAC	2	8	2189213	2189220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_015966	GGC	2	6	2190153	2190158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4048	NC_015966	CAG	2	6	2190196	2190201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4050	NC_015966	GC	3	6	2190311	2190316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_015966	TCT	2	6	2190332	2190337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_015966	GTG	2	6	2190352	2190357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015966	CG	3	6	2190373	2190378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_015966	GCC	2	6	2190389	2190394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_015966	CGACG	2	10	2190399	2190408	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4056	NC_015966	CTG	2	6	2190502	2190507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_015966	GCC	2	6	2190544	2190549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_015966	TCG	2	6	2190647	2190652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_015966	CAA	2	6	2190690	2190695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015966	ATGGT	2	10	2190703	2190712	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015966	GAT	2	6	2190728	2190733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015966	GAA	2	6	2190816	2190821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015966	GTG	2	6	2190831	2190836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015966	CGA	2	6	2190854	2190859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_015966	GGT	3	9	2190887	2190895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015966	ACG	2	6	2190955	2190960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4068	NC_015966	CGA	2	6	2191055	2191060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015966	AGC	2	6	2191122	2191127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_015966	G	6	6	2191162	2191167	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015966	TGT	2	6	2191174	2191179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015966	CAT	2	6	2191191	2191196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4074	NC_015966	TCCTG	2	10	2191288	2191297	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4075	NC_015966	GCA	2	6	2191300	2191305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_015966	CTTT	2	8	2191371	2191378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_015966	T	6	6	2194840	2194845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015966	ACG	2	6	2194909	2194914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4081	NC_015966	AATTT	2	10	2199841	2199850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015966	AAT	2	6	2199854	2199859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015966	CTC	2	6	2199889	2199894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_015966	TTG	2	6	2199936	2199941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_015966	GCC	2	6	2202788	2202793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4090	NC_015966	CTG	2	6	2203760	2203765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4092	NC_015966	CAA	2	6	2203820	2203825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_015966	GCCG	2	8	2203879	2203886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_015966	CATC	2	8	2203899	2203906	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_015966	A	6	6	2205046	2205051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015966	CGG	2	6	2205131	2205136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_015966	CTGT	2	8	2205253	2205260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_015966	CAT	2	6	2205292	2205297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_015966	CAA	2	6	2205332	2205337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_015966	T	7	7	2209509	2209515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015966	CCT	2	6	2209535	2209540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_015966	GTC	3	9	2210788	2210796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4104	NC_015966	GGC	2	6	2212841	2212846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_015966	GCC	2	6	2212875	2212880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_015966	GCA	2	6	2212972	2212977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4109	NC_015966	GGGC	2	8	2213065	2213072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_015966	CGT	2	6	2213122	2213127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_015966	TCT	2	6	2213137	2213142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_015966	GCG	2	6	2213174	2213179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015966	CTC	3	9	2213228	2213236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_015966	ACGA	2	8	2213284	2213291	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_015966	GTA	2	6	2213354	2213359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4118	NC_015966	GAT	2	6	2213456	2213461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015966	GCC	2	6	2213507	2213512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_015966	ACCC	2	8	2213518	2213525	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4121	NC_015966	CGG	2	6	2213568	2213573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_015966	GGC	2	6	2213625	2213630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015966	GCG	2	6	2213652	2213657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_015966	GGT	2	6	2213659	2213664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015966	CA	3	6	2213691	2213696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_015966	GAA	2	6	2213701	2213706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_015966	CCGG	2	8	2213725	2213732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_015966	CCA	2	6	2213749	2213754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_015966	ACC	2	6	2213792	2213797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_015966	GGC	2	6	2213823	2213828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_015966	CACCTG	2	12	2213845	2213856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_015966	GCA	2	6	2213859	2213864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_015966	CGC	2	6	2213868	2213873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_015966	GCA	2	6	2213892	2213897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_015966	GGC	2	6	2213915	2213920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4136	NC_015966	GGTT	2	8	2215277	