MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia heilongjiangensis 054 chromosome

Total Repeats: 8033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015866	GAAA	2	8	279816	279823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015866	TAT	2	6	279826	279831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015866	TAT	2	6	279837	279842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015866	GTT	2	6	282606	282611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015866	AGT	2	6	282678	282683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015866	GAG	2	6	282690	282695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015866	TTG	2	6	282699	282704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015866	CAA	2	6	282777	282782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_015866	CCT	2	6	282785	282790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_015866	TTA	2	6	282806	282811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015866	CAA	2	6	282866	282871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_015866	TC	3	6	282879	282884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_015866	AAC	2	6	282888	282893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_015866	T	7	7	282937	282943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015866	ACT	2	6	282944	282949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_015866	TCTT	2	8	282984	282991	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_015866	ATT	3	9	283022	283030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015866	TGT	2	6	283043	283048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015866	TAT	2	6	283074	283079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015866	TA	3	6	283313	283318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015866	TTG	2	6	283862	283867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015866	TAA	2	6	284233	284238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015866	ATT	3	9	284428	284436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015866	T	6	6	284435	284440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015866	GAA	2	6	284443	284448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015866	T	6	6	284457	284462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015866	TG	3	6	284518	284523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015866	AT	3	6	284531	284536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015866	TAA	2	6	284540	284545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015866	ATT	2	6	284978	284983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015866	CCT	2	6	284984	284989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_015866	TTAT	2	8	285006	285013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015866	TAT	2	6	285037	285042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015866	ATT	2	6	285055	285060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015866	ATT	2	6	285071	285076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015866	TAT	2	6	285092	285097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015866	CTTT	2	8	285127	285134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_015866	TAAAA	2	10	285160	285169	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015866	ATT	2	6	285182	285187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015866	TAT	3	9	286627	286635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015866	A	6	6	286646	286651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015866	TAG	2	6	286746	286751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015866	ATG	2	6	286752	286757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015866	T	6	6	286796	286801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015866	CT	3	6	287231	287236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_015866	TAAAAT	2	12	287246	287257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015866	ATC	2	6	287303	287308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_015866	ATA	2	6	287381	287386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015866	AAT	2	6	287415	287420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015866	AATT	2	8	287426	287433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015866	GTAA	2	8	287466	287473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015866	ATA	2	6	287476	287481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015866	TGG	2	6	287490	287495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015866	TTA	2	6	287605	287610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015866	GGA	2	6	287676	287681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015866	TAG	2	6	287705	287710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015866	A	7	7	287744	287750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015866	ACA	2	6	287759	287764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_015866	ACC	2	6	287865	287870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_015866	CT	3	6	287886	287891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_015866	TTAG	2	8	288114	288121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015866	ACT	2	6	288200	288205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_015866	TCAA	2	8	288365	288372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_015866	CAGA	2	8	288401	288408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_015866	AGA	2	6	288498	288503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015866	AAC	2	6	288508	288513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015866	AGC	2	6	288531	288536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_015866	CAT	2	6	288537	288542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_015866	AAAG	2	8	288545	288552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015866	CAA	2	6	288590	288595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_015866	CCTGAA	2	12	288864	288875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_015866	GATT	2	8	288913	288920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015866	GA	3	6	289013	289018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015866	GAA	2	6	289060	289065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015866	TTA	2	6	289125	289130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_015866	TGG	2	6	289572	289577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015866	GC	3	6	289619	289624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_015866	GGT	2	6	289736	289741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015866	TGA	2	6	289797	289802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015866	CGA	2	6	289820	289825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_015866	TCA	2	6	289851	289856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_015866	CGT	2	6	289931	289936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_015866	TGG	2	6	290024	290029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015866	CTG	2	6	290082	290087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_015866	CCTC	2	8	290107	290114	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1591	NC_015866	ACC	2	6	290147	290152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_015866	TG	3	6	290185	290190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015866	GATT	2	8	290214	290221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015866	GTA	2	6	290271	290276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_015866	GTA	2	6	290398	290403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015866	GATAT	2	10	290412	290421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015866	T	8	8	290428	290435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_015866	ATCT	2	8	290473	290480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_015866	TGG	2	6	290505	290510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015866	AC	3	6	290527	290532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_015866	ATCCC	2	10	290534	290543	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1605	NC_015866	TGCAA	2	10	290619	290628	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1606	NC_015866	TTCT	2	8	290643	290650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_015866	A	8	8	290707	290714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015866	ATTT	2	8	290724	290731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015866	TAAT	2	8	290753	290760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015866	AAG	2	6	290780	290785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015866	A	7	7	290838	290844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015866	TAA	2	6	290853	290858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015866	TCT	2	6	290902	290907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1615	NC_015866	ATTA	2	8	290952	290959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015866	TAA	2	6	291000	291005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015866	ATA	2	6	291040	291045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1621	NC_015866	GCCTTT	2	12	291159	291170	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_015866	A	7	7	291177	291183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015866	TTA	2	6	291200	291205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_015866	AT	4	8	291232	291239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015866	A	6	6	291293	291298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015866	AT	3	6	291322	291327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015866	TAA	2	6	291366	291371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_015866	ATA	2	6	291379	291384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015866	AGT	2	6	291441	291446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015866	TA	3	6	291502	291507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015866	ATT	2	6	291515	291520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_015866	ACA	2	6	291541	291546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_015866	AGA	2	6	291558	291563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_015866	AGT	2	6	372908	372913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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