MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL01

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015693	TATT	2	8	2843	2850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015693	GTTT	2	8	3089	3096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015693	CCGT	2	8	3116	3123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015693	AATT	2	8	4540	4547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015693	AAGA	2	8	4679	4686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015693	CTAT	2	8	4717	4724	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015693	ACTT	2	8	4742	4749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015693	ATTC	2	8	4971	4978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015693	TCAT	2	8	5683	5690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015693	AACA	2	8	6000	6007	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015693	TTAT	2	8	8836	8843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015693	GAAG	2	8	13233	13240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015693	TTTC	2	8	15430	15437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015693	TCAT	2	8	32397	32404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015693	ATGA	2	8	32423	32430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015693	ACAA	2	8	33950	33957	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015693	ACCC	2	8	37416	37423	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015693	GGTT	2	8	41679	41686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015693	TTAT	2	8	42462	42469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015693	ATTT	2	8	58645	58652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015693	AAAT	2	8	59442	59449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015693	CAAA	2	8	59706	59713	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015693	ATTT	2	8	63782	63789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015693	TATT	2	8	64080	64087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015693	CAGT	2	8	64136	64143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015693	TAAA	2	8	64349	64356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015693	TCCA	2	8	65899	65906	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015693	GCCT	2	8	66097	66104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015693	TTCC	2	8	66146	66153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015693	CAGT	3	12	66337	66348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015693	GACT	2	8	66403	66410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015693	ATTC	2	8	70649	70656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015693	CCGG	2	8	70779	70786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015693	TCAT	2	8	73472	73479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015693	TTCC	2	8	74482	74489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015693	AGGC	2	8	75815	75822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015693	CCGA	2	8	79155	79162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015693	GTTG	2	8	79979	79986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015693	GAAA	2	8	82900	82907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015693	AAAT	2	8	90213	90220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015693	TGCC	2	8	90417	90424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015693	CAAA	2	8	90425	90432	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015693	ATGA	2	8	91645	91652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015693	TAAC	2	8	91662	91669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015693	ACTT	2	8	95172	95179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015693	ATTT	2	8	102902	102909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.