MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus SG0.5JP17-172 chromosome

Total Repeats: 6365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015966	TCCC	2	8	2291837	2291844	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4502	NC_015966	CGGC	2	8	2291883	2291890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_015966	T	6	6	2291950	2291955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015966	T	6	6	2291992	2291997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_015966	T	6	6	2293222	2293227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_015966	TTC	2	6	2293239	2293244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_015966	CAA	2	6	2293303	2293308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_015966	CTT	2	6	2300721	2300726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_015966	A	7	7	2300738	2300744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015966	T	8	8	2300768	2300775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015966	TAA	2	6	2300801	2300806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015966	CAC	2	6	2300918	2300923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_015966	TGT	2	6	2301421	2301426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015966	A	6	6	2301491	2301496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015966	TGC	2	6	2301503	2301508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_015966	TCC	2	6	2305437	2305442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_015966	TGC	2	6	2305450	2305455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_015966	CGAT	2	8	2305490	2305497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4519	NC_015966	CGGC	2	8	2305499	2305506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_015966	GGC	3	9	2305897	2305905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_015966	A	6	6	2306990	2306995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_015966	TGCG	2	8	2307507	2307514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_015966	TTA	2	6	2307546	2307551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015966	CAAAA	2	10	2307569	2307578	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4525	NC_015966	CAT	2	6	2307587	2307592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_015966	CAA	2	6	2309917	2309922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_015966	A	7	7	2309921	2309927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015966	GTCT	2	8	2311637	2311644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_015966	ATCG	2	8	2311653	2311660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4530	NC_015966	CCAT	2	8	2311691	2311698	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_015966	CGC	2	6	2311708	2311713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_015966	TGC	2	6	2312820	2312825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_015966	TCA	2	6	2313380	2313385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_015966	TGGGC	2	10	2315799	2315808	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4535	NC_015966	TGC	2	6	2316300	2316305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_015966	CGGA	2	8	2317578	2317585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_015966	ATTC	2	8	2319473	2319480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_015966	GC	3	6	2319492	2319497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_015966	GCG	2	6	2319887	2319892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_015966	CTTT	2	8	2320568	2320575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_015966	CGCTT	2	10	2321297	2321306	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4542	NC_015966	CGC	3	9	2322123	2322131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_015966	CGT	2	6	2322818	2322823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_015966	TCG	2	6	2323660	2323665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_015966	CCG	2	6	2323709	2323714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_015966	GTCTC	2	10	2324028	2324037	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4547	NC_015966	CA	3	6	2325365	2325370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_015966	GCC	2	6	2325389	2325394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_015966	GGTT	2	8	2325760	2325767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015966	TCT	2	6	2329142	2329147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_015966	GTT	2	6	2330100	2330105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_015966	AGC	2	6	2330120	2330125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_015966	CCA	2	6	2330175	2330180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_015966	TA	3	6	2330245	2330250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015966	TCT	2	6	2332416	2332421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015966	CCG	2	6	2332473	2332478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_015966	CG	3	6	2335366	2335371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_015966	CGG	2	6	2335385	2335390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_015966	CCT	2	6	2335436	2335441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4561	NC_015966	GCC	2	6	2337788	2337793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_015966	CGTT	2	8	2338966	2338973	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4563	NC_015966	CTT	2	6	2339007	2339012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_015966	A	8	8	2339034	2339041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015966	TGC	2	6	2339080	2339085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_015966	CAG	2	6	2339098	2339103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_015966	GCT	2	6	2339104	2339109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_015966	CTGT	2	8	2339113	2339120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_015966	C	6	6	2339169	2339174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4570	NC_015966	GAG	2	6	2339221	2339226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015966	TGG	2	6	2339429	2339434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_015966	GCA	2	6	2339784	2339789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_015966	T	6	6	2339821	2339826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015966	CGG	2	6	2339848	2339853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_015966	TTC	2	6	2343368	2343373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_015966	CCTG	2	8	2343386	2343393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_015966	A	6	6	2344845	2344850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015966	TTCTT	2	10	2344868	2344877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4579	NC_015966	ATA	2	6	