MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseobacter litoralis Och 149 plasmid pRLO149_63

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015729	CCTG	2	8	1589	1596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015729	ATTT	2	8	2752	2759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015729	GAAA	2	8	3923	3930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015729	CGGA	2	8	9156	9163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015729	GCTC	2	8	9335	9342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015729	CTTA	2	8	9547	9554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015729	AGGT	2	8	10426	10433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015729	GTGA	2	8	11740	11747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015729	AGGA	2	8	12281	12288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015729	AAAG	2	8	12301	12308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015729	TTTC	2	8	12541	12548	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015729	ACCT	2	8	12822	12829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015729	GCCA	2	8	23562	23569	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015729	CAGG	2	8	23714	23721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015729	TGGT	2	8	23746	23753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015729	CATG	2	8	23900	23907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015729	CCTT	2	8	24742	24749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015729	CACC	2	8	24861	24868	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_015729	GATC	2	8	27081	27088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015729	CTGC	2	8	27106	27113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015729	TGTT	2	8	27476	27483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015729	GGCA	2	8	27816	27823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015729	GACC	2	8	28060	28067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015729	CCGC	2	8	28453	28460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015729	GACC	2	8	29266	29273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015729	TCAA	2	8	30165	30172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015729	TGCT	2	8	30315	30322	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015729	GTCG	2	8	31572	31579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015729	ATAA	2	8	32739	32746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015729	CTGT	2	8	37153	37160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015729	AGAT	2	8	41530	41537	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015729	GACA	2	8	47552	47559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015729	GAAT	2	8	50550	50557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.