MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	TTA	2	6	14	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015694	TGA	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015694	ATA	2	6	216	221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015694	ATA	2	6	225	230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015694	AAT	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015694	AGT	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015694	AAG	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015694	GGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015694	ATT	2	6	3290	3295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015694	GAA	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015694	TTA	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015694	AAT	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015694	AAT	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015694	CAC	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015694	GAT	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015694	GCA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015694	CAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015694	ATA	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015694	AAT	2	6	6464	6469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015694	TCA	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015694	TAA	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015694	TAT	3	9	6648	6656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015694	TTG	2	6	7821	7826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015694	TTA	2	6	7975	7980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015694	CCT	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015694	ATT	2	6	8119	8124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015694	TTA	2	6	8143	8148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015694	CCA	2	6	8158	8163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015694	ATA	2	6	8181	8186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015694	CCT	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015694	GTT	2	6	8929	8934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015694	ATG	2	6	8972	8977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015694	AGC	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015694	GTC	2	6	9251	9256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015694	CAA	2	6	9324	9329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015694	TTA	2	6	10145	10150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015694	GTT	2	6	10301	10306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015694	AAT	2	6	14494	14499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015694	TGA	2	6	14522	14527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015694	TTA	2	6	14550	14555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015694	TTC	2	6	18565	18570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015694	TGA	2	6	24908	24913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015694	TCA	2	6	24930	24935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015694	GTT	2	6	25616	25621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015694	AAC	2	6	25655	25660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015694	CTT	2	6	26326	26331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015694	TTA	2	6	26332	26337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015694	CTG	2	6	26345	26350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015694	GCC	2	6	26406	26411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015694	TTC	2	6	26457	26462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015694	CTG	2	6	26491	26496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015694	GGT	2	6	26507	26512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015694	TAA	3	9	26523	26531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015694	AGC	2	6	27375	27380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015694	ATT	2	6	27547	27552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015694	TAA	2	6	28046	28051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015694	ATG	2	6	28096	28101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015694	GAA	2	6	28142	28147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015694	CAA	2	6	30880	30885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015694	TTA	2	6	32610	32615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015694	ATT	2	6	32706	32711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015694	GTT	2	6	32742	32747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015694	GCT	2	6	32805	32810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015694	TAG	2	6	32842	32847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015694	GTA	2	6	32877	32882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015694	CTA	2	6	32937	32942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015694	AAG	2	6	33024	33029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015694	CTT	2	6	33091	33096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015694	TAG	2	6	33187	33192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015694	ATA	2	6	33202	33207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015694	ACT	2	6	33216	33221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015694	TAG	2	6	33254	33259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015694	TTG	2	6	33540	33545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015694	TTC	2	6	33593	33598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015694	ATT	2	6	33618	33623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015694	CAC	2	6	33679	33684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015694	TAT	2	6	37636	37641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015694	ATT	2	6	37651	37656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015694	TAT	2	6	37731	37736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015694	TGT	2	6	37839	37844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015694	TTG	2	6	43081	43086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015694	GGA	2	6	43110	43115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015694	TCG	2	6	43134	43139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015694	CAA	2	6	43140	43145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015694	GAT	2	6	43975	43980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015694	TGG	2	6	44056	44061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015694	GCC	2	6	44106	44111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015694	AGA	2	6	44208	44213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015694	TTG	2	6	44217	44222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015694	TGA	2	6	44318	44323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015694	TAC	2	6	46548	46553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015694	CTG	2	6	46568	46573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015694	GCT	2	6	46596	46601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015694	CTT	2	6	46619	46624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015694	GGT	2	6	46786	46791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015694	AAG	2	6	52164	52169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015694	AAG	2	6	52230	52235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015694	TTG	2	6	52297	52302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015694	AAT	2	6	52336	52341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015694	GTT	2	6	61200	61205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015694	ATT	2	6	62427	62432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015694	GCC	2	6	62560	62565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015694	AGC	2	6	62599	62604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015694	TGT	2	6	63034	63039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015694	TAC	2	6	63132	63137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015694	GTA	2	6	64015	64020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015694	TAC	2	6	64099	64104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015694	AAT	2	6	65186	65191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015694	GAT	2	6	65227	65232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015694	GCG	2	6	65359	65364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015694	GAT	2	6	65393	65398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015694	ATT	2	6	65533	65538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015694	ACG	2	6	65633	65638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015694	CTG	2	6	65912	65917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015694	ATT	2	6	66907	66912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.