2215284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_015966	GGC	2	6	2215359	2215364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_015966	A	6	6	2215369	2215374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_015966	CGT	2	6	2215483	2215488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_015966	CGA	2	6	2215493	2215498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4142	NC_015966	GGC	2	6	2218810	2218815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_015966	TCC	2	6	2218857	2218862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4151	NC_015966	C	6	6	2227715	2227720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4152	NC_015966	CAA	2	6	2227725	2227730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4156	NC_015966	A	6	6	2228484	2228489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_015966	CCG	2	6	2232394	2232399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4164	NC_015966	CGAA	2	8	2232921	2232928	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4170	NC_015966	CCG	2	6	2233232	2233237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4182	NC_015966	CGC	2	6	2233930	2233935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4241	NC_015966	GAG	2	6	2239040	2239045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_015966	GCC	2	6	2239994	2239999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4243	NC_015966	CTTTT	2	10	2240042	2240051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4244	NC_015966	CAG	2	6	2244046	2244051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4246	NC_015966	CGG	2	6	2246932	2246937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4247	NC_015966	AGG	2	6	2246977	2246982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_015966	GTC	2	6	2246983	2246988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_015966	CGT	2	6	2247096	2247101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_015966	CTC	2	6	2248242	2248247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4251	NC_015966	CG	3	6	2248260	2248265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4252	NC_015966	TTG	2	6	2248320	2248325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_015966	TGC	2	6	2248336	2248341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NC_015966	GCG	2	6	2248368	2248373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_015966	T	10	10	2248970	2248979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_015966	TGG	2	6	2249005	2249010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_015966	TGG	2	6	2249039	2249044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_015966	CGT	2	6	2249089	2249094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_015966	GCC	2	6	2249169	2249174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4260	NC_015966	GCCGT	2	10	2254675	2254684	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4261	NC_015966	ACG	2	6	2254720	2254725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_015966	CCG	2	6	2254743	2254748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_015966	CGC	2	6	2254749	2254754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4264	NC_015966	GCA	2	6	2256769	2256774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_015966	AAG	2	6	2256891	2256896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_015966	ATA	2	6	2258676	2258681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_015966	GCC	3	9	2259969	2259977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4269	NC_015966	TCC	2	6	2259990	2259995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4270	NC_015966	GGA	2	6	2260001	2260006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_015966	AGC	2	6	2260017	2260022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4272	NC_015966	C	6	6	2260144	2260149	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4273	NC_015966	A	6	6	2260188	2260193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_015966	TGC	2	6	2260194	2260199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4275	NC_015966	CAGCG	2	10	2260310	2260319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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4280	NC_015966	TCG	2	6	2260481	2260486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4282	NC_015966	GCC	2	6	2260510	2260515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4285	NC_015966	CCG	2	6	2261972	2261977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4288	NC_015966	CAAG	2	8	2263557	2263564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4289	NC_015966	C	6	6	2263607	2263612	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4290	NC_015966	AAG	2	6	2263679	2263684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4292	NC_015966	T	7	7	2263725	2263731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4293	NC_015966	CTG	2	6	2263742	2263747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4294	NC_015966	T	6	6	2263779	2263784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4295	NC_015966	GCT	2	6	2263942	2263947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4298	NC_015966	AAG	2	6	2268774	2268779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4301	NC_015966	CGC	2	6	2269041	2269046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4324	NC_015966	GCCT	2	8	2276920	2276927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4374	NC_015966	ATT	2	6	2279118	2279123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4376	NC_015966	ACA	2	6	2279159	2279164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4379	NC_015966	GC	3	6	2279819	2279824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4380	NC_015966	TCGCAA	2	12	2279872	2279883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4382	NC_015966	ACG	2	6	2279945	2279950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4384	NC_015966	CGC	2	6	2279964	2279969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4385	NC_015966	GCTTC	2	10	2280451	2280460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4386	NC_015966	GTA	2	6	2280493	2280498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4388	NC_015966	GAC	2	6	2280638	2280643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4389	NC_015966	GCG	2	6	2280670	2280675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_015966	CG	3	6	2280674	2280679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4500	NC_015966	GC	3	6	2291800	2291805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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