MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 6365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015966	CAC	2	6	1865500	1865505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_015966	CT	3	6	1865516	1865521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_015966	AT	3	6	1865532	1865537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_015966	CG	3	6	1865583	1865588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_015966	C	6	6	1865631	1865636	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3506	NC_015966	CAG	2	6	1865645	1865650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_015966	T	7	7	1865683	1865689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_015966	GGTT	2	8	1866996	1867003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_015966	GCCC	2	8	1867060	1867067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3510	NC_015966	CT	3	6	1867092	1867097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_015966	CTT	2	6	1867150	1867155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_015966	GCC	2	6	1869001	1869006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_015966	CCGTT	2	10	1870987	1870996	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3514	NC_015966	TTCT	2	8	1871004	1871011	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_015966	GAAC	2	8	1871487	1871494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_015966	CCG	2	6	1875413	1875418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_015966	GACA	2	8	1875529	1875536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_015966	CGG	2	6	1875537	1875542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_015966	AAG	2	6	1875602	1875607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_015966	TGT	2	6	1875622	1875627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_015966	CAT	2	6	1875635	1875640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_015966	AACGA	2	10	1875689	1875698	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3523	NC_015966	C	6	6	1882030	1882035	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3524	NC_015966	GC	3	6	1882059	1882064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_015966	TAC	2	6	1882074	1882079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_015966	GCG	2	6	1882118	1882123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_015966	CCG	2	6	1882208	1882213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_015966	CGG	2	6	1882222	1882227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_015966	GC	3	6	1886194	1886199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_015966	GAT	2	6	1886229	1886234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_015966	GGCG	2	8	1889791	1889798	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_015966	GCCG	2	8	1889818	1889825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_015966	G	6	6	1889834	1889839	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015966	AAG	2	6	1889882	1889887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_015966	CCG	2	6	1889925	1889930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_015966	A	7	7	1889946	1889952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_015966	AAC	2	6	1892175	1892180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_015966	CGG	2	6	1892412	1892417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_015966	TTTC	2	8	1893629	1893636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_015966	ACT	2	6	1894824	1894829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_015966	TAC	2	6	1895878	1895883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_015966	TGA	2	6	1895900	1895905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015966	CAG	2	6	1895907	1895912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_015966	AT	3	6	1895914	1895919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_015966	CGT	2	6	1909619	1909624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_015966	CAA	2	6	1909643	1909648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_015966	TAC	2	6	1909652	1909657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3549	NC_015966	TTCTA	2	10	1909697	1909706	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_015966	GAT	2	6	1910671	1910676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_015966	CGAAG	2	10	1910812	1910821	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3552	NC_015966	TAC	2	6	1910862	1910867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_015966	A	7	7	1910923	1910929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015966	CGG	2	6	1910935	1910940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3557	NC_015966	GGTA	2	8	1917204	1917211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_015966	AGT	2	6	1917221	1917226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3560	NC_015966	CTG	2	6	1917399	1917404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_015966	CGG	2	6	1917458	1917463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_015966	CCG	2	6	1917536	1917541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3563	NC_015966	CCA	2	6	1917610	1917615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_015966	AAT	2	6	1917621	1917626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_015966	ACG	2	6	1917633	1917638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_015966	GTA	2	6	1917678	1917683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015966	TTC	2	6	1920550	1920555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_015966	CCGG	2	8	1920619	1920626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3570	NC_015966	AGGA	2	8	1920683	1920690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_015966	CGGA	2	8	1920734	1920741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_015966	ATG	2	6	1927734	1927739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3575	NC_015966	CGCA	2	8	1934834	1934841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_015966	CGTT	2	8	1939989	1939996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3577	NC_015966	TCAG	2	8	1940017	1940024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3583	NC_015966	CG	3	6	1941101	1941106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_015966	ATG	2	6	1941120	1941125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3586	NC_015966	T	6	6	1941873	1941878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3589	NC_015966	AAT	2	6	1943879	1943884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_015966	CG	3	6	1943898	1943903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_015966	CTC	2	6	1943914	1943919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_015966	A	6	6	1943988	1943993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3596	NC_015966	CGG	2	6	1944704	1944709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3599	NC_015966	GCT	2	6	1944782	1944787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_015966	ACG	2	6	1944831	1944836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_015966	CCCG	2	8	1944847	1944854	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3602	NC_015966	CAG	3	9	1944861	1944869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_015966	CAC	2	6	1944876	1944881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3607	NC_015966	T	7	7	1950035	1950041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_015966	GCA	2	6	1950053	1950058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3610	NC_015966	GAAAA	2	10	1955855	1955864	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_015966	CAAA	2	8	1956712	1956719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_015966	GGC	2	6	1956722	1956727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3614	NC_015966	T	6	6	1959010	1959015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_015966	CCT	2	6	1962331	1962336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3619	NC_015966	ACA	2	6	1962426	1962431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_015966	CGAT	2	8	1963774	1963781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_015966	ATG	2	6	1963792	1963797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3624	NC_015966	TAC	2	6	1964101	1964106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_015966	AC	3	6	1964122	1964127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_015966	CCG	2	6	1964365	1964370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_015966	GCT	2	6	1964437	1964442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3629	NC_015966	TGA	2	6	1964492	1964497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3631	NC_015966	GAA	2	6	1964531	1964536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3636	NC_015966	CCG	2	6	1970538	1970543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3755	NC_015966	GGCC	2	8	2034422	2034429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3759	NC_015966	GTTT	2	8	2037170	2037177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3760	NC_015966	AC	3	6	2037191	2037196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3762	NC_015966	CAA	2	6	2037251	2037256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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