2344933	2344938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015966	AAAC	2	8	2344953	2344960	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4581	NC_015966	GAAA	2	8	2344996	2345003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015966	TTCA	2	8	2345010	2345017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_015966	T	6	6	2345068	2345073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_015966	CA	3	6	2345080	2345085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4585	NC_015966	AGAA	2	8	2345116	2345123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_015966	AG	3	6	2345135	2345140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_015966	AAT	2	6	2345141	2345146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_015966	ACAGA	2	10	2345150	2345159	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4589	NC_015966	CAA	3	9	2345217	2345225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_015966	A	7	7	2345273	2345279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_015966	A	7	7	2345289	2345295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015966	A	8	8	2345302	2345309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_015966	TCC	2	6	2345314	2345319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_015966	AAAC	2	8	2345333	2345340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_015966	ACC	2	6	2345380	2345385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_015966	ACAT	2	8	2345416	2345423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_015966	A	6	6	2345583	2345588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_015966	ATA	2	6	2345601	2345606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_015966	AGC	2	6	2345614	2345619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_015966	TAT	2	6	2345625	2345630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_015966	ATC	2	6	2345635	2345640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_015966	TCA	2	6	2345650	2345655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_015966	CCA	2	6	2346512	2346517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_015966	GC	3	6	2346589	2346594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_015966	A	6	6	2346598	2346603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_015966	GAACAT	2	12	2346605	2346616	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4607	NC_015966	GCC	2	6	2346628	2346633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_015966	GCCA	2	8	2346663	2346670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_015966	CCGC	2	8	2346749	2346756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4610	NC_015966	ACA	2	6	2346769	2346774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_015966	TTC	2	6	2346788	2346793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_015966	GCC	2	6	2346817	2346822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_015966	TTCA	2	8	2346824	2346831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4614	NC_015966	AGCA	2	8	2346881	2346888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4615	NC_015966	TTCA	2	8	2346936	2346943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4616	NC_015966	CAG	2	6	2346983	2346988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_015966	ATC	2	6	2347050	2347055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_015966	TA	3	6	2347088	2347093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_015966	AAAT	2	8	2347125	2347132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015966	GC	3	6	2349634	2349639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_015966	A	6	6	2349692	2349697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_015966	CCA	2	6	2349715	2349720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_015966	C	6	6	2350389	2350394	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4624	NC_015966	AAGC	2	8	2350434	2350441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4625	NC_015966	GGA	2	6	2350443	2350448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015966	T	6	6	2353054	2353059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_015966	GCA	2	6	2353136	2353141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_015966	CAG	2	6	2354591	2354596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_015966	GTT	2	6	2355764	2355769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_015966	GCG	2	6	2355781	2355786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_015966	TTC	2	6	2356653	2356658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_015966	TAA	2	6	2356690	2356695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_015966	GCA	2	6	2359490	2359495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_015966	AGGAA	2	10	2359541	2359550	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_015966	TCCG	2	8	2360110	2360117	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4636	NC_015966	GTTC	2	8	2360118	2360125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4649	NC_015966	T	6	6	2366112	2366117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4650	NC_015966	CAT	2	6	2366132	2366137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4652	NC_015966	TAA	2	6	2366243	2366248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4663	NC_015966	CAA	2	6	2366707	2366712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4664	NC_015966	ATCGA	2	10	2366737	2366746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4666	NC_015966	CAA	2	6	2366870	2366875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4667	NC_015966	GCGG	2	8	2366960	2366967	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4702	NC_015966	TCGA	2	8	2381186	2381193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4715	NC_015966	CATC	2	8	2386284	2386291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4740	NC_015966	T	6	6	2417264	2417269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4745	NC_015966	CTC	2	6	2418976	2418981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4753	NC_015966	T	6	6	2421385	2421390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_015966	CGC	2	6	2421398	2421403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4756	NC_015966	CTGG	2	8	2422351	2422358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4757	NC_015966	CGA	2	6	2422408	2422413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4758	NC_015966	GC	3	6	2431014	2431019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4759	NC_015966	CGT	2	6	2431104	2431109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4760	NC_015966	CCG	2	6	2435841	2435846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4761	NC_015966	AAT	2	6	2435868	2435873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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